Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14891
• Subject: NM_008847.3
• Aligned Length: 1644
• Identities: 1303
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGGCCTCCTCCGGGCCGTCGTCTTCGGTCGGTTTTTCATCCTTTGATCCCGCGGTCCCTTCCTGTAC  74
            ||||||||.||||||||.|||||..||   .|||.|||.|||||||||.|||||.|||.||.||||.|..||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCGCCTCCTCAGGGCCAGCG---GCGGCCGGGTTTTCATCCCTTGATGCCGGGGCCCCTGCTGGTAC  71

Query   75  CTTGTCCTCAGCATCTGGAATCAAGAGACCCATGGCATCTGAGGTGCCTTATGCCTCTGGCATGCCCATCAAGA  148
            |   .|..||||||||||||||||||||.|||..|.||||||||..||||..|||||||.||||||..|.||.|
Sbjct   72  C---GCAGCAGCATCTGGAATCAAGAGAGCCACAGTATCTGAGGGACCTTCCGCCTCTGTCATGCCTGTTAAAA  142

Query  149  AAATAGGCCATAGAAGTGTTGATTCCTCAGGAGAGACAACATATAAAAAGACAACCTCATCAGCCTTGAAAGGT  222
            |||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  143  AAATAGGCCATCGAAGTGTTGATTCCTCTGGAGAGACTACATACAAGAAGACAACTTCATCAGCCTTGAAAGGT  216

Query  223  GCCATCCAGTTAGGCATTACCCACACTGTGGGGAGCCTGAGTACCAAACCAGAGCGTGATGTCCTCATGCAAGA  296
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  GCCATCCAGTTAGGCATCACTCACACTGTGGGCAGCCTGAGCACCAAACCAGAGCGTGATGTCCTCATGCAAGA  290

Query  297  TTTCTACGTGGTTGAGAGTATCTTCTTTCCCAGTGAAGGGAGCAACCTGACCCCTGCTCATCACTACAATGACT  370
            .|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  291  CTTCTACGTGGTGGAGAGCATCTTTTTCCCCAGTGAAGGCAGCAACCTGACACCGGCTCACCATTACAATGACT  364

Query  371  TTCGTTTCAAGACCTATGCACCTGTTGCCTTCCGCTACTTCCGGGAGCTATTTGGTATCCGGCCCGATGATTAC  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  365  TTCGATTCAAGACCTATGCGCCTGTTGCCTTCCGTTACTTCAGAGAGCTCTTTGGCATCCGGCCTGATGATTAC  438

Query  445  TTGTATTCCCTCTGCAGTGAGCCGCTGATTGAACTCTGTAGCTCTGGAGCTAGTGGTTCCCTATTCTATGTGTC  518
            |||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||..|..||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  439  TTGTACTCCCTTTGCAGTGAGCCATTGATTGAACTCTCCAATTCTGGAGCTAGTGGTTCCCTCTTCTATGTGTC  512

Query  519  CAGCGACGATGAGTTCATTATTAAGACAGTCCAACATAAAGAGGCGGAATTTCTGCAGAAGCTGCTTCCAGGAT  592
            |||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  513  CAGTGATGATGAATTCATCATTAAGACCGTCCAGCATAAAGAAGCAGAATTTCTGCAGAAGTTGCTTCCAGGAT  586

Query  593  ACTACATGAACCTCAACCAGAACCCTCGGACTTTGCTGCCTAAATTCTATGGACTGTACTGTGTGCAGGCAGGT  666
            ||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||.
Sbjct  587  ACTACATGAATCTTAACCAAAACCCTCGTACTTTGCTGCCCAAATTTTATGGATTGTACTGTGTGCAAGCAGGC  660

Query  667  GGCAAGAACATTCGGATTGTGGTGATGAACAATCTTTTACCAAGATCGGTAAAAATGCATATCAAATATGACCT  740
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  661  GGCAAGAACATACGAATTGTGGTGATGAACAATCTCTTGCCTCGGTCAGTCAAAATGCATATGAAATATGACCT  734

Query  741  CAAAGGCTCAACCTACAAACGGCGGGCTTCCCAGAAAGAGCGAGAGAAGCCTCTTCCCACATTTAAAGACCTAG  814
            .||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||..||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  735  GAAGGGTTCAACTTACAAGCGGCGGGCTTCTCAGAAAGAACGAGAGAAAACTCTCCCCACCTTTAAAGACCTGG  808

Query  815  ACTTCTTACAAGACATCCCTGATGGTCTTTTTTTGGATGCTGACATGTACAACGCTCTCTGTAAGACCCTGCAG  888
            |||||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.|||
Sbjct  809  ACTTCCTACAAGATATCCCTGACGGCCTATTTTTGGATGCTGACATGTACAGTGCTCTGTGTAAGACTCTACAG  882

Query  889  CGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGATTATAGCCTCTTGATGTCAATCCATAATATAGATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.||
Sbjct  883  CGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGACTACAGCCTGTTGATGTCCATCCACAACATGGACCA  956

Query  963  TGCACAACGAGAGCCCTTAAGCAGTGAAACACAGTACTCAGTTGATACTCGAAGACCGGCCCCCCAAAAGGCTC  1036
            ||||||..|.||||||...||||.|||.|||||||||||.|.|||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  957  TGCACAGAGGGAGCCCACGAGCAATGACACACAGTACTCGGCTGACACGCGCAGACCAGCCCCACAGAAGGCGC  1030

Query 1037  TGTATTCCACAGCCATGGAATCCATCCAGGGAGAGGCTCGACGGGGTGGTACCATGGAGACTGATGACCATATG  1110
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1031  TCTATTCCACAGCTATGGAATCCATCCAGGGCGAGGCTCGACGGGGCGGCACTGTGGAGACTGAGGACCACATG  1104

Query 1111  GGTGGCATCCCTGCCCGGAATAGTAAAGGGGAAAGGCTTCTGCTTTATATTGGCATCATTGACATTCTACAGTC  1184
            ||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1105  GGTGGCATCCCTGCCCGGAATAACAAAGGAGAAAGGCTCCTGCTTTATATTGGCATCATTGATATTCTTCAGTC  1178

Query 1185  TTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCCCTGGTACATGACGGAGACACTGTCTCAGTGCATC  1258
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1179  CTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCACTGGTCCATGATGGGGATACGGTGTCAGTGCATC  1252

Query 1259  GCCCAGGCTTCTACGCTGAACGGTTCCAGCGCTTCATGTGCAACACAGTATTTAAGAAGATTCCCT----GC--  1326
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||    ||  
Sbjct 1253  GTCCAGGCTTCTATGCTGAGCGGTTCCAGCGTTTCATGTGCAACACAGTGTTCAAGAAGATTCCCTTGAAGCCT  1326

Query 1327  --------------------------------------------------------------------------  1326
                                                                                      
Sbjct 1327  TCTCCTACCAAAAAGTTTCGGTCTGGCCCGTCTTTCTCTCGGCGATCAGGCCCCAGCGGCAACTCCTGCACCTC  1400

Query 1327  ----------------------------------------------------------------GTTCACCTTG  1336
                                                                            ||.|||||||
Sbjct 1401  CCAGCTGATGGCCTCTGGGGAACACAGAGCACAAGTGACCACCAAGGCGGAAGTGGAGCCAGATGTACACCTTG  1474

Query 1337  GTCGTCCTGATGTTTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAATCAGTGAGGGCTCGCCTATTCCTGACCCCAGT  1410
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||.||||||.|||||||
Sbjct 1475  GGCGTCCTGATGTCTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAATAAGTGAGGGTTCACCTGTTCCTGGCCCCAGT  1548

Query 1411  TTCTCACCTCTAGTTGGAGAGACTTTGCAAATGCTAACTACAAGTACAACCTTGGAAAAGCTTGAAGTTGCAGA  1484
            |||||||||.||||||||.|..||||||||||.||||.|...|||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1549  TTCTCACCTGTAGTTGGACAACCTTTGCAAATACTAAATTTGAGTTCAACCTTGGAAAAGCTTGATGTTGCAGA  1622

Query 1485  GTCAGAGTTCACCCAT  1500
            |||||||||||||||.
Sbjct 1623  GTCAGAGTTCACCCAC  1638