Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14892
- Subject:
- XM_006526763.3
- Aligned Length:
- 1737
- Identities:
- 1337
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 ATGTCTTCTGCTGCTGAAAATGGAGAGGCAGCACCTGGAAAACAAAATGAAGAAAAAACCTATAAAAAGACACA 74
|||||.||..||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1 ATGTCGTCAACTGCTGAAAATGGAGACGCCGTACCTGGAAAACAAAACGAAGAAAAAACCTACAAAAAG----- 69
Query 75 AGTGAAAAACCAAATCCTGTCTCGTTTACCCAAGATTCCGTGTACATTCATTCAAGCATGGACCAACACAGAGA 148
Sbjct 70 -------------------------------------------------------------------------- 69
Query 149 TGATTACGTTGCTAGCCTGTTATTACTTCAGATCAGTTTCAACTGCATCATCTGCTATTAAAGGTGCTATTCAG 222
||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 70 -----------------------------------------ACGGCATCGTCAGCTATTAAAGGTGCTATCCAG 102
Query 223 CTGGGAATAGGATACACAGTGGGTAATCTCACTTCCAAGCCAGAACGAGATGTTCTTATGCAAGACTTTTATGT 296
|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 103 CTGGGAATAGGATACACAGTGGGCAACCTCACGTCCAAGCCAGAACGCGATGTCCTCATGCAAGACTTCTACGT 176
Query 297 GGTGGAAAGTGTGTTCCTACCCAGCGAAGGGAGCAATCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTTAGATTTA 370
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 177 GGTGGAAAGTGTGTTCCTCCCCAGTGAAGGGAGCAACCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTCAGGTTTA 250
Query 371 AGACATACGCTCCATTAGCATTCCGATATTTCAGAGAACTTTTTGGTATCAAGCCTGATGATTACTTGTATTCC 444
||||.|||||.||..|.||.|||||.||.|||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 251 AGACCTACGCACCGCTGGCCTTCCGGTACTTCCGAGAACTCTTTGGTATCAAGCCCGATGATTACTTGTACTCC 324
Query 445 ATCTGCAGTGAACCTCTAATAGAACTGTCTAACCCTGGAGCCAGTGGATCCTTGTTTTTTGTGACCAGTGATGA 518
|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||
Sbjct 325 ATCTGCAGTGAACCTCTGATAGAACTGTCCAATCCTGGAGCCAGTGGGTCCTTGTTTTTCTTGACCAGCGATGA 398
Query 519 TGAATTTATCATCAAAACAGTTCAGCACAAAGAAGCTGAGTTTCTTCAGAAGCTACTGCCAGGCTATTACATGA 592
||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 399 TGAATTTATCATCAAAACCGTTCAGCATAAGGAAGCCGAGTTCCTGCAGAAGCTGCTGCCGGGCTATTACATGA 472
Query 593 ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTTTGCCAAAATTTTACGGACTGTATTGTATGCAATCAGGAGGCATTAAT 666
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 473 ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTCTGCCAAAATTCTATGGGCTGTATTGCATGCAGTCAGGAGGCATCAAC 546
Query 667 ATCAGGATTGTGGTGATGAACAACGTTTTGCCACGCTCCATGAGAATGCACTTTACATATGACTTGAAAGGCTC 740
|||.|.|||||||||||||||||.||..||||.||..|||||||.|||||.||.||.||||||.||||||||||
Sbjct 547 ATCCGCATTGTGGTGATGAACAATGTCCTGCCGCGTGCCATGAGGATGCATTTGACCTATGACCTGAAAGGCTC 620
Query 741 AACGTATAAGCGAAGAGCATCCCGTAAAGAGAGAGAGAAATCCAACCCCACATTTAAGGACTTAGATTTCCTGC 814
.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||
Sbjct 621 CACATACAAGCGAAGAGCATCCCGAAAAGAGAGGGAGAAACCCAACCCCACGTTTAAGGACCTGGACTTCCTGC 694
Query 815 AAGACATGCACGAAGGGTTGTATTTTGATACGGAAACATACAACGCGCTTATGAAAACACTTCAGAGAGACTGC 888
|.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 695 AGGACATGCACGAGGGGCTGTATTTCGATACAGAAACATACAATGCCCTTATGAAGACACTACAGAGAGACTGC 768
Query 889 CGGGTGCTAGAAAGCTTCAAGATCATGGATTATAGCCTTCTGTTGGGAATTCATTTCCTGGACCATTCCCTCAA 962
|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||.||.||||.||.||..||.||||||||||||||||
Sbjct 769 CGGGTTCTGGAAAGCTTCAAGATCATGGACTACAGCCTTTTGCTGGGTATCCACATCTTGGACCATTCCCTCAA 842
Query 963 AGAGAAAGAGGAGGAGACCCCACAAAATGTGCCTGATGCTAAGCGGACTGGGATGCAGAAGGTTCTCTACTCAA 1036
|||.|||||.||||||.|||..|||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 843 AGACAAAGAAGAGGAGCCCCTCCAAAACGTGCCTGATGCAAAGCGGCCGGGGATGCAGAAAGTCCTCTATTCCA 916
Query 1037 CAGCCATGGAATCTATCCAGGGTCCAGGGAAATCTGGAGATGGGATAATCACAGAGAACCCAGACACAATGGGA 1110
|||||||||||||.||||||||||||||.||.||||.|||||||||.||..|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 917 CAGCCATGGAATCCATCCAGGGTCCAGGCAAGTCTGCAGATGGGATCATTGCAGAGAATCCAGACACAATGGGA 990
Query 1111 GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAGGGGAGAAAAACTACTTTTATTTACGGGCATTATTGACATTCTGCAATCATA 1184
||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.|||.||||.|.|||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 991 GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAAGGGAGAGAAGCTGCTTCTATTCATGGGCATTATTGACATCCTCCAATCATA 1064
Query 1185 TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCTCTTGTTTATGATGGGGACACTGTTTCTGTTCATAGAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1065 TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCCCTTGTTTATGATGGGGACACCGTTTCAGTTCATAGAC 1138
Query 1259 CAAGCTTTTATGCAGACAGATTTCTTAAGTTCATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTTTGAAGGCT 1332
||||.|||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.
Sbjct 1139 CAAGTTTTTATGCAGATAGATTTTTAAAGTTTATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTCTGAAAGCC 1212
Query 1333 TCACCGTCTAAGAAACGGTGCAATTCAATCGCCGCCCTAAAGGCCACTTCACAGGAGATTGTGTCCTCAATTAG 1406
||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1213 TCGCCTTCTAAGAAACGCTGCAACTCCATCGCTGCACTGAAGGCAACCTCCCAGGAGATCGTATCCTCCATCAG 1286
Query 1407 CCAGGAATGGAAGGATGAGAAGCGGGATTTGCTGACTGAAGGACAAAGTTTTAGCAGCCTTGATGAAGAAGCCC 1480
|||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1287 CCAGGAATGGAAGGACGAGAAGCGGGATTTGTTAACCGAAGGACAGAGTTTCAGCAGCCTGGATGAAGAAGCCC 1360
Query 1481 TGGGATCCCGACACAGGCCAGACCTGGTCCCTAGCACTCCATCACTGTTTGAAGCTGCTTCCTTGGCAACCACA 1554
|||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1361 TGGGATCCCGACACAGGCCCGACCTGGTACCCAGCACTCCATCATTATTTGAAGCTGCTTCCTTAGCGACCACA 1434
Query 1555 ATTTCATCTTCTTCCTTATACGTCAATGAGCACTATCCACACGACAGGCCTACACTCTATTCAAACAG------ 1622
||.|||||||||||||||||.|||...||.|||||||||||.||||||.||||.||.||.||||||||
Sbjct 1435 ATATCATCTTCTTCCTTATATGTCGGCGAACACTATCCACATGACAGGACTACCCTTTACTCAAACAGCAAAGG 1508
Query 1623 -----------GTTC--------------AAGATGGCAACAT-----------CAGAGCAT------------- 1647
|||| ||||.||.|.||| |.||||..
Sbjct 1509 GTTACCTTCCAGTTCAACCTTCACCTTGGAAGAGGGGACCATCTACCTGACGGCTGAGCCAAACACCCTGGACC 1582
Query 1648 ----------------------------------- 1647
Sbjct 1583 TGCAGGATGATGCCTCTGTGCTGGACGTCTATTTA 1617