Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14892
- Subject:
- XM_017015189.1
- Aligned Length:
- 1742
- Identities:
- 1520
- Gaps:
- 217
Alignment
Query 1 ATGTCTTCTGCTGCTGAAAATGGAGAGGCAGCACCTGGAAAACAAAATGAAGAAAAAACCTATAAAAAGACACA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTCTGCTGCTGAAAATGGAGAGGCAGCACCTGGAAAACAAAATGAAGAAAAAACCTATAAAAAG----- 69
Query 75 AGTGAAAAACCAAATCCTGTCTCGTTTACCCAAGATTCCGTGTACATTCATTCAAGCATGGACCAACACAGAGA 148
Sbjct 70 -------------------------------------------------------------------------- 69
Query 149 TGATTACGTTGCTAGCCTGTTATTACTTCAGATCAGTTTCAACTGCATCATCTGCTATTAAAGGTGCTATTCAG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 -----------------------------------------ACTGCATCATCTGCTATTAAAGGTGCTATTCAG 102
Query 223 CTGGGAATAGGATACACAGTGGGTAATCTCACTTCCAAGCCAGAACGAGATGTTCTTATGCAAGACTTTTATGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103 CTGGGAATAGGATACACAGTGGGTAATCTCACTTCCAAGCCAGAACGAGATGTTCTTATGCAAGACTTTTATGT 176
Query 297 GGTGGAAAGTGTGTTCCTACCCAGCGAAGGGAGCAATCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTTAGATTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 GGTGGAAAGTGTGTTCCTACCCAGCGAAGGGAGCAATCTGACCCCAGCACATCACTACCCAGACTTTAGATTTA 250
Query 371 AGACATACGCTCCATTAGCATTCCGATATTTCAGAGAACTTTTTGGTATCAAGCCTGATGATTACTTGTATTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 251 AGACATACGCTCCATTAGCATTCCGATATTTCAGAGAACTTTTTGGTATCAAGCCTGATGATTACTTGTATTCC 324
Query 445 ATCTGCAGTGAACCTCTAATAGAACTGTCTAACCCTGGAGCCAGTGGATCCTTGTTTTTTGTGACCAGTGATGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 325 ATCTGCAGTGAACCTCTAATAGAACTGTCTAACCCTGGAGCCAGTGGATCCTTGTTTTTTGTGACCAGTGATGA 398
Query 519 TGAATTTATCATCAAAACAGTTCAGCACAAAGAAGCTGAGTTTCTTCAGAAGCTACTGCCAGGCTATTACATGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 TGAATTTATCATCAAAACAGTTCAGCACAAAGAAGCTGAGTTTCTTCAGAAGCTACTGCCAGGCTATTACATGA 472
Query 593 ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTTTGCCAAAATTTTACGGACTGTATTGTATGCAATCAGGAGGCATTAAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473 ATTTAAACCAGAATCCAAGGACTCTTTTGCCAAAATTTTACGGACTGTATTGTATGCAATCAGGAGGCATTAAT 546
Query 667 ATCAGGATTGTGGTGATGAACAACGTTTTGCCACGCTCCATGAGAATGCACTTTACATATGACTTGAAAGGCTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 ATCAGGATTGTGGTGATGAACAACGTTTTGCCACGCTCCATGAGAATGCACTTTACATATGACTTGAAAGGCTC 620
Query 741 AACGTATAAGCGAAGAGCATCCCGTAAAGAGAGAGAGAAATCCAACCCCACATTTAAGGACTTAGATTTCCTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 AACGTATAAGCGAAGAGCATCCCGTAAAGAGAGAGAGAAATCCAACCCCACATTTAAGGACTTAGATTTCCTGC 694
Query 815 AAGACATGCACGAAGGGTTGTATTTTGATACGGAAACATACAACGCGCTTATGAAAACACTTCAGAGAGACTGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 695 AAGACATGCACGAAGGGTTGTATTTTGATACGGAAACATACAACGCGCTTATGAAAACACTTCAGAGAGACTGC 768
Query 889 CGGGTGCTAGAAAGCTTCAAGATCATGGATTATAGCCTTCTGTTGGGAATTCATTTCCTGGACCATTCCCTCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 CGGGTGCTAGAAAGCTTCAAGATCATGGATTATAGCCTTCTGTTGGGAATTCATTTCCTGGACCATTCCCTCAA 842
Query 963 AGAGAAAGAGGAGGAGACCCCACAAAATGTGCCTGATGCTAAGCGGACTGGGATGCAGAAGGTTCTCTACTCAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 AGAGAAAGAGGAGGAGACCCCACAAAATGTGCCTGATGCTAAGCGGACTGGGATGCAGAAGGTTCTCTACTCAA 916
Query 1037 CAGCCATGGAATCTATCCAGGGTCCAGGGAAATCTGGAGATGGGATAATCACAGAGAACCCAGACACAATGGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 CAGCCATGGAATCTATCCAGGGTCCAGGGAAATCTGGAGATGGGATAATCACAGAGAACCCAGACACAATGGGA 990
Query 1111 GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAGGGGAGAAAAACTACTTTTATTTACGGGCATTATTGACATTCTGCAATCATA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 991 GGCATTCCAGCTAAAAGCCATAGGGGAGAAAAACTACTTTTATTTATGGGCATTATTGACATTCTGCAATCATA 1064
Query 1185 TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCTCTTGTTTATGATGGGGACACTGTTTCTGTTCATAGAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 TAGGTTAATGAAGAAGTTAGAACATTCCTGGAAAGCTCTTGTTTATGATGGGGACACTGTTTCTGTTCATAGAC 1138
Query 1259 CAAGCTTTTATGCAGACAGATTTCTTAAGTTCATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTTTGAAGGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 CAAGCTTTTATGCAGACAGATTTCTTAAGTTCATGAATTCCAGAGTTTTCAAGAAAATTCAAGCTTTGAAGGCT 1212
Query 1333 TCACCGTCTAAGAAACGGTGCAATTCAATCGCCGCCCTAAAGGCCACTTCACAGGAGATTGTGTCCTCAATTAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 TCACCGTCTAAGAAACGGTGCAATTCAATCGCCGCCCTAAAGGCCACTTCACAGGAGATTGTGTCCTCAATTAG 1286
Query 1407 CCAGGAATGGAAGGATGAGAAGCGGGATTTGCTGACTGAAGGACAAAGTTTTAGCAGCCTTGATGAAGAAGCCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287 CCAGGAATGGAAGGATGAGAAGCGGGATTTGCTGACTGAAGGACAAAGTTTTAGCAGCCTTGATGAAGAAGCCC 1360
Query 1481 TGGGATCCCGACACAGGCCAGACCTGGTCCCTAGCACTCCATCACTGTTTGAAGCTGCTTCCTTGGCAACCACA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361 TGGGATCCCGACACAGGCCAGACCTGGTCCCTAGCACTCCATCACTGTTTGAAGCTGCTTCCTTGGCAACCACA 1434
Query 1555 ATTTCATCTTCTTCCTTATACGTCAATGAGCACTATCCACACGACAGGCCTACACTCTATTCAAACAG------ 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 ATTTCATCTTCTTCCTTATACGTCAATGAGCACTATCCACACGACAGGCCTACACTCTATTCAAACAGCAAAGG 1508
Query 1623 -----GTTCAAGATGGCAACAT---------CAGAG-----CAT------------------------------ 1647
.|||.||.| |||||| .|||| |||
Sbjct 1509 GTTACCTTCCAGTT--CAACATTTACCTTGGAAGAGGGGACCATCTACTTGACCGCTGAGCCCAACACTCTGGA 1580
Query 1648 ---------------------------------------- 1647
Sbjct 1581 AGTGCAGGATGACAATGCTTCTGTGCTTGACGTCTATTTA 1620