Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14914
- Subject:
- XM_011537276.1
- Aligned Length:
- 1079
- Identities:
- 742
- Gaps:
- 331
Alignment
Query 1 ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCNGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAANNAAANTNNCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTCGGGA--AATCC---GAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTNCTGGAAGTCTTCAGGA 217
| ||.|| ||.| |||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1 ------ATGAAGCCACAGACT-CTCGCGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGA 67
Query 218 GGAAACGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGA 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 GGAAACGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGA 141
Query 292 GGGGTACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAA 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GGGGTACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAA 215
Query 366 TTGCATACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTG 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 TTGCATACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTG 289
Query 440 GATTTGCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCT 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 GATTTGCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCT 363
Query 514 GAGCTGCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCT 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GAGCTGCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCT 437
Query 588 GCTGTCAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGG 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 GCTGTCAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGG 511
Query 662 ATCTCATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAA 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 ATCTCATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAA 585
Query 736 GATATGGNACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTA-------------- 795
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 GATATGGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGGGCTGTCTCCA 659
Query 796 -------------------------------------------------------------------------- 795
Sbjct 660 CATGGACCCTACTCAAAGGCTGACATGTGAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAG 733
Query 796 -------------------------------------------------------------------------- 795
Sbjct 734 AGGATTTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCCGAAAGCACCACTGCTTTACA 807
Query 796 ---------AAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTA 860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GAAACATCCAAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTA 881
Query 861 CTACTGTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT 903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 CTACTGTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT 924