Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14944
- Subject:
- XM_017025424.2
- Aligned Length:
- 3178
- Identities:
- 3094
- Gaps:
- 73
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG 74
Query 75 GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC 148
Query 149 AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT 222
Query 223 CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCA--- 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGG 296
Query 294 ------------------------------------------------------------AGCGAAAGGGACTC 307
||||||||||||||
Sbjct 297 TAACTGTGTATGTGTGTCAGTGTTCAGTAAAGACAGTGCTGCAGCCTGTTTAATCCTAAGAGCGAAAGGGACTC 370
Query 308 TCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATC 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATC 444
Query 382 ATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTAT 455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTAT 518
Query 456 TCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGAT 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGAT 592
Query 530 CCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGTGGAGCATAGGA 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGTGGAGCATAGGA 666
Query 604 ACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTAAAGATGTTTTA 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 667 ACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTAAGGATGTTTTA 740
Query 678 TGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTATTTGGCTAATCT-CTTTTGGGTT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 741 TGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTATTTGGCTAATCTCCTTTTGGGTT 814
Query 751 TGCTTCAGAGAAACCAAAAAGATAAGAATGGACTTTGAAGC-GTTTTTAGCCATCCTTTTTCTTGAGCAAGGTC 823
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| .||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCTTCAGAGAAACCAAAAAGAT-AGAATGGACTTTGAAGCATTTTTTAGCCATCC-TTTTCTTGAGCAAGGTC 886
Query 824 CAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCT 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCT 960
Query 898 CCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAACTTATCTTCCCC 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAACTTATCTTCCCC 1034
Query 972 ACCATTGGGTCCTCCCAACTATCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAACTCTTCTTGTG 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 ACCATTGGGTCCTCCCAACTATCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAACTCTTCTTGTG 1108
Query 1046 ACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATGTGATATGCCAATGGGGACTGCT 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1109 ACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATGTGATATGCCAGTGGGGACTGCT 1182
Query 1120 GGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCACAGCGAAAC 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 GGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCACAGCGAAAC 1256
Query 1194 AGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCT 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 AGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCT 1330
Query 1268 CAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTC 1341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 CAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTC 1404
Query 1342 CGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTC 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 CGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTC 1478
Query 1416 TAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTC 1489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 TAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTC 1552
Query 1490 AGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAGTCTCTCTTA 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 AGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAGTCTCTCTTA 1626
Query 1564 TCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCA 1637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 TCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCA 1700
Query 1638 CTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGCCTGGCAGCC 1711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 CTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGCCTGGCAGCC 1774
Query 1712 TTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCA 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 TTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCA 1848
Query 1786 ACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTCCAACCTGTT 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 ACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTCCAACCTGTT 1922
Query 1860 AGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATT 1933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 AGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATT 1996
Query 1934 GCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGCAGATCTGTCAGT 2007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 GCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGCAGATCTGTCAGT 2070
Query 2008 ACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAATAC 2081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 ACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAATAC 2144
Query 2082 AGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGCAGGTACAGCAGCAA 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 AGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGCAGGTACAGCAGCAA 2218
Query 2156 GTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTTGTACCCACATGTTC 2229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 GTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTTGTACCCACATGTTC 2292
Query 2230 CTTCGAACAAGAACAACCTCAGTGGGGCCCAGCAACTCCGGGGGCTCTCTTTGTGCCATGAGTGGCCGCGTTTG 2303
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2293 CTTCGAACAAGAACAACCTCAGTGGGGCCCAGCAACTCCGGGGGCTCTCTTTGTGCCATGAGTGGCCGCGTGTG 2366
Query 2304 CGTGGGGTCCCCCGCTTGCCCCAAGCCTTCGGGTCTTTCCCTTTCCAGGAGCAGAGGCAGCTCCCAGCCTGAGA 2377
||||||||||||..||.|||| ||.||||||.||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 CGTGGGGTCCCCGCCTGGCCC--AGGCTTCGGCTCTTCCCC--TCCAGGAGCAGAGGCAGCTCCCAGCCTGAGA 2436
Query 2378 TACGTGCCTTACGGTGCTTCACCCCCCCAGCCTAGA-GGGCTCATCACCTTTGAAGCCCCTGAACTGCCGGAGG 2450
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 TACGTGCCTTACGGTGCTTCA-CCCCCCAGCCTAGAGGGGCTCATCACCTTTGAAGCCCCTGAACTGCCGGAGG 2509
Query 2451 AGACGCTGATGGAGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGATGTTCACTGAGTGTGTG 2524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 AGACGCTGATGGAGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGATGTTCACTGAGTGTGTG 2583
Query 2525 CTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCNTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGATCCAGGA 2598
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2584 CTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGATCCAGGA 2657
Query 2599 GAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGA 2672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658 GAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGA 2731
Query 2673 AAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCC 2746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732 AAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCC 2805
Query 2747 ACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGAAACTTAC 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806 ACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGAAACTTAC 2879
Query 2821 AGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCAGAGAAAC 2894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 AGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCAGAGAAAC 2953
Query 2895 TCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATT 2968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 TCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATT 3027
Query 2969 GTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAGATATTGA 3042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 GTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAGATATTGA 3101
Query 3043 AAATGTGCATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTG 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3102 AAATGTGCATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTG 3171