Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14950
- Subject:
- XM_006496819.3
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1342
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGAGAGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG 74
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG 74
Query 75 ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGCTATAAGGAGAAACCTCAAGATGTGGACTTACCTTATC 148
Query 149 CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC 222
|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 CCCTCAACAACTTCTCAGTGGCAAAATGTCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAATACATTTATTATC 222
Query 223 AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC 296
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 223 AGATGTCTTCAGTGGACCACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACACCAGAGGAAAGAGAAGAGTGGAC 296
Query 297 AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC 370
.|||||||||||.||.|||||.|||.||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 297 GGAAGCTATCCAAGCCGTAGCCGACCGATTGCAGAGGCAAGAGGAGGAGAGGATGAATTGTAGCCCAACCTCAC 370
Query 371 AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 AGATTGATAATATAGGAGAAGAAGAGATGGATGCGTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACGATGAATGATTTT 444
Query 445 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 518
Query 519 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTTACTGAAAGCA 592
Query 593 GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAANTATNCNTNCCAGANAAAAGACNGTTTGTGT 666
|||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|.|||||.|||||||.||||||||
Sbjct 593 GAGTACTAAAGAACACCAGACATCCATTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT 666
Query 667 TTTGTGATGGAATATGTTANNGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG 740
|||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTGTGATGGAATATGTTAATGGCGGAGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGAGTGTTCTCTGAGGACCG 740
Query 741 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCCGGNAAGATTTGTGGTACCGTG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||| |.||.|||| |||| ||||||||
Sbjct 741 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCTTTGGACTATCTACATT-CTGGAAAGA-TTGT-GTACCGTG 811
Query 815 ATCTCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAA 888
|||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 812 ATCTCAAGTTGGAGAATTTGATGCTAGATAAGGATGGCCATATAAAAATTACGGATTTTGGGCTTTGCAAAGAA 885
Query 889 GGGATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGA 962
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 886 GGGATCACAGATGCAGCTACCATGAAGACATTCTGTGGCACACCAGAGTACCTGGCACCAGAGGTATTAGAAGA 959
Query 963 TAATGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTAC 1036
||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 960 TAATGACTATGGCCGAGCCGTGGACTGGTGGGGCTTAGGTGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGAAGGTTGC 1033
Query 1037 CTTTCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTC 1110
||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1034 CTTTCTACAACCAGGATCATGAGAAACTCTTTGAATTAATACTAATGGAAGACATTAAATTCCCCCGAACACTC 1107
Query 1111 TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1108 TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGGCCAGA 1181
Query 1185 TGATGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTG 1258
|||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1182 TGATGCAAAAGAAATCATGAGGCATAGTTTTTTTTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGACAAAAAGCTTG 1255
Query 1259 TACCTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT 1332
|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 TACCTCCTTTTAAGCCTCAAGTAACATCTGAAACAGACACCCGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT 1329
Query 1333 ATTACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCCGCATTT 1406
|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.||
Sbjct 1330 ATTACAATAACACCACCTGAAAAGTATGACGACGACGGCATGGACGGCATGGACAACGAGCGGCGGCCACACTT 1403
Query 1407 CCCTCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA 1440
||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1404 CCCTCAGTTCTCCTACTCTGCAAGCGGACGGGAA 1437