Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14950
- Subject:
- XM_016999985.1
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1245
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGAGAGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC 39
Query 223 AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC 113
Query 297 AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC 187
Query 371 AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT 261
Query 445 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 335
Query 519 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA 409
Query 593 GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAANTATNCNTNCCAGANAAAAGACNGTTTGTGT 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|.|||||.|||||||.||||||||
Sbjct 410 GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT 483
Query 667 TTTGTGATGGAATATGTTANNGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG 740
|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TTTGTGATGGAATATGTTAATGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG 557
Query 741 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCCGGNAAGATTTGTGGTACCGTG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|||| |||| ||||||||
Sbjct 558 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATT-CCGGAAAGA-TTGT-GTACCGTG 628
Query 815 ATCTCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 ATCTCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAA 702
Query 889 GGGATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 GGGATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGA 776
Query 963 TAATGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 TAATGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTAC 850
Query 1037 CTTTCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 CTTTCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTC 924
Query 1111 TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGA 998
Query 1185 TGATGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 TGATGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTG 1072
Query 1259 TACCTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 TACCTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT 1146
Query 1333 ATTACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCCGCATTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 ATTACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCCGCATTT 1220
Query 1407 CCCTCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221 CCCTCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA 1254