Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14954
• Subject: NM_016276.3
• Aligned Length: 1285
• Identities: 1100
• Gaps: 184

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAGGGGTTGCTTACCTCGGGTAGGAAACCCTCAGGCGGTGGCAGGTGCACAGGTAGGGGAGGATGGAGAGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCAGTGGTGCCTGAAGCCCTGGATGGGCGGAGCTGACCCCCCAACACCAACTCTCTCATGCCTGCTCCTCCCTG  148

Query    1  --------------------------------ATGAACTCTAGCCCAGCTGGGACCCCAAGTCCACAGCCCTCC  42
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCCCCCAGAGCTGCCTGATCATTGCTACAGAATGAACTCTAGCCCAGCTGGGACCCCAAGTCCACAGCCCTCC  222

Query   43  AGGGCCAATGGGAACATCAACCTGGGGCCTTCAGCCAACCCAAATGCCCAGCCCACGGACTTCGACTTCCTCAA  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGCCAATGGGAACATCAACCTGGGGCCTTCAGCCAACCCAAATGCCCAGCCCACGGACTTCGACTTCCTCAA  296

Query  117  AGTCATCGGCAAAGGGAACTACGGGAAGGTCCTACTGGCCAAGCGCAAGTCTGATGGGGCGTTCTATGCAGTGA  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTCATCGGCAAAGGGAACTACGGGAAGGTCCTACTGGCCAAGCGCAAGTCTGATGGGGCGTTCTATGCAGTGA  370

Query  191  AGGTACTACAGAAAAAGTCCATCTTAAAGAAGAAAGAGCAGAGCCACATCATGGCAGAGCGCAGTGTGCTTCTG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTACTACAGAAAAAGTCCATCTTAAAGAAGAAAGAGCAGAGCCACATCATGGCAGAGCGCAGTGTGCTTCTG  444

Query  265  AAGAACGTGCGGCACCCCTTCCTCGTGGGCCTGCGCTACTCCTTCCAGACACCTGAGAAGCTCTACTTCGTGCT  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAACGTGCGGCACCCCTTCCTCGTGGGCCTGCGCTACTCCTTCCAGACACCTGAGAAGCTCTACTTCGTGCT  518

Query  339  CGACTATGTCAACGGNGGAGGAGCTCTTCTTCCACCTGCAGCGGGAGCGCCGGTTCCTGGAGCCCCGGGCCCAG  412
            |||||||||||||||.||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  519  CGACTATGTCAACGGGGGA-GAGCTCTTCTTCCACCTGCAGCGGGAGCGCCGGTTCCTGGAGCCCCGGG-CCAG  590

Query  413  GTTCTACGCTGCTGAGGTGGCCAGCGCCATTGGCTACCTGCACTCCCTCAACATCATTTACAGGGATCTGAAAC  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GTTCTACGCTGCTGAGGTGGCCAGCGCCATTGGCTACCTGCACTCCCTCAACATCATTTACAGGGATCTGAAAC  664

Query  487  CAGAGAACATTCTCTTGGACTGCCAGGGACACGTGGTGCTGACGGATTTTGGCCTCTGCAAGGAAGGTGTAGAG  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  CAGAGAACATTCTCTTGGACTGCCAGGGACACGTGGTGCTGACGGATTTTGGCCTCTGCAAGGAAGGTGTAGAG  738

Query  561  CCTGAAGACACCACATCCACATTCTGTGGTACCCCTGAGTACTTGGCACCTGAAGTGCTTCGGAAAGAGCCTTA  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  CCTGAAGACACCACATCCACATTCTGTGGTACCCCTGAGTACTTGGCACCTGAAGTGCTTCGGAAAGAGCCTTA  812

Query  635  TGATCGAGCAGTGGACTGGTGGTGCTTGGGGGCAGTCCTCTACGAGATGCTCCATGGGCCTGCCGCCCTTCTAC  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  813  TGATCGAGCAGTGGACTGGTGGTGCTTGGGGGCAGTCCTCTACGAGATGCTCCAT-GGCCTGCCGCCCTTCTAC  885

Query  709  AGCCAAGATGTATCCCAGATGTATGAGAACATTCTGCACCAGCCGCTACAGATCCCCGGAAGGCCGGACAGTGG  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  886  AGCCAAGATGTATCCCAGATGTATGAGAACATTCTGCACCAGCCGCTACAGATCCCCGG-AGGCCGGACAGTGG  958

Query  783  CCGCCTGTGACCTCCTGCAAAGCCTTCTCCACAAGGACCAGAGGCAGCGGCTGGGCTCCAAAGCAGACTTTCTT  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CCGCCTGTGACCTCCTGCAAAGCCTTCTCCACAAGGACCAGAGGCAGCGGCTGGGCTCCAAAGCAGACTTTCTT  1032

Query  857  GAGATTAAGAACCATGTATTCTTCAGCCCCATAAACTGGGATGACCTGTACCACAAGAGGCTAACTCCACCCTT  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  GAGATTAAGAACCATGTATTCTTCAGCCCCATAAACTGGGATGACCTGTACCACAAGAGGCTAACTCCACCCTT  1106

Query  931  CAACCCAAATGTGACAGGACCTGCTGACTTGAAGCATTTTGACCCAGAGTTCACCCAGGAAGCTGTGTCCAAGT  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  CAACCCAAATGTGACAGGACCTGCTGACTTGAAGCATTTTGACCCAGAGTTCACCCAGGAAGCTGTGTCCAAGT  1180

Query 1005  CCATTGGCTGTACCCCTGACACTGTGGCCAGCAGCTCTGGGGCCTCAAGTGCATTCCTGGGATTTTCTTATGCG  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  CCATTGGCTGTACCCCTGACACTGTGGCCAGCAGCTCTGGGGCCTCAAGTGCATTCCTGGGATTTTCTTATGCG  1254

Query 1079  CCAGAGGATGATGACATCTTGGATTGC  1105
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  CCAGAGGATGATGACATCTTGGATTGC  1281