Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14983
• Subject: XM_011526361.2
• Aligned Length: 2007
• Identities: 1719
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74

Query   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148

Query  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222

Query  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296

Query  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGATTCTATGCAGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGATTCTATGCAGAAC  370

Query  371  CCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGTGTGATACACTGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGTGTGATACACTGGAC  444

Query  445  GGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAA  518

Query  519  AGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACT  592

Query  593  ATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGG  666

Query  667  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  740

Query  741  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  814

Query  815  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  888

Query  889  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  962

Query  963  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  1036

Query 1037  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  1110

Query 1111  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  1184

Query 1185  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  1258

Query 1259  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 1259  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACC----------------------------  1304

Query 1333  ACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCT  1406
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  --------------------TGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCT  1358

Query 1407  GCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATTTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  GCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATTTCT  1432

Query 1481  ACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  ACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGAC  1506

Query 1555  ATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCT-----  1623
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct 1507  ATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCCGCA  1580

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1581  GAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGG  1654

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1655  CCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCAGAAGAGGACAGACAGATG  1728

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1729  GACACTGAGAGAGTCCTTTCCTCTCCAGGCCCCCAGGCCTCCCCCACCCCCACCACGTTCCTTCCCTCTCACTC  1802

Query 1624  ----------CGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCA  1687
                      |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1803  TCCCCCGCTGCAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCA  1876

Query 1688  GACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTG  1761
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877  GACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTG  1950

Query 1762  GCCATCCAC  1770
            |||||||||
Sbjct 1951  GCCATCCAC  1959