Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14988
• Subject: XM_006539995.2
• Aligned Length: 2493
• Identities: 2062
• Gaps: 77

Alignment

Query    1  ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG  74
            ||||.|.|.||||||||.||||||||.||||..|||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCTTGTGGACCCCGACATTTTTAATAAGGACCCTCGAGAACACTATGATCTACTGCAACGACTGGGTGG  74

Query   75  CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA  148
            .||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||...||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct   75  TGGAACTTATGGAGAAGTATTCAAGGCTCGCGACAAGGTGTCTAAGGACCTGGTGGCTTTGAAGATGGTGAAGA  148

Query  149  TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC  222
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGCCTGATGATGACGTCGCCACCCTTCAGAAGGAGATTCTCATGCTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC  222

Query  223  GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT  296
            |||||.||||||||.|||||.||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  GTGGCTTACCATGGCAGTTACCTCTGGCTGCAGAAGCTGTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGAGCTGGTTCTCT  296

Query  297  CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG  370
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  CCAGGACATCTACCAAGTGACTGGCTCTCTGTCCGAGCTCCAGATCAGCTATGTGTGCCGGGAAGTGCTTCAGG  370

Query  371  GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGA-TGC  443
            ||||||||||..||||.|||.|||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||.|| |||
Sbjct  371  GACTGGCCTACCTGCATTCAGAGAAGAAGATACATCGAGACATCAAGGGAGCCAACATCCTCATCAACGACTGC  444

Query  444  TGGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCA  517
             ||||||||.|...|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct  445  -GGGGAGGTTAAGCTGGCTGACTTTGGGATCTCAGCCCAGATTGGGGCGACACTGGCCCGGCGCCTTTCTTTCA  517

Query  518  TTGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGAC  591
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  518  TTGGGACACCGTACTGGATGGCTCCAGAGGTGGCAGCGGTGGCCCTGAAGGGTGGATACAATGAGCTGTGCGAC  591

Query  592  ATCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAG  665
            ||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  ATCTGGTCTCTTGGCATCACAGCCATCGAGCTGGCTGAGCTTCAGCCCCCTCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAG  665

Query  666  AGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCT  739
            .|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||..|||.||||||..||.|||
Sbjct  666  GGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGCGGGTACCAGCCTCCTCGGCTGAAGGAAAAGAGCAGATGGTCATCTTCCT  739

Query  740  TCCACAACTTCATCAAAGTCACTTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCA  813
            ||||||||||..|||||||||| .||.|||||||...||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  740  TCCACAACTTTGTCAAAGTCAC-CCTCACTAAGAACTCCAAGAAACGCCCCAGTGCCACCAAGATGCTCAGTCA  812

Query  814  TCAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGA  887
            |||.|||||.||||||||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  813  TCAGCTGGTGTCCCAGCCAGGGCTGAACAGAGGCCTGATCTTGGATCTTCTTGACAAAATGAAGAATCCTGGGA  886

Query  888  AAGGAC--CCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGAT  959
            |.||.|  ||     ||..||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  887  AGGGGCTGCC-----TGTTGATATTGAAGATGAGGAGCCTGAGCCACCCCCTGCCATCCCTCGGCGGATCAGAT  955

Query  960  CCACCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTC  1033
            |.|||.||||..|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||..||.||.|
Sbjct  956  CTACCTACCGGGCCAGCTCACTAGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGCCGGAGGCAAATGGAGTTCCAGAGGCCC  1029

Query 1034  CGAGGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCC  1107
            .||.|..||||...||||||.|..||..|.||.|.||||.||.|.||.|||..|.||.||.||||||.|||.||
Sbjct 1030  AGATGCGTGGACTGCAGACCTCAGGCTGAAACTGTTCGCTTATATCCCCCTGCACACTTCGGGAGCACCAGTCC  1103

Query 1108  CAGGAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATCCCCACCCCTGCAGAGGACACAC  1181
            |||||..||.||||||||   .|||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||.|||||.|||.||
Sbjct 1104  CAGGAGTCAGCTGTCAGA---TTCTGATGACGACTATGATGATGTGGACATCCCTGCCCCTTCAGAGAACATAC  1174

Query 1182  CTCCTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGG  1255
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||.||||..|.||..||||.||||||
Sbjct 1175  CTCCTCCACTGCCCCCCAAGCCCAAGTTTCGGTCTCCATCAGATGATGGTTCTGGAGGAATTAGGGACGATGGG  1248

Query 1256  CAGCTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCC  1329
            ||..|||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||...|..|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1249  CAATTGAGCCCAGGGGTTCTGGTTCGATGTGCAAGTGGGCCCCCTCCACGTACTCCCCGACCTGGACCTCCCCC  1322

Query 1330  ATCCACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACC--CTCCCGGGAGCTTGA  1401
            |.|.|||.|||||||.||||||||.||.|..|||||.||||||.|.|||||||||.|  ||||  |||||..|.
Sbjct 1323  AGCGACCTGCAGCCCTCACCTCACAGCTCGCTCAGATCCCTCATTGTGGAACCCAGCTGCTCC--GGAGCCAGG  1394

Query 1402  CAAGCCCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAG--GGATGTGCCCTTCTCGTA----AAGT  1469
            |.||||||||||..|.|||||.|.||||||||||||||.|.|||||  |||            |.|    ||| 
Sbjct 1395  CCAGCCCCCACTCGTACCCCCAAGGAAGGAAAAGATGAGGGGAAAGATGGA------------GAACGAGAAG-  1455

Query 1470  TGTTCAATGGCTGCCCCCTCCG------GATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAG  1537
                                ||      ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1456  --------------------CGCAGAGAGATCCACAGCACAGCTGCCTGGACACATCCCTCTACAAAAGATCAG  1509

Query 1538  CACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCT  1611
            .||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1510  AACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATTTTCATACTGAACCGGAATGATCAGGAGGCCACGCTGGAAATGAT  1583

Query 1612  CTTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCCCT  1685
            |||.|||.||||.||.||.|||.|.||.|.||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.|||..|.
Sbjct 1584  CTTCCCTGGCCGCACAACCTGGCTCTATTGCATCAACAACCTCCTCATGTCTCTCTCAGGGAAGACACCCTACC  1657

Query 1686  TTTATTCTCATAGCATCCCTTGCCCTGCTGGAACGGGAAAGAGACCAGAAGCAGGAAACCCCCATCGGTTCACA  1759
            |.|||||||||||||| |||.|.||||||.||| .|||||||...|||||  .||.||.|||||| .|.|||||
Sbjct 1658  TGTATTCTCATAGCAT-CCTGGGCCTGCTTGAA-AGGAAAGACGGCAGAA--CGGGAAGCCCCAT-TGCTCACA  1726

Query 1760  TTAGCCCCCCACCGCCTACTGCNAANGGAGA-AACATGGTTTCCACCAANGATCCAGGACACCAAAGGGCTGCC  1832
            |||| |||.|||||..|||||..||  ||.| ||||||||.||||..|| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1727  TTAG-CCCTCACCGGTTACTGGCAA--GAAAGAACATGGTCTCCAGTAA-GATCCAGGACACCAAA-GGCTGCC  1795

Query 1833  GGGCGTGCTGTGTGGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTC  1906
            ||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.|||.|.||.||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1796  GGGCTTGCTGTGTGGCTGAGAGTGCTAGCTCTGGGGGCCCATTCTTATGTGGGGCATTGGAGACGTCTGTGGTT  1869

Query 1907  CTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCT  1980
            .||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1870  TTGCTCCAGTGGTACCAACCAATGAACAAATTCTTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCGCTGCCCACGCCGCT  1943

Query 1981  GTCCGTGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGC  2054
            |.|.||||||.||||||||||...|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|.
Sbjct 1944  GCCGGTGTTCACGCTGCTGACAACGCCGGGCTCCGAGCTGCCAGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCGGGGCAGG  2017

Query 2055  CGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAG  2128
            |||..||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||.|||....|||||.|||
Sbjct 2018  CGGCAAAGTCGGTGCTCTTCCACACCGTGCGCTTCGGTGCGCTGTCCTGCTGGCTGGACGACTCCAGCACGGAG  2091

Query 2129  CACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCT  2202
            ||||.||||||.||||||||||.|||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2092  CACAAGGGACCAGTGCAGGTGATCCAAGTAAAGGAAGACATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTCTAAAGCT  2165

Query 2203  GGTGACCCCGGAGGGGTCCCCAG-TCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCC  2275
            .||||||||.||||||.|.|||| |||.||| ||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2166  AGTGACCCCAGAGGGGGCACCAGCTCCTGGG-CTCCGCACCCCTGAGATCCCCATGACAGAAGCGGTCGAGGCT  2238

Query 2276  GTGGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCA  2349
            |||||||||||||.||.||..||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|.|.||
Sbjct 2239  GTGGCTATGGTTGAAGATCGACTCGAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTTCAGGTGTGGGCTCCAGGCTTGAAACA  2312

Query 2350  GCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGGCCTGTAGTGGTGGAGA  2423
            ||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2313  GCCGCTGCAGGAGCTGAGAGACCCCACCCTCACCTTCCGTCTGCTCTGCTCCCCCAGGCCGGTAGTGGTGGAGA  2386

Query 2424  C-ACGCCCAGTGGATGATCCTACTGCTCCCAGCAACCTCTACATCCAGGAA  2473
            | |.||||| .||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2387  CAAGGCCCA-CGGATGACCCTACGGCCCCCAGCAACCTCTACATCCAGGAA  2436