Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14988
• Subject: XM_006539999.1
• Aligned Length: 2505
• Identities: 1894
• Gaps: 287

Alignment

Query    1  ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA  148
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGGTGAAGA  10

Query  149  TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC  222
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  TGGAGCCTGATGATGACGTCGCCACCCTTCAGAAGGAGATTCTCATGCTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC  84

Query  223  GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT  296
            |||||.||||||||.|||||.||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   85  GTGGCTTACCATGGCAGTTACCTCTGGCTGCAGAAGCTGTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGAGCTGGTTCTCT  158

Query  297  CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG  370
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  159  CCAGGACATCTACCAAGTGACTGGCTCTCTGTCCGAGCTCCAGATCAGCTATGTGTGCCGGGAAGTGCTTCAGG  232

Query  371  GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGA-TGC  443
            ||||||||||..||||.|||.|||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||.|| |||
Sbjct  233  GACTGGCCTACCTGCATTCAGAGAAGAAGATACATCGAGACATCAAGGGAGCCAACATCCTCATCAACGACTGC  306

Query  444  TGGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCA  517
             ||||||||.|...|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct  307  -GGGGAGGTTAAGCTGGCTGACTTTGGGATCTCAGCCCAGATTGGGGCGACACTGGCCCGGCGCCTTTCTTTCA  379

Query  518  TTGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGAC  591
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  380  TTGGGACACCGTACTGGATGGCTCCAGAGGTGGCAGCGGTGGCCCTGAAGGGTGGATACAATGAGCTGTGCGAC  453

Query  592  ATCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAG  665
            ||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  ATCTGGTCTCTTGGCATCACAGCCATCGAGCTGGCTGAGCTTCAGCCCCCTCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAG  527

Query  666  AGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCT  739
            .|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||..|||.||||||..||.|||
Sbjct  528  GGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGCGGGTACCAGCCTCCTCGGCTGAAGGAAAAGAGCAGATGGTCATCTTCCT  601

Query  740  TCCACAACTTCATCAAAGTCACTTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCA  813
            ||||||||||..|||||||||| .||.|||||||...||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  602  TCCACAACTTTGTCAAAGTCAC-CCTCACTAAGAACTCCAAGAAACGCCCCAGTGCCACCAAGATGCTCAGTCA  674

Query  814  TCAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGA  887
            |||.|||||.||||||||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  675  TCAGCTGGTGTCCCAGCCAGGGCTGAACAGAGGCCTGATCTTGGATCTTCTTGACAAAATGAAGAATCCTGGGA  748

Query  888  AAGGAC--CCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGAT  959
            |.||.|  ||     ||..||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  749  AGGGGCTGCC-----TGTTGATATTGAAGATGAGGAGCCTGAGCCACCCCCTGCCATCCCTCGGCGGATCAGAT  817

Query  960  CCACCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTC  1033
            |.|||.||||..|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||..||.||.|
Sbjct  818  CTACCTACCGGGCCAGCTCACTAGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGCCGGAGGCAAATGGAGTTCCAGAGGCCC  891

Query 1034  CGAGGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCC  1107
            .||.|..||||...||||||.|..||..|.||.|.||||.||.|.||.|||..|.||.||.||||||.|||.||
Sbjct  892  AGATGCGTGGACTGCAGACCTCAGGCTGAAACTGTTCGCTTATATCCCCCTGCACACTTCGGGAGCACCAGTCC  965

Query 1108  CAGGAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATCCCCACCCCTGCAGAGGACACAC  1181
            |||||..||.||||||||   .|||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||.|||||.|||.||
Sbjct  966  CAGGAGTCAGCTGTCAGA---TTCTGATGACGACTATGATGATGTGGACATCCCTGCCCCTTCAGAGAACATAC  1036

Query 1182  CTCCTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGG  1255
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||.||||..|.||..||||.||||||
Sbjct 1037  CTCCTCCACTGCCCCCCAAGCCCAAGTTTCGGTCTCCATCAGATGATGGTTCTGGAGGAATTAGGGACGATGGG  1110

Query 1256  CAGCTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCC  1329
            ||..|||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||...|..|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  CAATTGAGCCCAGGGGTTCTGGTTCGATGTGCAAGTGGGCCCCCTCCACGTACTCCCCGACCTGGACCTCCCCC  1184

Query 1330  ATCCACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACC--CTCCCGGGAGCTTGA  1401
            |.|.|||.|||||||.||||||||.||.|..|||||.||||||.|.|||||||||.|  ||||  |||||..|.
Sbjct 1185  AGCGACCTGCAGCCCTCACCTCACAGCTCGCTCAGATCCCTCATTGTGGAACCCAGCTGCTCC--GGAGCCAGG  1256

Query 1402  CAAGCCCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAG--GG----------------------AT  1451
            |.||||||||||..|.|||||.|.||||||||||||||.|.|||||  ||                      ||
Sbjct 1257  CCAGCCCCCACTCGTACCCCCAAGGAAGGAAAAGATGAGGGGAAAGATGGAGAACGAGAAGCGCAGAGAGAAAT  1330

Query 1452  GTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGCTGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCC  1525
            .|.|||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1331  ATCCCCTTCTTGTGAAATTATTCAATGGCTGTCCCCTTCAGATCCACAGCACAGCTGCCTGGACACATCCCTCT  1404

Query 1526  ACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCAC  1599
            ||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1405  ACAAAAGATCAGAACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATTTTCATACTGAACCGGAATGATCAGGAGGCCAC  1478

Query 1600  GCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAA  1673
            ||||||||||.||||.|||.||||.||.||.|||.|.||.|.||||||||||.|.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1479  GCTGGAAATGATCTTCCCTGGCCGCACAACCTGGCTCTATTGCATCAACAACCTCCTCATGTCTCTCTCAGGGA  1552

Query 1674  AGACCCCCCCCTTTTATTCTCATAGCATCCCTTGCCCTGCTGGAACGGGAAAGAGACCAGAAGCAGGAAACCCC  1747
            ||||.|||..|.|.|||||||||||||| |||.|.||||||.||| .|||||||...|||||  .||.||.|||
Sbjct 1553  AGACACCCTACCTGTATTCTCATAGCAT-CCTGGGCCTGCTTGAA-AGGAAAGACGGCAGAA--CGGGAAGCCC  1622

Query 1748  CATCGGTTCACATTAGCCCCCCACCGCCTACTGCNAANGGAGA-AACATGGTTTCCACCAANGATCCAGGACAC  1820
            ||| .|.||||||||| |||.|||||..|||||..||  ||.| ||||||||.||||..|| ||||||||||||
Sbjct 1623  CAT-TGCTCACATTAG-CCCTCACCGGTTACTGGCAA--GAAAGAACATGGTCTCCAGTAA-GATCCAGGACAC  1691

Query 1821  CAAAGGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAG  1894
            |||| |||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.|||.|.||.||.|||||||||
Sbjct 1692  CAAA-GGCTGCCGGGCTTGCTGTGTGGCTGAGAGTGCTAGCTCTGGGGGCCCATTCTTATGTGGGGCATTGGAG  1764

Query 1895  ACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACT  1968
            |||||.||.||..||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1765  ACGTCTGTGGTTTTGCTCCAGTGGTACCAACCAATGAACAAATTCTTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCGCT  1838

Query 1969  GCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGA  2042
            |||.|||||.|||.|.||||||.||||||||||...|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1839  GCCCACGCCGCTGCCGGTGTTCACGCTGCTGACAACGCCGGGCTCCGAGCTGCCAGCTGTGTGCATCGGCGTGA  1912

Query 2043  GCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAG  2116
            ||||.||||.|.|||..||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||.|||.
Sbjct 1913  GCCCGGGGCAGGCGGCAAAGTCGGTGCTCTTCCACACCGTGCGCTTCGGTGCGCTGTCCTGCTGGCTGGACGAC  1986

Query 2117  ATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGG  2190
            ...|||||.|||||||.||||||.||||||||||.|||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987  TCCAGCACGGAGCACAAGGGACCAGTGCAGGTGATCCAAGTAAAGGAAGACATGGTGATGGTGTTGATGGATGG  2060

Query 2191  CTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTCCCCAG-TCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAA  2263
            ||||.|.|||||.||||||||.||||||.|.|||| |||.||| ||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 2061  CTCTCTAAAGCTAGTGACCCCAGAGGGGGCACCAGCTCCTGGG-CTCCGCACCCCTGAGATCCCCATGACAGAA  2133

Query 2264  GCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCT  2337
            |||||.|||||.|||||||||||||.||.||..||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 2134  GCGGTCGAGGCTGTGGCTATGGTTGAAGATCGACTCGAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTTCAGGTGTGGGCTCC  2207

Query 2338  AGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGGCCTG  2411
            |||||                     |||.|                                   ||||||.|
Sbjct 2208  AGGCT---------------------TGAAA-----------------------------------CAGGCCGG  2225

Query 2412  TAGTGGTGGAGAC-ACGCCCAGTGGATGATCCTACTGCTCCCAGCAACCTCTACATCCAGGAA  2473
            ||||||||||||| |.||||| .|||                                     
Sbjct 2226  TAGTGGTGGAGACAAGGCCCA-CGGA-------------------------------------  2250