Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15023
- Subject:
- NM_001171004.1
- Aligned Length:
- 900
- Identities:
- 560
- Gaps:
- 299
Alignment
Query 1 MSANNSPPSAQKSVLPTAIPAVLPAASPCSSPKTGLSARLSNGSFSAPSLTNSRGSVHTVSFLLQIGLTRESVT 74
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Sbjct 1 MSANNSPPSAQKSVFPATVSAVLPAPSPCSSPKTGLSARLSNGSFSAPSLTNSRGSVHTVSFLLQIGLTRESVT 74
Query 75 IEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSTDEIHEGDLVEVVLSALATVE 148
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Sbjct 75 IEAQELSLSAVKDLVCSIVYQKFPECGFFGMYDKILLFRHDMNSENILQLITSADEIHEGDLVEVVLSALATVE 148
Query 149 DFQIRPHTLYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGL 222
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Sbjct 149 DFQIRPHALYVHSYKAPTFCDYCGEMLWGLVRQGLKCEGCGLNYHKRCAFKIPNNCSGVRKRRLSNVSLPGPGL 222
Query 223 SVPRPLQPEYVALPSEESHVHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYTRPTICQYCKRLLKGLF 296
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Sbjct 223 SVPRPLQPECVPLLSEESHTHQEPSKRIPSWSGRPIWMEKMVMCRVKVPHTFAVHSYGRPTICQYCKRLLKGLF 296
Query 297 RQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPSSLGTDTDIPMDIDNNDINSDSSRGLDDTEEPSPPEDKM 370
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Sbjct 297 RQGMQCKDCKFNCHKRCASKVPRDCLGEVTFNGEPCSVGTDADMPMDIDSSDVNSDGSRGLDDSEEPSPPEDKM 370
Query 371 FFLDPSDLDVERDEEAVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRKSSTMVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKC 444
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Sbjct 371 FFLDPTDLDVERDEETVKTISPSTSNNIPLMRVVQSIKHTKRRSSTVVKEGWMVHYTSRDNLRKRHYWRLDSKC 444
Query 445 LTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRISSPRDFTNISQGSNPHCFEIITDTMVYFVGENNGDSSHNPVLAATGVGLD 518
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Sbjct 445 LTLFQNESGSKYYKEIPLSEILRVSSPQDFTSISQGSNPHCFEIITDTVVYFVGENNGSSSHNPVLAATGVGLD 518
Query 519 VAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGRGKDHKDLSTSISVSNCQIQENVDISTVYQIFADEVLGSGQFGIVYG 592
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Sbjct 519 VAQSWEKAIRQALMPVTPQASVCTSPGQGKDHKDLATSISVSNCQVQENVDISSVYQIFADEVLGSGQFGIVYG 592
Query 593 GKQLQPFAYCTHYFKNWKM------------------------------------------------------- 611
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Sbjct 593 GK----------HRKTGRDVAIKVIDKMRFPTKQESQLRNEVAILQNLHHPGIVNLECMFETPERVFVVMEKLH 656
Query 612 -------------------------------------------------------------------------- 611
Sbjct 657 GDMLEMILSSEKSRLPERITKFMVTQILVALRNLHFKNIVHCDLKPENVLLASAEPFPQVKLCDFGFARIIGEK 730
Query 612 -------------------------------------------------------------------------- 611
Sbjct 731 SFRRSVVGTPAYLAPEVLRSKGYNRSLDMWSVGVIVYVSLSGTFPFNEDEDINDQIQNAAFMYPPNPWREISSE 804
Query 612 -------------------------------------------------------------------------- 611
Sbjct 805 AIDLINNLLQVKMRKRYSVDKSLSHPWLQDYQTWLDLREFETRIGERYITHESDDARWEIHAYTHNLEYPKHFI 878
Query 612 ------------ 611
Sbjct 879 MAPNPDDMEEDP 890