Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15079
- Subject:
- XM_017313273.1
- Aligned Length:
- 1325
- Identities:
- 820
- Gaps:
- 436
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGACCATTCTAATAGGGAAAAGGATGATAGACAACGGACAACTAAAACCATGGCACAAAGGAATACACACTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTCGAGACCATCTGGCACTTCAACATCCTCTGGGGTTCTCATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TAGGGTGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCCATTAAACTG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAACTTCATTTAGAGTACAGGTTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA 296
Query 1 -------------------------------------------------ATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA 25
|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 AGGCCTCCCACAGGTTTATTACTTTGGACCATGTGGGAAGTACAATGCCATGGTGCTGGAACTCCTTGGCCCTA 370
Query 26 GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG 99
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 371 GCTTGGAAGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACGTTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG 444
Query 100 CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG 173
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 CTTTCTCGAATGGAGTATGTACACTCAAAGAATCTTATTTACCGAGATGTCAAACCAGAGAACTTCTTGATTGG 518
Query 174 TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG 247
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|
Sbjct 519 CCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTAATACACATTATAGATTTTGGACTGGCCAAGGAATATGTTGATCCTG 592
Query 248 AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG 321
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 AAACCAAAAAACACATACCTTACAGAGAGCACAAAAGTTTGACTGGAACTGCGAGATACATGTCTATCAACACA 666
Query 322 CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG 395
|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 667 CATCTAGGCAAAGAGCAAAGCCGGCGAGATGATTTGGAAGCCTTAGGCCATATGTTCATGTACTTCCTCCGAGG 740
Query 396 CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA 469
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 741 CAGCCTACCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGATACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATCGGTGATACCAAAAGGA 814
Query 470 ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG 543
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 815 ATACTCCCATCGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGATTA 888
Query 544 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||.||
Sbjct 889 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGATCTGTTTGAACGGAAAGGCTATAC 962
Query 618 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCAC---GTAGATTCTG 688
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||..|| ||||..|.| |.|||
Sbjct 963 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGAAGGCCTATTACTACATCA------TCAGAGCGCCGAGGAGA----- 1025
Query 689 GTG------------CATCTG------CAATAACTCGAGA----AAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACA 740
||| ||.|.| |||||.||| |.| |.|.|.||| |.||||
Sbjct 1026 GTGGGAAATCCAGCCCAGCCGGCAGACCAATACCTC-ATACCTGACGTCTCAC---------TTGGCC------ 1083
Query 741 ACAGCAG-CCTC--------TTCGAAAT-CAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCC 804
|||| ||.| ||| |.| |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1084 ---GCAGACCGCCATGGGGGTTC--AGTACAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTCGATGACCCC 1152
Query 805 ACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAA--------- 869
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 ACTGGAGCTCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAAGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAACTGCCTGAA 1226
Query 870 ---------------GTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGCGCCACAAG 921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1227 AATGCTCAACCTGTGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACAGCCCAGCGACACAAG 1293