Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15082
- Subject:
- NM_001100594.1
- Aligned Length:
- 2321
- Identities:
- 2172
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
Query 75 CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA 148
Query 149 CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC 222
Query 223 ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA 296
Query 297 TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG 370
Query 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT 444
Query 445 GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC 518
Query 519 AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA 592
Query 593 TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA 666
Query 667 ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC 740
Query 741 ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTTCTTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTT--CTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGG 812
Query 815 AGTGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 AGTGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACA 886
Query 889 ACAGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 ACAGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAAC 960
Query 963 AGGTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AGGTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAAT 1034
Query 1037 ACAGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 ACAGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTAC 1108
Query 1111 CCCAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 CCCAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCT 1182
Query 1185 GCTGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 GCTGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTT 1256
Query 1259 GGCTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 GGCTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCA 1330
Query 1333 GGGTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 GGGTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGC 1404
Query 1407 CGGAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 CGGAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGG 1478
Query 1481 GGAATCTGATGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATACAGCAT 1554
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1479 GGAATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTT 1552
Query 1555 CTCAAG--------CACATGCTTCCTACTGCTTCCACCGATCGAG--AAAG-CAAAGCAAGAGATCGAGCTGCA 1617
|||.|| |||| |..|||.|||||| ||| |||| ||..||..|.|.||.|||||||
Sbjct 1553 CTCCAGGTACAGTTCACA--------AACGCTACCACCG---GAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCA 1615
Query 1618 GTCGATATCTGCACAGCC----GATGCTGAATCTGAGAGCAGTTGAGGCAG-TC-ATAGAGATCCAGAATTGAC 1685
||.| |.|..||.| ||||.|||.|||||.|||.| |.|||.| || |||.||||...|..||.||
Sbjct 1616 GTAG-----TTCGGAGACCAGTGATGATGATTCTGAAAGCCG--GCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCAC 1682
Query 1686 GTACTCCCAGGCACTTGA--GGATGAGCTCACAGGCACTCCTTGGTAGCACGCGAGATGTC---CGTCAGTCTC 1754
.|||| ||.||||| .|| |||| |||....|||..|.||.|||.||...|.|.||||.| .|.||| .
Sbjct 1683 CTACT-CCTGGCAC-CGACGGGAT-AGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAG---A 1750
Query 1755 GCAAGCCAAGCAATGACAGTGGAGTCAAGGACAACACCAGCACCAGCGAGAGCGACTCAGGTGAGAACGGTCAC 1828
|||||||||||||||.||||||||....||||||..|||||.||||.||||.|.|..|.||||.|..|.|||.|
Sbjct 1751 GCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGGGTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAACAATGCTGGTGGGGGCAGTCCC 1824
Query 1829 TCCAGCGAGTCGGGTGGCAACGCCATCAATACATCGGGTACCACAAGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAAGTCCAT 1902
|||||||..||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1825 TCCAGCGGCTCGGGTGGCAACCCCACCAATACATCGGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAACTCCAT 1898
Query 1903 GCATCTGGCCTCTCGCAGTGATGGGGAGGTGGATGAGAGCGTCAAACTCATGAGCATGTGCCTCGGCTCCCAGG 1976
|||.||||||||||||||||.|||||||.|.|.|||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.
Sbjct 1899 GCAGCTGGCCTCTCGCAGTGCTGGGGAGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAGC 1972
Query 1977 TTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTGATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTGCAGTGTGATAGTCCAAGAGATA 2050
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1973 TTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTGATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAAA 2046
Query 2051 TTTAAGGAGAAAAAATGCATTAGCTCCACAGGGAATGCAGGGCATGTCCCTGCAGTGGGGGGCATAAAGTTTTT 2124
|.||.|..|||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2047 TCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTCCACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTTT 2120
Query 2125 GTATGACCACATGGCAGATACCACCACTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGC 2198
.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121 CTCTGACCACATGGCAGATACCACCACTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGC 2194
Query 2199 AGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCC 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 AGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCC 2268
Query 2273 AGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC 2299
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 AGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC 2295