Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15089
• Subject: NM_001170535.3
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1756
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGACGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74
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Sbjct    1  ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC  74

Query   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGCTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148
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Sbjct   75  GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGGTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT  148

Query  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC  222
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Sbjct  149  TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC  222

Query  223  CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC  296
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Sbjct  223  CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC  296

Query  297  CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC  370
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Sbjct  297  CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC  370

Query  371  GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG  444
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Sbjct  371  GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG  444

Query  445  CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC  518
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Sbjct  445  CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC  518

Query  519  CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA  592
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Sbjct  519  CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA  592

Query  593  AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC  666
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Sbjct  593  AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC  666

Query  667  TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT  740
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Sbjct  667  TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT  740

Query  741  GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCACGCTTGTCGCCG  814
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Sbjct  741  GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCACGCTTGTCGCCG  814

Query  815  GCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGCG  888
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Sbjct  815  GCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGCG  888

Query  889  CTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCAG  962
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Sbjct  889  CTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCAG  962

Query  963  TCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTACA  1036
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Sbjct  963  TCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTACA  1036

Query 1037  GGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGC  1110
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Sbjct 1037  GGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGC  1110

Query 1111  ATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCT  1184
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Sbjct 1111  ATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCT  1184

Query 1185  CTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAGC  1258
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Sbjct 1185  CTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAGC  1258

Query 1259  GAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAGC  1332
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Sbjct 1259  GAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAGC  1332

Query 1333  AACAAGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCAATGA  1406
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Sbjct 1333  AACAAGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCAATGA  1406

Query 1407  GATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTATGTTC  1480
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Sbjct 1407  GATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTATGTTC  1480

Query 1481  TTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTC  1554
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Sbjct 1481  TTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTC  1554

Query 1555  GCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGTATGC  1628
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Sbjct 1555  GCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGTATGC  1628

Query 1629  CTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAGCAGA  1702
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Sbjct 1629  CTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAGCAGA  1702

Query 1703  AGATGTGCTGGCTGAAGGCGGAAGGGCCTGGGCGTGGGGACGAGCCCTCCCCATCC  1758
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Sbjct 1703  AGATGTGCTGGCTGAAGGCGGAAGGGCCTGGGCGTGGGGACGAGCCCTCCCCATCC  1758