Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15089
- Subject:
- NM_031921.6
- Aligned Length:
- 1945
- Identities:
- 1684
- Gaps:
- 188
Alignment
Query 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGACGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
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Sbjct 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCGTTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGGCGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
Query 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGCTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
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Sbjct 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGTTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
Query 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC 222
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Sbjct 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTACGCCAAGGAGGCC 222
Query 223 CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC 296
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Sbjct 223 CTGAATCTGGCGCAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC 296
Query 297 CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC 370
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Sbjct 297 CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC 370
Query 371 GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG 444
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Sbjct 371 GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG 444
Query 445 CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC 518
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Sbjct 445 CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC 518
Query 519 CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA 592
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Sbjct 519 CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGACCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA 592
Query 593 AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC 666
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Sbjct 593 AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGTCCGAGCACCGTCAGACCGTC 666
Query 667 TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT 740
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Sbjct 667 TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACCGGGACAAAGT 740
Query 741 GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCAC-GCTTGTCGCC 813
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Sbjct 741 GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTCGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCGACAGC-CGTCACT 813
Query 814 GGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGC 887
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Sbjct 814 GGCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTGGAGGC 887
Query 888 GCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCA 961
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Sbjct 888 GCTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGTGCTGGAGGGTGTTGTGCTTA 961
Query 962 GTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTAC 1035
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Sbjct 962 GTCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACCAGGAACACCAAGAAGAACCGGGGCCTGTAC 1035
Query 1036 AGGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGG 1109
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Sbjct 1036 AGGCACATCCTGCTGTATGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGG 1109
Query 1110 CATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGC 1183
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Sbjct 1110 CATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGC 1183
Query 1184 TCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAG 1257
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Sbjct 1184 TCTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTCATGGATGAAGCAGACGCCTTCCTTCGGAAG 1257
Query 1258 CGAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAG 1331
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Sbjct 1258 CGAGCCACTGAGGAGATAAGCAAGGACCTCAGAGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCACATGGGCCAACACAG 1331
Query 1332 CAACAAGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCAATG 1405
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Sbjct 1332 CAACAAATTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAATCTGCCTGAGCAGTTCGACTGTGCCATCAACAGCCGCATTGACG 1405
Query 1406 AGATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTATGTT 1479
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Sbjct 1406 TGATGGTCCACTTCGACCTGCCGCAGCAGGAGGAGCGGGAGCGCCTGGTGAGACTGCATTTTGACAACTGTGTT 1479
Query 1480 CTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGT 1553
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Sbjct 1480 CTTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAACGGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGT 1553
Query 1554 CGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGTATG 1627
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Sbjct 1554 CGCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCATATG 1627
Query 1628 CCTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAGCAG 1701
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Sbjct 1628 CCTCCAAGGACGGGGTCCTCACTGAGGCCATGATGGACGCCTGTGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGTACCGACAG 1701
Query 1702 AAGATGTGCTGGCTGAAGGCGGAAGGGCCTGGGCGTGGGGACGAGCCCTCCCCATCC----------------- 1758
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Sbjct 1702 AAGATGCGCTGGCTGAAGGCGGAGGGGCCTGGGCGCGGGGTCGAGCACCCCCTATCCGGAGTCCAAGGCGAGAC 1775
Query 1759 -------------------------------------------------------------------------- 1758
Sbjct 1776 CCTCACCTCATGGAGCCTGGCCACGGACCCCTCCTACCCCTGCCTTGCCGGCCCCTGCACATTTAGGATATGCT 1849
Query 1759 -------------------------------------------------------------------------- 1758
Sbjct 1850 CCTGGATGGGGACTGGGCTGTGCCCAGGGCCTCTGTCCCCCAGGATGTCTTGTGGTGGCGGTCGGCCGTTCTGC 1923
Query 1759 --------------------- 1758
Sbjct 1924 CCCCCAGGGCACCCCCTGTTG 1944