Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15096
• Subject: NM_022416.2
• Aligned Length: 1246
• Identities: 1081
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGGCGGGAACCACTCCCACAAGCCCCCCGTGTTTGACGAGAATGAGGAAGTCAACTTTGACCATTTTCAGAT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGGCGGGAACCACTCCCACAAGCCCCCAGTGTTTGATGAGAACGAAGAAGTCAACTTTGACCACTTCCAGAT  74

Query   75  TCTGCGGGCCATTGGTAAAGGGAGTTTTGGAAAGGTATGCATCGTGCAGAAGCGAGACACTAAGAAAATGTATG  148
            .||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  CCTGCGGGCCATTGGGAAAGGAAGTTTTGGAAAGGTATGCATCGTGCAGAAGCGAGACACAAAGAAGATGTATG  148

Query  149  CAATGAAGTACATGAACAAGCAGAAGTGCATCGAGAGGGATGAGGTTCGGAATGTTTTCCGGGAGCTGCAGATC  222
            |.||||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGAAGTACATGAACAAGCAAAAGTGTGTGGAGAGGGATGAGGTGCGGAACGTGTTCCGGGAGCTGCAGATC  222

Query  223  ATGCAAGGGCTGGAGCACCCCTTCCTGGTCAATCTGTGGTACTCCTTCCAGGATGAGGAGGACATGTTCATGGT  296
            |||||.||..|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCAGGGATTAGAGCACCCCTTCCTGGTGAACCTATGGTACTCCTTCCAGGATGAGGAAGACATGTTCATGGT  296

Query  297  GGTGGACCTGCTCCTGGGAGGCGACCTGCGCTACCATCTGCAGCAGAATGTGCATTTCACAGAGGGGACTGTGA  370
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  GGTGGACCTGCTGCTGGGTGGGGACCTGCGCTACCACCTACAGCAGAATGTGCACTTCACAGAGGGGACCGTGA  370

Query  371  AACTCTACATCTGTGAGCTGGCACTGGCCCTGGAGTATCTTCAGAGGTACCACATCATCCACAGAGACATCAAG  444
            |.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGTACATCTGTGAGCTGGCCCTGGCTCTGGAGTACCTGCAGAGGTACCACATCATCCACAGAGACATCAAG  444

Query  445  CCAGACAATATCCTGCTGGATGAACACGGACATGTTCACATTACAGACTTCAACATAGCGACGGTAGTGAAAGG  518
            ||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||..|||||||
Sbjct  445  CCAGACAACATCCTACTGGATGAGCATGGGCACGTGCACATAACGGACTTCAACATCGCCACGGTCCTGAAAGG  518

Query  519  AGCAGAAAGGGCTTCCTCCATGGCTGGCACCAAGCCCTACATGGCTCCAGAAGTATTCCAGGTGTACATGGACG  592
            |...||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||..||||.|
Sbjct  519  AAGTGAGAAGGCTTCCTCCATGGCTGGCACGAAGCCCTACATGGCCCCTGAAGTCTTCCAGGTGTATGTGGATG  592

Query  593  GAGGCCCCGGATACTCGTACCCTGTCGACTGGTGGTCCCTGGGCATCACAGCCTATGAGCTGCTGCGGGGCTGG  666
            |||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  GAGGCCCTGGGTACTCATACCCCGTGGACTGGTGGTCACTGGGTGTCACAGCCTATGAGCTGCTCCGAGGCTGG  666

Query  667  AGGCCGTACGAAATCCACTCGGTCACGCCCATCGATGAAATCCTCAACATGTTCAAGGTGGAGCGTGTCCACTA  740
            |||||.||.||.||||||||.|.|||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGCCATATGAGATCCACTCAGCCACACCCATTGATGAGATTCTCAACATGTTCAAGGTGGAGCGTGTCCACTA  740

Query  741  CTCCTCCACGTGGTGCAAGGGGATGGTGGCCCTGCTGAGGAAGCTCCTGACCAAGGATCCTGAGAGCCGCGTGT  814
            |||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct  741  CTCCTCCACGTGGTGTGAGGGGATGGTGTCCCTGCTGAAGAAGCTGCTGACCAAGGACCCTGAGAGCCGCTTGT  814

Query  815  CCAGCCTTCATGACATACAGAGCGTGCCCTACTTGGCCGACATGAACTGGGACGCGGTGTTCAAGAAGGCACTG  888
            |.||.||||.||||||.||||||.||.|||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||.|||||||.|||
Sbjct  815  CAAGTCTTCGTGACATCCAGAGCATGACCTACCTGGCTGACATGAACTGGGATGCAGTATTCGAGAAGGCCCTG  888

Query  889  ATGCCCGGCTTTGTGCCCAATAAAGGGAGGTTGAACTGCGATCCCACATTTGAGCTTGAAGAGATGATTCTAGA  962
            |||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  ATGCCTGGCTTTGTGCCCAATAAAGGGAGACTGAACTGTGACCCCACATTTGAACTTGAAGAAATGATTCTAGA  962

Query  963  ATCCAAGCCACTTCACAAAAAGAAGAAGCGATTGGCAAAGAACAGATCCAGGGATGGCACAAAGGACAGCTGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.|.||.|||||.||..||||||||||||||||.|
Sbjct  963  ATCCAAGCCACTTCACAAAAAGAAGAAGAGGTTGGCCAAGCATAGGTCCAGAGACAGCACAAAGGACAGCTGTC  1036

Query 1037  CGCTGAATGGACACCTGCAGCACTGTTTGGAGACTGTCCGGGAGGAATTCATCATATTCAACAGAGAGAAGCTC  1110
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.||.|||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1037  CCCTGAATGGACACCTGCAGCAGTGTTTGGAGACAGTGCGGAAAGAGTTCATCATATTCAACCGAGAGAAACTC  1110

Query 1111  AGGAGGCAGCAGGGACA----GGGCAGCCAGCTCTTGGACACCGACAGCCGAGGGGGAGGCCAGGCCCAAAGCA  1180
            |||||||||||||||||    |    ||||.||||..|||...||..|||||...|||.|||||.||..|||||
Sbjct 1111  AGGAGGCAGCAGGGACATAATG----GCCAACTCTCAGACCTGGATGGCCGAATAGGAAGCCAGACCTCAAGCA  1180

Query 1181  AGCTCCAGGACGGGTGCAACAACAACCTCCTCACCCACACCTGCACCCGTGGCTGCAGCAGC  1242
            ||||.|||||.||..|.|||||.|||.||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||
Sbjct 1181  AGCTGCAGGATGGTCGAAACAATAACATCCTGACCCATACATGCCCCCGAGGCTGCAGCAGC  1242