Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15154
• Subject: NM_024779.5
• Aligned Length: 1265
• Identities: 1246
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC  74

Query   75  CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG  148

Query  149  TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT  222

Query  223  GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA  296

Query  297  GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG  370

Query  371  TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT  444

Query  445  CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGCAACNTNNCCAACTATCACCAGTACAT  518
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.|||||||||.|..|||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGGACATTGCTGACATGCATAGCAACCTCTCCAACTATCACCAGTACAT  518

Query  519  TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA  592
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA  592

Query  593  GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC  666

Query  667  CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAAGGATATGGACTTTCTCAA  740

Query  741  CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGAAGNNGATGTGGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||...|.||||||||||||||||||||||||||||||  ..||||||||
Sbjct  741  CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGAAGAGGAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGA--GAGATGTGGA  812

Query  815  GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC  886

Query  889  CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT  960

Query  963  CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG  1034

Query 1037  AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA  1108

Query 1111  TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCTAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT  1182

Query 1185  GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT  1256

Query 1259  CTTTGCC  1265
            |||||||
Sbjct 1257  CTTTGCC  1263