Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15229
• Subject: XM_024446326.1
• Aligned Length: 1250
• Identities: 834
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGACGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTATGAATCCCTGCCGCTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCC-AGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTT  369
                                 |||.||    |||| ||.|       ||.||.|.|    .||| ||||...|.
Sbjct    1  ---------------------ATGTCA----CTCCTAGAA-------GGGAGGATT----ACGA-TGCATTTTA  37

Query  370  GCCCAG----TGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAG-----------CCCGGCCAAGGCTCT  428
            .|||||    ||     ||||.|||                 |.||||           |||||||||||||||
Sbjct   38  TCCCAGAAGTTG-----ATGCACAG-----------------GCAGAGTTGTCTACTGACCCGGCCAAGGCTCT  89

Query  429  TCTGAGGTCCGAGCCCCACCTNANCANTCCCANCCTTNTCGNTGGTNGAAGGACACCAACGGAAACCAGGTTGA  502
            |||||||||||||||||||||.|.||.| |||.||||.|||.||||.||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct   90  TCTGAGGTCCGAGCCCCACCTCAACACT-CCAGCCTTCTCGCTGGTGGAA-GACACCAACGGAAACCAGGTTGA  161

Query  503  GAGGAAGAGCTTNAACCCGTGGGNCNNNNAATGCCACCAGNCCCACNTGACCCCGCCTGTGCTCNNAGTACCCA  576
            ||||||||||||.||||||||||.|....|||||||||||.|||||.||| |||||||||||||..||||||||
Sbjct  162  GAGGAAGAGCTTCAACCCGTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGA-CCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCA  234

Query  577  NAGAACAAGCGGGCATCGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATNCCTGTGTCCTGGATC  650
            .||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  235  GAGAACAAGC-GGCATCGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATC  307

Query  651  TGAAGATGGGGACCCGGCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCG  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  TGAAGATGGGGACCCGGCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCG  381

Query  725  CAGAGCACCTCAGCCTGCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGNAGTACTTTCT  798
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  382  CAGAGCACCTCAGCCTGCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCT  455

Query  799  NNNNNAAGACAAGTACTATGGNAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATA  872
            .....||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  456  CTGCAAAGACAAGTACTATGGAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATA  529

Query  873  ATGGAAGCCACCTCCGGAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCCATCATTAGG  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct  530  ATGGAAGCCACCTCCGGAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGG  603

Query  947  AGCCAGAGTTCATACCGCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGC  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  AGCCAGAGTTCATACCGCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGC  677

Query 1021  CCCAGGCAGCCCGCATCCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTG  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  CCCAGGCAGCCCGCATCCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTG  751

Query 1095  ACATCCGCATGATTGACTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCA  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  752  ACATCCGCATGATTGACTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCA  825

Query 1169  GACCCTGGCTATATTTTTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  GACCCTGGCTATATTTTTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  891