Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15247
- Subject:
- NM_144648.3
- Aligned Length:
- 2479
- Identities:
- 2458
- Gaps:
- 11
Alignment
Query 1 ATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAAC 74
Query 75 TGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAGA 148
Query 149 CGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTCG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTCG 222
Query 223 GACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGGA 296
Query 297 GGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCTG 370
Query 371 GGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATAT 444
Query 445 GTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATCT 518
Query 519 CCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 CCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAGG 592
Query 593 CGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTTG 666
Query 667 GATGGCAATGAGATAGAAG-AATCAGTGGACTAGAGATGTGCA--CACCTAATTCACCTTAGTTTGGCC-ACAA 736
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| .||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 667 GATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACCTTAGTTTGGCCAACAA 740
Query 737 T-AGATCACGAC-ATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTTCTGAGCAATAACCAGATTGAG 808
| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTG-TCTGAGCAATAACCAGATTGAG 813
Query 809 ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA 887
Query 883 AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG 961
Query 957 AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT 1035
Query 1031 TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT 1109
Query 1105 TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA 1178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA 1183
Query 1179 GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCTCCTTATCCCATGCTGATACTA 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCCCCTTATCCCATGCTGATACTA 1257
Query 1253 GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA 1331
Query 1327 TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG 1405
Query 1401 ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA 1474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA 1479
Query 1475 AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG 1548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG 1553
Query 1549 AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT 1627
Query 1623 ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTATAATAAA 1696
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.||
Sbjct 1628 ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTAT-ATTAA 1700
Query 1697 AATTAATCAGAATTTTCCGGGGATATTTGAATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATG-TGCCTTACAAAAA 1769
|||||||||||||||||| |||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||.||||
Sbjct 1701 AATTAATCAGAATTTTCC-GGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATGTTGCC-TACCAAAA 1772
Query 1770 ACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATGGAATGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATG 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 ACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATG 1846
Query 1844 TAAAGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTGCAT 1917
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 TTAAGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTGCAT 1920
Query 1918 TCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTC 1991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 TCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTC 1994
Query 1992 TATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTC 2065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTC 2068
Query 2066 AAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGT 2139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 AAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGT 2142
Query 2140 TTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGT 2213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 TTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGT 2216
Query 2214 TTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCA 2287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 TTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCA 2290
Query 2288 TTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGCACTACCTATACAATCA 2361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 TTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGCACTACCTATACAATCA 2364
Query 2362 TTTTCACATGAAAAAGAGTCTCACCAACACAGACAACACTCGGTCCCAGTCATCAGTCGCCCAGGTTCCAACGT 2435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 TTTTCACATGAAAAAGAGTCTCACCAACACAGACAACACTCGGTCCCAGTCATCAGTCGCCCAGGTTCCAACGT 2438
Query 2436 CAAACCCACCCTCCCTCCAATCCCTCAGGGCCGCAGG 2472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 CAAACCCACCCTCCCTCCAATCCCTCAGGGCCGCAGG 2475