Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_15253
Subject:
NM_001083615.4
Aligned Length:
4025
Identities:
3938
Gaps:
83

Alignment

Query    1  ATGAAACATCTGTATGGATTATTTCACTATAATCCTATGATGCTTGGACTTGAATCACTTCCAGATCCCACAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACATCTGTATGGATTATTTCACTATAATCCTATGATGCTTGGACTTGAATCACTTCCAGATCCCACAGA  74

Query   75  CACCTGGGAAATTATAGAGACCATTGGTAAAGGCACCTATGGCAAAGTCTACAAGGTAACTAACAAGAGAGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCTGGGAAATTATAGAGACCATTGGTAAAGGCACCTATGGCAAAGTCTACAAGGTAACTAACAAGAGAGATG  148

Query  149  GGAGCCTGGCTGCAGTGAAAATTCTGGATCCAGTCAGTGATATGGATGAAGAAATTGAGGCAGAATACAACATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAGCCTGGCTGCAGTGAAAATTCTGGATCCAGTCAGTGATATGGATGAAGAAATTGAGGCAGAATACAACATT  222

Query  223  TTGCAGTTCCTTCCTAATCATCCCAATGTTGTAAAGTTTTATGGGATGTTTTACAAAGCGGATCACTGTGTAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGCAGTTCCTTCCTAATCATCCCAATGTTGTAAAGTTTTATGGGATGTTTTACAAAGCGGATCACTGTGTAGG  296

Query  297  GGGACAGCTGTGGCTGGTCCTGGAGCTGTGTAATGGGGGCTCAGTCACTGAGCTTGTCAAAGGTCTACTCAGAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGACAGCTGTGGCTGGTCCTGGAGCTGTGTAATGGGGGCTCAGTCACTGAGCTTGTCAAAGGTCTACTCAGAT  370

Query  371  GTGGCCAGCGGTTGGATGAAGCAATGATCTCATACATCTTGTACGGGGCCCTCTTGGGCCTTCAGCATTTGCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGCCAGCGGTTGGATGAAGCAATGATCTCATACATCTTGTACGGGGCCCTCTTGGGCCTTCAGCATTTGCAC  444

Query  445  AACAACCGAATCATCCACCGTGATGTGAAGGGGAATAACATTCTTCTGACAACAGAAGGAGGAGTTAAGCTCGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACAACCGAATCATCCACCGTGATGTGAAGGGGAATAACATTCTTCTGACAACAGAAGGAGGAGTTAAGCTCGT  518

Query  519  TGACTTTGGTGTTTCAGCTCAACTCACCAGTACACGTCTGCGGAGAAACACATCTGTTGGCACCCCGTTCTGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACTTTGGTGTTTCAGCTCAACTCACCAGTACACGTCTGCGGAGAAACACATCTGTTGGCACCCCGTTCTGGA  592

Query  593  TGGCCCCTGAGGTCATTGCCTGTGAGCAGCAGTATGACTCTTCCTATGACGCTCGCTGTGACGTCTGGTCCTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCCCCTGAGGTCATTGCCTGTGAGCAGCAGTATGACTCTTCCTATGACGCTCGCTGTGACGTCTGGTCCTTG  666

Query  667  GGGATCACAGCTATTGAACTGGGGGATGGAGACCCTCCCCTCTTTGACATGCATCCTGTGAAAACACTCTTTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGATCACAGCTATTGAACTGGGGGATGGAGACCCTCCCCTCTTTGACATGCATCCTGTGAAAACACTCTTTAA  740

Query  741  GATTCCAAGAAATCCTCCACCTACTTTACTTCATCCAGAAAAATGGTGTGAAGAATTCAACCACTTTATTTCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATTCCAAGAAATCCTCCACCTACTTTACTTCATCCAGAAAAATGGTGTGAAGAATTCAACCACTTTATTTCAC  814

Query  815  AGTGTCTTATTAAGGATTTTGAAAGGCGACCTTCCGTCACACATCTCCTTGACCACCCATTTATTAAAGGAGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTGTCTTATTAAGGATTTTGAAAGGCGACCTTCCGTCACACATCTCCTTGACCACCCATTTATTAAAGGAGTA  888

Query  889  CATGGAAAAGTTCTGTTTCTGCAAAAACAGCTGGCCAAGGTTCTCCAAGACCAGAAGCATCAAAATCCTGTTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATGGAAAAGTTCTGTTTCTGCAAAAACAGCTGGCCAAGGTTCTCCAAGACCAGAAGCATCAAAATCCTGTTGC  962

Query  963  TAAAACCAGGCATGAGAGGATGCATACCAGAAGACCTTATCATGTGGAAGATGCTGAAAAATACTGCCTTGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAAACCAGGCATGAGAGGATGCATACCAGAAGACCTTATCATGTGGAAGATGCTGAAAAATACTGCCTTGAGG  1036

Query 1037  ATGATTTGGTCAACCTAGAGGTTCTGGATGAGGATACAATTATCCATCAGTTGCAGAAACGTTATGCAGACTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGATTTGGTCAACCTAGAGGTTCTGGATGAGGATACAATTATCCATCAGTTGCAGAAACGTTATGCAGACTTG  1110

Query 1111  CTAATTTACACATATGTTGGAGACATCTTAATTGCCTTAAACCCCTTCCAGAATCTAAGCATATACTCTCCACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTAATTTACACATATGTTGGAGACATCTTAATTGCCTTAAACCCCTTCCAGAATCTAAGCATATACTCTCCACA  1184

Query 1185  GTTTTCCAGACTTTATCATGGGGTGAAACGCGCCTCCAATCCCCCCCACATATTTGCATCAGCAGATGCTGCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTTTTCCAGACTTTATCATGGGGTGAAACGCGCCTCCAATCCCCCCCACATATTTGCATCAGCAGATGCTGCTT  1258

Query 1259  ACCAGTGCATGGTTACTCTCAGCAAAGACCAGTGCATTGTCATCAGCGGAGAGAGTGGCTCTGGGAAGACAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCAGTGCATGGTTACTCTCAGCAAAGACCAGTGCATTGTCATCAGCGGAGAGAGTGGCTCTGGGAAGACAGAA  1332

Query 1333  AGCGCCCACCTGATTGTTCAACATTTGACTTTCTTGGGAAAGGCCAATAATCAGACCTTGAGAGAGAAAATTCT  1406
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCGCCCACCTGATTGTTCAGCATTTGACTTTCTTGGGAAAGGCCAATAATCAGACCTTGAGAGAGAAAATTCT  1406

Query 1407  ACAAGTCAACTCCCTGGTGGAAGCCTTTGGGAACTCATGCACTGCCATCAATGACAACTCGAGCCGTTTTGGAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACAAGTCAACTCCCTGGTGGAAGCCTTTGGGAACTCATGCACTGCCATCAATGACAACTCGAGCCGTTTTGGAA  1480

Query 1481  AATATCTGGAAATGATGTTTACACCAACTGGAGTTGTGATGGGGGCAAGAATCTCTGAATATCTCCTGGAAAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATATCTGGAAATGATGTTTACACCAACTGGAGTTGTGATGGGGGCAAGAATCTCTGAATATCTCCTGGAAAAA  1554

Query 1555  TCCAGAGTTATAAAACAGGCAGCGAGAGAGAAAAATTTTCATATATTTTACTATATTTATGCTGGTCTTCATCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCCAGAGTTATAAAACAGGCAGCGAGAGAGAAAAATTTTCATATATTTTACTATATTTATGCTGGTCTTCATCA  1628

Query 1629  CCAAAAGAAGCTTTCTGATTTCAGACTTCCTGAGGAAAAACCTCCTAGGTACATAGCTGATGAAACTGGAAGGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAAAAGAAGCTTTCTGATTTCAGACTTCCTGAGGAAAAACCTCCTAGGTACATAGCTGATGAAACTGGAAGGG  1702

Query 1703  TGATGCACGACATAACTTCCAAGGAGTCTTACAGAAGACAATTCGAAGCAATTCAGCATTGCTTCAGGATTATA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGATGCACGACATAACTTCCAAGGAGTCTTACAGAAGACAATTCGAAGCAATTCAGCATTGCTTCAGGATTATA  1776

Query 1777  GGGTTCACGGACAAAGAGGTGCACTCAGTGTACAGAATTTTGGCTGGGATTTTGAATATTGGGAACATTGAGTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGGTTCACGGACAAAGAGGTGCACTCAGTGTACAGAATTTTGGCTGGGATTTTGAATATTGGGAACATTGAGTT  1850

Query 1851  CGCAGCTATTTCCTCTCAACATCAGACTGATAAAAGTGAGGTGCCCAATGCTGAAGCTTTGCAAAATGCTGCCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGCAGCTATTTCCTCTCAACATCAGACTGATAAAAGTGAGGTGCCCAATGCTGAAGCTTTGCAAAATGCTGCCT  1924

Query 1925  CTGTTCTGTGCATTAGCCCTGAAGAGCTCCAGGAGGCCCTCACCTCCCACTGTGTGGTCACCCGGGGCGAGACC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGTTCTGTGCATTAGCCCTGAAGAGCTCCAGGAGGCCCTCACCTCCCACTGTGTGGTCACCCGGGGCGAGACC  1998

Query 1999  ATCATCCGTGCCAACACTGTAGACAGGGCTGCGGACGTTCGAGACGCCATGTCCAAAGCCCTGTATGGGAGGCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATCATCCGTGCCAACACTGTAGACAGGGCTGCGGACGTTCGAGACGCCATGTCCAAAGCCCTGTATGGGAGGCT  2072

Query 2073  CTTCAGCTGGATTGTGAATCGCATTAATACACTCCTGCAGCCAGACGAAAACATATGTAGTGCAGGAGGTGGAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTTCAGCTGGATTGTGAATCGCATTAATACACTCCTGCAGCCAGACGAAAACATATGTAGTGCAGGAGGTGGAA  2146

Query 2147  TGAATGTGGGGATCTTGGATATCTTTGGATTCGAGAATTTTCAGAGAAATTCATTTGAGCAGCTCTGCATAAAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGAATGTGGGGATCTTGGATATCTTTGGATTCGAGAATTTTCAGAGAAATTCATTTGAGCAGCTCTGCATAAAC  2220

Query 2221  ATCGCCAATGAGCAAATCCAGTACTATTTCAATCAGCATGTTTTTGCTCTTGAGCAGATGGAATATCAGAATGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCGCCAATGAGCAAATCCAGTACTATTTCAATCAGCATGTTTTTGCTCTTGAGCAGATGGAATATCAGAATGA  2294

Query 2295  AGGCATTGATGCTGTACCCGTGGAATATGAGGACAACCGCCCGCTCTTGGACATGTTCCTCCAGAAACCCCTGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGGCATTGATGCTGTACCCGTGGAATATGAGGACAACCGCCCGCTCTTGGACATGTTCCTCCAGAAACCCCTGG  2368

Query 2369  GACTGCTTGCACTTTTGGATGAGGAAAGTCGGTTTCCCCAAGCAACTGACCAGACCCTGGTTGATAAATTTGAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GACTGCTTGCACTTTTGGATGAGGAAAGTCGGTTTCCCCAAGCAACTGACCAGACCCTGGTTGATAAATTTGAA  2442

Query 2443  GATAATCTACGATGCAAATACTTCTGGAGGCCCAAAGGAGTGGAACTGTGCTTTGGCATTCAGCATTATGCTGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GATAATCTACGATGCAAATACTTCTGGAGGCCCAAAGGAGTGGAACTGTGCTTTGGCATTCAGCATTATGCTGG  2516

Query 2517  AAAGGTATTATATGATGCTTCTGGGGTTCTTGAGAAAAATAGAGACACTCTCCCTGCCGATGTGGTTGTGGTCC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AAAGGTATTATATGATGCTTCTGGGGTTCTTGAGAAAAATAGAGACACTCTCCCTGCCGATGTGGTTGTGGTCC  2590

Query 2591  TGAGAACGTCAGAAAACATGCTTCTTCAGCAGCTCTTCTCAATCCCTCTGACCAAAACAGGTAATTTGGCCCAG  2664
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGAGAACGTCAGAAAACAAGCTTCTTCAGCAGCTCTTCTCAATCCCTCTGACCAAAACAGGTAATTTGGCCCAG  2664

Query 2665  ACAAGAGCTAGGATAACAGTGGCCTCAAGTTCTTTGCCTCCACATTTCAGTGCTGGGAAAGCCAAGGTGGACAC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ACAAGAGCTAGGATAACAGTGGCCTCAAGTTCTTTGCCTCCACATTTCAGTGCTGGGAAAGCCAAGGTGGACAC  2738

Query 2739  TCTGGAGGTGATACGGCATCCGGAAGAAACCACCAACATGAAGAGGCAAACTGTGGCTTCTTACTTCCGGTATT  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TCTGGAGGTGATACGGCATCCGGAAGAAACCACCAACATGAAGAGGCAAACTGTGGCTTCTTACTTCCGGTATT  2812

Query 2813  CTCTGATGGACCTGCTCTCCAAAATGGTGGTTGGACAGCCCCACTTTGTGCGCTGCATTAAACCCAATGATGAC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTCTGATGGACCTGCTCTCCAAAATGGTGGTTGGACAGCCCCACTTTGTGCGCTGCATTAAACCCAATGATGAC  2886

Query 2887  CGAGAGGCCCTGCAGTTCTCTCGAGAGAGGGTGCTGGCCCAGCTCCGCTCCACAGGGATTCTGGAGACAGTCAG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CGAGAGGCCCTGCAGTTCTCTCGAGAGAGGGTGCTGGCCCAGCTCCGCTCCACAGGGATTCTGGAGACAGTCAG  2960

Query 2961  CATCCGCCGCCAGGGCTATTCCCACCGCATCCTTTTTGAAGAATTTGTGAAAAGGTATTATTACTTGGCATTCA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CATCCGCCGCCAGGGCTATTCCCACCGCATCCTTTTTGAAGAATTTGTGAAAAGGTATTATTACTTGGCATTCA  3034

Query 3035  CAGCACATCAAACACCTCTTGCTAGCAAAGAGAGCTGTGTGGCTATCTTGGAAAAGTCCAGATTAGATCACTGG  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CAGCACATCAAACACCTCTTGCTAGCAAAGAGAGCTGTGTGGCTATCTTGGAAAAGTCCAGATTAGATCACTGG  3108

Query 3109  GTGCTGGGAAAAACAAAGGTTTTTCTCAAATATTACCATGTTGAGCAATTAAATTTGCTGCTTCGAGAAGTCAT  3182
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GTACTGGGAAAAACAAAGGTTTTTCTCAAATATTACCATGTTGAGCAATTAAATTTGCTGCTTCGAGAAGTCAT  3182

Query 3183  AGGCAGAGTGGTTGTGCTGCAGGCATATACCAAGGGGTGGCTTGGAGCCAGGAGATACAAAAAGGTCAGAGAGA  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 3183  AGGCAGAGTGGTTGTGCTGCAGGCATATACCAAGGGGTGGCTTGGAGCCAGGAGATACAAAAGGGTCAGAGAGA  3256

Query 3257  AGAGAGAGAAGGGAGCCATTGCCATCCCAGTCAGCCTTGGAGAGGATATGATGCTCGGAGGAAATTTAAGAAAA  3330
            ||||||||||||||||||||||||| |||||                                           
Sbjct 3257  AGAGAGAGAAGGGAGCCATTGCCAT-CCAGT-------------------------------------------  3286

Query 3331  TAAGCAACAGAAGGAATGAGTCTGCTGCTCATAATCAAGCAGGGGACACTTCAAACCAAAGCAGTGGGCCACAT  3404
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3287  ---------------------------------------CAGGGGACACTTCAAACCAAAGCAGTGGGCCACAT  3321

Query 3405  TCCCCCGTCGCAGCAGGTACGAGGGGAAGTGCCGAGGTTCAAGACTGCAGCGAGCCTGGTGACCATAAAGTTCT  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3322  TCCCCCGTCGCAGCAGGTACGAGGGGAAGTGCCGAGGTTCAAGACTGCAGCGAGCCTGGTGACCATAAAGTTCT  3395

Query 3479  CAGGGGCTCTGTACATCGTAGGAGCCATTCACAAGCAGAATCCAACAATGGCCGTACACAGACTTCAAGCAACT  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3396  CAGGGGCTCTGTACATCGTAGGAGCCATTCACAAGCAGAATCCAACAATGGCCGTACACAGACTTCAAGCAACT  3469

Query 3553  CTCCTGCTGTCACAGAGAAAAATGGGCATTCACAAGCCCAGAGTTCTCCAAAAGGGTGCGATATCTTCGCAGGA  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3470  CTCCTGCTGTCACAGAGAAAAATGGGCATTCACAAGCCCAGAGTTCTCCAAAAGGGTGCGATATCTTCGCAGGA  3543

Query 3627  CATGCAAACAAGCACTCGGTTTCTGGGACTGATTTGCTGTCTTCTCGGATATGCCATCCTGCTCCAGATCAGCA  3700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3544  CATGCAAACAAGCACTCGGTTTCTGGGACTGATTTGCTGTCTTCTCGGATATGCCATCCTGCTCCAGATCAGCA  3617

Query 3701  AGGATTGAGTCTCTGGGGAGCCCCTCAAAAGCCTGGTTCAGAAAATGGTCTTGCACAGAAGCATCGAACACCTC  3774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3618  AGGATTGAGTCTCTGGGGAGCCCCTCAAAAGCCTGGTTCAGAAAATGGTCTTGCACAGAAGCATCGAACACCTC  3691

Query 3775  GCCGACGATGTCAGCAGCCCAAAATGCTGAGTAGCCCTGAGGACACCATGTACTATAACCAGTTAAATGGAACT  3848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3692  GCCGACGATGTCAGCAGCCCAAAATGCTGAGTAGCCCTGAGGACACCATGTACTATAACCAGTTAAATGGAACT  3765

Query 3849  CTAGAATATCAAGGGAGCAAGAGGAAGCCAAGAAAACTTGGCCAAATCAAAGTACTTGATGGGGAAGATGAATA  3922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3766  CTAGAATATCAAGGGAGCAAGAGGAAGCCAAGAAAACTTGGCCAAATCAAAGTACTTGATGGGGAAGATGAATA  3839

Query 3923  TTACAAATCTCTGTCACCAGTGGACTGTATCCCTGAGGAGAACAACTCAGCCCACCCTTCCTTTTTTTCTTCAT  3996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3840  TTACAAATCTCTGTCACCAGTGGACTGTATCCCTGAGGAGAACAACTCAGCCCACCCTTCCTTTTTTTCTTCAT  3913

Query 3997  CCTCAAAAGGAGACTCTTTTGCTCAACAT  4025
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3914  CCTCAAAAGGAGACTCTTTTGCTCAACAT  3942