Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15253
- Subject:
- XM_011510656.3
- Aligned Length:
- 4281
- Identities:
- 3205
- Gaps:
- 1072
Alignment
Query 1 ATGAAACATCTGTATGGATTATTTCACTATAATCCTATGATGCTTGGACTTGAATCACTTCCAGATCCCACAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACCTGGGAAATTATAGAGACCATTGGTAAAGGCACCTATGGCAAAGTCTACAAGGTAACTAACAAGAGAGATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGAGCCTGGCTGCAGTGAAAATTCTGGATCCAGTCAGTGATATGGATGAAGAAATTGAGGCAGAATACAACATT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTGCAGTTCCTTCCTAATCATCCCAATGTTGTAAAGTTTTATGGGATGTTTTACAAAGCGGATCACTGTGTAGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGGACAGCTGTGGCTGGTCCTGGAGCTGTGTAATGGGGGCTCAGTCACTGAGCTTGTCAAAGGTCTACTCAGAT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GTGGCCAGCGGTTGGATGAAGCAATGATCTCATACATCTTGTACGGGGCCCTCTTGGGCCTTCAGCATTTGCAC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AACAACCGAATCATCCACCGTGATGTGAAGGGGAATAACATTCTTCTGACAACAGAAGGAGGAGTTAAGCTCGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGACTTTGGTGTTTCAGCTCAACTCACCAGTACACGTCTGCGGAGAAACACATCTGTTGGCACCCCGTTCTGGA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGGCCCCTGAGGTCATTGCCTGTGAGCAGCAGTATGACTCTTCCTATGACGCTCGCTGTGACGTCTGGTCCTTG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GGGATCACAGCTATTGAACTGGGGGATGGAGACCCTCCCCTCTTTGACATGCATCCTGTGAAAACACTCTTTAA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 GATTCCAAGAAATCCTCCACCTACTTTACTTCATCCAGAAAAATGGTGTGAAGAATTCAACCACTTTATTTCAC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 A----GTGTCTTATTAAGGATTTTGAAAGGCGACCTTCCGTCACACATCTCCTTGACCACCCATTTATTAAAGG 884
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGTGTCTTATTAAGGATTTTGAAAGGCGACCTTCCGTCACACATCTCCTTGACCACCCATTTATTAAAGG 74
Query 885 AGTACATGGAAAAGTTCTGTTTCTGCAAAAACAGCTGGCCAAGGTTCTCCAAGACCAGAAGCATCAAAATCCTG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTACATGGAAAAGTTCTGTTTCTGCAAAAACAGCTGGCCAAGGTTCTCCAAGACCAGAAGCATCAAAATCCTG 148
Query 959 TTGCTAAAACC--------------------------------------------------------------- 969
|||||||||||
Sbjct 149 TTGCTAAAACCAGCAACTGGCAAGGAGCTGGCTACATAGATGTTTTTCAGCCCACCAGGAAAAACTCTCAAATA 222
Query 970 -------------------------------------------------------------------------- 969
Sbjct 223 TCATTCCATGCTGATAAATCAATATATTTAAAGCTGTGGTTTTTCAAGTTAAAGCAGAAAAAAAAAAAAACAGA 296
Query 970 -------AGGCATGAGAGGATGCATACCAGAAGACCTTATCATGTGGAAGATGCTGAAAAATACTGCCTTGAGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAATTGAGGCATGAGAGGATGCATACCAGAAGACCTTATCATGTGGAAGATGCTGAAAAATACTGCCTTGAGG 370
Query 1037 ATGATTTGGTCAACCTAGAGGTTCTGGATGAGGATACAATTATCCATCAGTTGCAGAAACGTTATGCAGACTTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGATTTGGTCAACCTAGAGGTTCTGGATGAGGATACAATTATCCATCAGTTGCAGAAACGTTATGCAGACTTG 444
Query 1111 CTAATTTACACATATGTTGGAGACATCTTAATTGCCTTAAACCCCTTCCAGAATCTAAGCATATACTCTCCACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTAATTTACACATATGTTGGAGACATCTTAATTGCCTTAAACCCCTTCCAGAATCTAAGCATATACTCTCCACA 518
Query 1185 GTTTTCCAGACTTTATCATGGGGTGAAACGCGCCTCCAATCCCCCCCACATATTTGCATCAGCAGATGCTGCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTTTCCAGACTTTATCATGGGGTGAAACGCGCCTCCAATCCCCCCCACATATTTGCATCAGCAGATGCTGCTT 592
Query 1259 ACCAGTGCATGGTTACTCTCAGCAAAGACCAGTGCATTGTCATCAGCGGAGAGAGTGGCTCTGGGAAGACAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCAGTGCATGGTTACTCTCAGCAAAGACCAGTGCATTGTCATCAGCGGAGAGAGTGGCTCTGGGAAGACAGAA 666
Query 1333 AGCGCCCACCTGATTGTTCAACATTTGACTTTCTTGGGAAAGGCCAATAATCAGACCTTGAGAGAGAAAATTCT 1406
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCGCCCACCTGATTGTTCAGCATTTGACTTTCTTGGGAAAGGCCAATAATCAGACCTTGAGAGAGAAAATTCT 740
Query 1407 ACAAGTCAACTCCCTGGTGGAAGCCTTTGGGAACTCATGCACTGCCATCAATGACAACTCGAGCCGTTTTGGAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAAGTCAACTCCCTGGTGGAAGCCTTTGGGAACTCATGCACTGCCATCAATGACAACTCGAGCCGTTTTGGAA 814
Query 1481 AATATCTGGAAATGATGTTTACACCAACTGGAGTTGTGATGGGGGCAAGAATCTCTGAATATCTCCTGGAAAAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AATATCTGGAAATGATGTTTACACCAACTGGAGTTGTGATGGGGGCAAGAATCTCTGAATATCTCCTGGAAAAA 888
Query 1555 TCCAGAGTTATAAAACAGGCAGCGAGAGAGAAAAATTTTCATATATTTTACTATATTTATGCTGGTCTTCATCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCAGAGTTATAAAACAGGCAGCGAGAGAGAAAAATTTTCATATATTTTACTATATTTATGCTGGTCTTCATCA 962
Query 1629 CCAAAAGAAGCTTTCTGATTTCAGACTTCCTGAGGAAAAACCTCCTAGGTACATAGCTGATGAAACTGGAAGGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCAAAAGAAGCTTTCTGATTTCAGACTTCCTGAGGAAAAACCTCCTAGGTACATAGCTGATGAAACTGGAAGGG 1036
Query 1703 TGATGCACGACATAACTTCCAAGGAGTCTTACAGAAGACAATTCGAAGCAATTCAGCATTGCTTCAGGATTATA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGATGCACGACATAACTTCCAAGGAGTCTTACAGAAGACAATTCGAAGCAATTCAGCATTGCTTCAGGATTATA 1110
Query 1777 GGGTTCACGGACAAAGAGGTGCACTCAGTGTACAGAATTTTGGCTGGGATTTTGAATATTGGGAACATTGAGTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGTTCACGGACAAAGAGGTGCACTCAGTGTACAGAATTTTGGCTGGGATTTTGAATATTGGGAACATTGAGTT 1184
Query 1851 CGCAGCTATTTCCTCTCAACATCAGACTGATAAAAGTGAGGTGCCCAATGCTGAAGCTTTGCAAAATGCTGCCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGCAGCTATTTCCTCTCAACATCAGACTGATAAAAGTGAGGTGCCCAATGCTGAAGCTTTGCAAAATGCTGCCT 1258
Query 1925 CTGTTCTGTGCATTAGCCCTGAAGAGCTCCAGGAGGCCCTCACCTCCCACTGTGTGGTCACCCGGGGCGAGACC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGTTCTGTGCATTAGCCCTGAAGAGCTCCAGGAGGCCCTCACCTCCCACTGTGTGGTCACCCGGGGCGAGACC 1332
Query 1999 ATCATCCGTGCCAACACTGTAGACAGGGCTGCGGACGTTCGAGACGCCATGTCCAAAGCCCTGTATGGGAGGCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCATCCGTGCCAACACTGTAGACAGGGCTGCGGACGTTCGAGACGCCATGTCCAAAGCCCTGTATGGGAGGCT 1406
Query 2073 CTTCAGCTGGATTGTGAATCGCATTAATACACTCCTGCAGCCAGACGAAAACATATGTAGTGCAGGAGGTGGAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTTCAGCTGGATTGTGAATCGCATTAATACACTCCTGCAGCCAGACGAAAACATATGTAGTGCAGGAGGTGGAA 1480
Query 2147 TGAATGTGGGGATCTTGGATATCTTTGGATTCGAGAATTTTCAGAGAAATTCATTTGAGCAGCTCTGCATAAAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAATGTGGGGATCTTGGATATCTTTGGATTCGAGAATTTTCAGAGAAATTCATTTGAGCAGCTCTGCATAAAC 1554
Query 2221 ATCGCCAATGAGCAAATCCAGTACTATTTCAATCAGCATGTTTTTGCTCTTGAGCAGATGGAATATCAGAATGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCGCCAATGAGCAAATCCAGTACTATTTCAATCAGCATGTTTTTGCTCTTGAGCAGATGGAATATCAGAATGA 1628
Query 2295 AGGCATTGATGCTGTACCCGTGGAATATGAGGACAACCGCCCGCTCTTGGACATGTTCCTCCAGAAACCCCTGG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGGCATTGATGCTGTACCCGTGGAATATGAGGACAACCGCCCGCTCTTGGACATGTTCCTCCAGAAACCCCTGG 1702
Query 2369 GACTGCTTGCACTTTTGGATGAGGAAAGTCGGTTTCCCCAAGCAACTGACCAGACCCTGGTTGATAAATTTGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GACTGCTTGCACTTTTGGATGAGGAAAGTCGGTTTCCCCAAGCAACTGACCAGACCCTGGTTGATAAATTTGAA 1776
Query 2443 GATAATCTACGATGCAAATACTTCTGGAGGCCCAAAGGAGTGGAACTGTGCTTTGGCATTCAGCATTATGCTGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GATAATCTACGATGCAAATACTTCTGGAGGCCCAAAGGAGTGGAACTGTGCTTTGGCATTCAGCATTATGCTGG 1850
Query 2517 AAAGGTATTATATGATGCTTCTGGGGTTCTTGAGAAAAATAGAGACACTCTCCCTGCCGATGTGGTTGTGGTCC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AAAGGTATTATATGATGCTTCTGGGGTTCTTGAGAAAAATAGAGACACTCTCCCTGCCGATGTGGTTGTGGTCC 1924
Query 2591 TGAGAACGTCAGAAAACATGCTTCTTCAGCAGCTCTTCTCAATCCCTCTGACCAAAACAGGTAATTTGGCCCAG 2664
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGAGAACGTCAGAAAACAAGCTTCTTCAGCAGCTCTTCTCAATCCCTCTGACCAAAACAGGTAATTTGGCCCAG 1998
Query 2665 ACAAGAGCTAGGATAACAGTGGCCTCAAGTTCTTTGCCTCCACATTTCAGTGCTGGGAAAGCCAAGGTGGACAC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACAAGAGCTAGGATAACAGTGGCCTCAAGTTCTTTGCCTCCACATTTCAGTGCTGGGAAAGCCAAGGTGGACAC 2072
Query 2739 TCTGGAGGTGATACGGCATCCGGAAGAAACCACCAACATGAAGAGGCAAACTGTGGCTTCTTACTTCCGGTATT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TCTGGAGGTGATACGGCATCCGGAAGAAACCACCAACATGAAGAGGCAAACTGTGGCTTCTTACTTCCGGTATT 2146
Query 2813 CTCTGATGGACCTGCTCTCCAAAATGGTGGTTGGACAGCCCCACTTTGTGCGCTGCATTAAACCCAATGATGAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTCTGATGGACCTGCTCTCCAAAATGGTGGTTGGACAGCCCCACTTTGTGCGCTGCATTAAACCCAATGATGAC 2220
Query 2887 CGAGAGGCCCTGCAGTTCTCTCGAGAGAGGGTGCTGGCCCAGCTCCGCTCCACAGGGATTCTGGAGACAGTCAG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CGAGAGGCCCTGCAGTTCTCTCGAGAGAGGGTGCTGGCCCAGCTCCGCTCCACAGGGATTCTGGAGACAGTCAG 2294
Query 2961 CATCCGCCGCCAGGGCTATTCCCACCGCATCCTTTTTGAAGAATTTGTGAAAAGGTATTATTACTTGGCATTCA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CATCCGCCGCCAGGGCTATTCCCACCGCATCCTTTTTGAAGAATTTGTGAAAAGGTATTATTACTTGGCATTCA 2368
Query 3035 CAGCACATCAAACACCTCTTGCTAGCAAAGAGAGCTGTGTGGCTATCTTGGAAAAGTCCAGATTAGATCACTGG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAGCACATCAAACACCTCTTGCTAGCAAAGAGAGCTGTGTGGCTATCTTGGAAAAGTCCAGATTAGATCACTGG 2442
Query 3109 GTGCTGGGAAAAACAAAGGTTTTTCTCAAATATTACCATGTTGAGCAATTAAATTTGCTGCTTCGAGAAGTCAT 3182
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GTACTGGGAAAAACAAAGGTTTTTCTCAAATATTACCATGTTGAGCAATTAAATTTGCTGCTTCGAGAAGTCAT 2516
Query 3183 AGGCAGAGTGGTTGTGCTGCAGGCATATACCAAGGGGTGGCTTGGAGCCAGGAGATACAAAAAGGTCAGAGAGA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2517 AGGCAGAGTGGTTGTGCTGCAGGCATATACCAAGGGGTGGCTTGGAGCCAGGAGATACAAAAGGGTCAGAGAGA 2590
Query 3257 AGAGAGAGAAGGGAGCCATTGCCATCCCAGTCAGCCTTGGAGAGGATATGATGCTCGGAGGAAATTTAAGAAAA 3330
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGAGAGAGAAGGGAGCCATTGCCAT-CCAGTCAGCC-TGGAGAGGATATGATGCTCGGAGGAAATTTAAGAAAA 2662
Query 3331 TAAGCAACAGAAGGAATGAGTCTGCTGCTCATAATCAAGCAGGGGACACTTCAAACCAAAGCAGTGGGCCACAT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2663 TAAGCAACAGAAGGAATGAGTCTGCTGCTCATAATCAAGCAGGGGACACTTCAAACCAAAGCAGTGGGCCACAT 2736
Query 3405 TCCCCCGTCGCAGCAGGTACGAGGGGAAGTGCCGAGGTTCAAGACTGCAGCGAGCCTGGTGACCATAAAGTTCT 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2737 TCCCCCGTCGCAGCAGGTACGAGGGGAAGTGCCGAGGTTCAAGACTGCAGCGAGCCTGGTGACCATAAAGTTCT 2810
Query 3479 CAGGGGCTCTGTACATCGTAGGAGCCATTCACAAGCAGAATCCAACAATGGCCGTACACAGACTTCAAGCAACT 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 CAGGGGCTCTGTACATCGTAGGAGCCATTCACAAGCAGAATCCAACAATGGCCGTACACAGACTTCAAGCAACT 2884
Query 3553 CTCCTGCTGTCACAGAGAAAAATG-------------------------------------------------- 3576
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885 CTCCTGCTGTCACAGAGAAAAATGGGTCTCATTCGTGTGACATACAGACAAGGGCAAGAGAAGAGCATCCCAGG 2958
Query 3577 ----------------------------------------------------------GGCATTCACAAGCCCA 3592
||||||||||||||||
Sbjct 2959 CAGGAGAAACAAGAGTGGGCCATAGCCAGAGGCAGGATATGCAGAGCCATTCTTGGAAGGCATTCACAAGCCCA 3032
Query 3593 GAGTTCTCCAAAAGGGTGCGATATCTTCGCAGGACATGCAAACAAGCACTCGGTTTCTGGGACTGATTTGCTGT 3666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3033 GAGTTCTCCAAAAGGGTGCGATATCTTCGCAGGACATGCAAACAAGCACTCGGTTTCTGGGACTGATTTGCTGT 3106
Query 3667 CTTCTCGGATATGCCATCCTGCTCCAGATCAGCAAGGATTGAGTCTCTGGGGAGCCCCTCAAAAGCCTGGTTCA 3740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3107 CTTCTCGGATATGCCATCCTGCTCCAGATCAGCAAGGATTGAGTCTCTGGGGAGCCCCTCAAAAGCCTGGTTCA 3180
Query 3741 GAAAATGGTCTTGCACAGAAGCATCGAACACCTCGCCGACGATGTCAGCAGCCCAAAATGCTGAGTAGCCCTGA 3814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 GAAAATGGTCTTGCACAGAAGCATCGAACACCTCGCCGACGATGTCAGCAGCCCAAAATGCTGAGTAGCCCTGA 3254
Query 3815 GGACACCATGTACTATAACCAGTTAAATGGAACTCTAGAATATCAAGGGAGCAAGAGGAAGCCAAGAAAACTTG 3888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3255 GGACACCATGTACTATAACCAGTTAAATGGAACTCTAGAATATCAAGGGAGCAAGAGGAAGCCAAGAAAACTTG 3328
Query 3889 GCCAAATCAAAGTACTTGATGGGGAAGATGAATATTACAAATCTCTGTCACCAGTGGACTGTATCCCTGAGGAG 3962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3329 GCCAAATCAAAGTACTTGATGGGGAAGATGAATATTACAAATCTCTGTCACCAGTGGACTGTATCCCTGAGGAG 3402
Query 3963 AACAACTCAGCCCACCCTTCCTTTTTTTCTTCATCCTCAAAAGGAGACTCTTTTGCTCAACAT 4025
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3403 AACAACTCAGCCCACCCTTCCTTTTTTTCTTCATCCTCAAAAGGAGACTCTTTTGCTCAACAT 3465
