Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15253
- Subject:
- XM_011510658.3
- Aligned Length:
- 4133
- Identities:
- 3038
- Gaps:
- 1091
Alignment
Query 1 ATGAAACATCTGTATGGATTATTTCACTATAATCCTATGATGCTTGGACTTGAATCACTTCCAGATCCCACAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACCTGGGAAATTATAGAGACCATTGGTAAAGGCACCTATGGCAAAGTCTACAAGGTAACTAACAAGAGAGATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGAGCCTGGCTGCAGTGAAAATTCTGGATCCAGTCAGTGATATGGATGAAGAAATTGAGGCAGAATACAACATT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTGCAGTTCCTTCCTAATCATCCCAATGTTGTAAAGTTTTATGGGATGTTTTACAAAGCGGATCACTGTGTAGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGGACAGCTGTGGCTGGTCCTGGAGCTGTGTAATGGGGGCTCAGTCACTGAGCTTGTCAAAGGTCTACTCAGAT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GTGGCCAGCGGTTGGATGAAGCAATGATCTCATACATCTTGTACGGGGCCCTCTTGGGCCTTCAGCATTTGCAC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AACAACCGAATCATCCACCGTGATGTGAAGGGGAATAACATTCTTCTGACAACAGAAGGAGGAGTTAAGCTCGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGACTTTGGTGTTTCAGCTCAACTCACCAGTACACGTCTGCGGAGAAACACATCTGTTGGCACCCCGTTCTGGA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGGCCCCTGAGGTCATTGCCTGTGAGCAGCAGTATGACTCTTCCTATGACGCTCGCTGTGACGTCTGGTCCTTG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GGGATCACAGCTATTGAACTGGGGGATGGAGACCCTCCCCTCTTTGACATGCATCCTGTGAAAACACTCTTTAA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 GATTCCAAGAAATCCTCCACCTACTTTACTTCATCCAGAAAAATGGTGTGAAGAATTCAACCACTTTATTTCAC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 AGTGTCTTATTAAGGATTTTGAAAGGCGACCTTCCGTCACACATCTCCTTGACCACCCATTTATTAAAGGAGTA 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 CATGGAAAAGTTCTGTTTCTGCAAAAACAGCTGGCCAAGGTTCTCCAAGACCAGAAGCATCAAAATCCTGTTGC 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 TAAAACCAGGCATGAGAGGATGCATACCAGAAGACCTTATCATGTGGAAGATGCTGAAAAATACTGCCTTGAGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------ATGCATACCAGAAGACCTTATCATGTGGAAGATGCTGAAAAATACTGCCTTGAGG 55
Query 1037 ATGATTTGGTCAACCTAGAGGTTCTGGATGAGGATACAATTATCCATCAGTTGCAGAAACGTTATGCAGACTTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 ATGATTTGGTCAACCTAGAGGTTCTGGATGAGGATACAATTATCCATCAGTTGCAGAAACGTTATGCAGACTTG 129
Query 1111 CTAATTTACACATATGTTGGAGACATCTTAATTGCCTTAAACCCCTTCCAGAATCTAAGCATATACTCTCCACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 CTAATTTACACATATGTTGGAGACATCTTAATTGCCTTAAACCCCTTCCAGAATCTAAGCATATACTCTCCACA 203
Query 1185 GTTTTCCAGACTTTATCATGGGGTGAAACGCGCCTCCAATCCCCCCCACATATTTGCATCAGCAGATGCTGCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 GTTTTCCAGACTTTATCATGGGGTGAAACGCGCCTCCAATCCCCCCCACATATTTGCATCAGCAGATGCTGCTT 277
Query 1259 ACCAGTGCATGGTTACTCTCAGCAAAGACCAGTGCATTGTCATCAGCGGAGAGAGTGGCTCTGGGAAGACAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 ACCAGTGCATGGTTACTCTCAGCAAAGACCAGTGCATTGTCATCAGCGGAGAGAGTGGCTCTGGGAAGACAGAA 351
Query 1333 AGCGCCCACCTGATTGTTCAACATTTGACTTTCTTGGGAAAGGCCAATAATCAGACCTTGAGAGAGAAAATTCT 1406
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 AGCGCCCACCTGATTGTTCAGCATTTGACTTTCTTGGGAAAGGCCAATAATCAGACCTTGAGAGAGAAAATTCT 425
Query 1407 ACAAGTCAACTCCCTGGTGGAAGCCTTTGGGAACTCATGCACTGCCATCAATGACAACTCGAGCCGTTTTGGAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 ACAAGTCAACTCCCTGGTGGAAGCCTTTGGGAACTCATGCACTGCCATCAATGACAACTCGAGCCGTTTTGGAA 499
Query 1481 AATATCTGGAAATGATGTTTACACCAACTGGAGTTGTGATGGGGGCAAGAATCTCTGAATATCTCCTGGAAAAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 AATATCTGGAAATGATGTTTACACCAACTGGAGTTGTGATGGGGGCAAGAATCTCTGAATATCTCCTGGAAAAA 573
Query 1555 TCCAGAGTTATAAAACAGGCAGCGAGAGAGAAAAATTTTCATATATTTTACTATATTTATGCTGGTCTTCATCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 TCCAGAGTTATAAAACAGGCAGCGAGAGAGAAAAATTTTCATATATTTTACTATATTTATGCTGGTCTTCATCA 647
Query 1629 CCAAAAGAAGCTTTCTGATTTCAGACTTCCTGAGGAAAAACCTCCTAGGTACATAGCTGATGAAACTGGAAGGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 CCAAAAGAAGCTTTCTGATTTCAGACTTCCTGAGGAAAAACCTCCTAGGTACATAGCTGATGAAACTGGAAGGG 721
Query 1703 TGATGCACGACATAACTTCCAAGGAGTCTTACAGAAGACAATTCGAAGCAATTCAGCATTGCTTCAGGATTATA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 TGATGCACGACATAACTTCCAAGGAGTCTTACAGAAGACAATTCGAAGCAATTCAGCATTGCTTCAGGATTATA 795
Query 1777 GGGTTCACGGACAAAGAGGTGCACTCAGTGTACAGAATTTTGGCTGGGATTTTGAATATTGGGAACATTGAGTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 GGGTTCACGGACAAAGAGGTGCACTCAGTGTACAGAATTTTGGCTGGGATTTTGAATATTGGGAACATTGAGTT 869
Query 1851 CGCAGCTATTTCCTCTCAACATCAGACTGATAAAAGTGAGGTGCCCAATGCTGAAGCTTTGCAAAATGCTGCCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 CGCAGCTATTTCCTCTCAACATCAGACTGATAAAAGTGAGGTGCCCAATGCTGAAGCTTTGCAAAATGCTGCCT 943
Query 1925 CTGTTCTGTGCATTAGCCCTGAAGAGCTCCAGGAGGCCCTCACCTCCCACTGTGTGGTCACCCGGGGCGAGACC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 CTGTTCTGTGCATTAGCCCTGAAGAGCTCCAGGAGGCCCTCACCTCCCACTGTGTGGTCACCCGGGGCGAGACC 1017
Query 1999 ATCATCCGTGCCAACACTGTAGACAGGGCTGCGGACGTTCGAGACGCCATGTCCAAAGCCCTGTATGGGAGGCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 ATCATCCGTGCCAACACTGTAGACAGGGCTGCGGACGTTCGAGACGCCATGTCCAAAGCCCTGTATGGGAGGCT 1091
Query 2073 CTTCAGCTGGATTGTGAATCGCATTAATACACTCCTGCAGCCAGACGAAAACATATGTAGTGCAGGAGGTGGAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 CTTCAGCTGGATTGTGAATCGCATTAATACACTCCTGCAGCCAGACGAAAACATATGTAGTGCAGGAGGTGGAA 1165
Query 2147 TGAATGTGGGGATCTTGGATATCTTTGGATTCGAGAATTTTCAGAGAAATTCATTTGAGCAGCTCTGCATAAAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TGAATGTGGGGATCTTGGATATCTTTGGATTCGAGAATTTTCAGAGAAATTCATTTGAGCAGCTCTGCATAAAC 1239
Query 2221 ATCGCCAATGAGCAAATCCAGTACTATTTCAATCAGCATGTTTTTGCTCTTGAGCAGATGGAATATCAGAATGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 ATCGCCAATGAGCAAATCCAGTACTATTTCAATCAGCATGTTTTTGCTCTTGAGCAGATGGAATATCAGAATGA 1313
Query 2295 AGGCATTGATGCTGTACCCGTGGAATATGAGGACAACCGCCCGCTCTTGGACATGTTCCTCCAGAAACCCCTGG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 AGGCATTGATGCTGTACCCGTGGAATATGAGGACAACCGCCCGCTCTTGGACATGTTCCTCCAGAAACCCCTGG 1387
Query 2369 GACTGCTTGCACTTTTGGATGAGGAAAGTCGGTTTCCCCAAGCAACTGACCAGACCCTGGTTGATAAATTTGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 GACTGCTTGCACTTTTGGATGAGGAAAGTCGGTTTCCCCAAGCAACTGACCAGACCCTGGTTGATAAATTTGAA 1461
Query 2443 GATAATCTACGATGCAAATACTTCTGGAGGCCCAAAGGAGTGGAACTGTGCTTTGGCATTCAGCATTATGCTGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462 GATAATCTACGATGCAAATACTTCTGGAGGCCCAAAGGAGTGGAACTGTGCTTTGGCATTCAGCATTATGCTGG 1535
Query 2517 AAAGGTATTATATGATGCTTCTGGGGTTCTTGAGAAAAATAGAGACACTCTCCCTGCCGATGTGGTTGTGGTCC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1536 AAAGGTATTATATGATGCTTCTGGGGTTCTTGAGAAAAATAGAGACACTCTCCCTGCCGATGTGGTTGTGGTCC 1609
Query 2591 TGAGAACGTCAGAAAACATGCTTCTTCAGCAGCTCTTCTCAATCCCTCTGACCAAAACAGGTAATTTGGCCCAG 2664
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 TGAGAACGTCAGAAAACAAGCTTCTTCAGCAGCTCTTCTCAATCCCTCTGACCAAAACAGGTAATTTGGCCCAG 1683
Query 2665 ACAAGAGCTAGGATAACAGTGGCCTCAAGTTCTTTGCCTCCACATTTCAGTGCTGGGAAAGCCAAGGTGGACAC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684 ACAAGAGCTAGGATAACAGTGGCCTCAAGTTCTTTGCCTCCACATTTCAGTGCTGGGAAAGCCAAGGTGGACAC 1757
Query 2739 TCTGGAGGTGATACGGCATCCGGAAGAAACCACCAACATGAAGAGGCAAACTGTGGCTTCTTACTTCCGGTATT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 TCTGGAGGTGATACGGCATCCGGAAGAAACCACCAACATGAAGAGGCAAACTGTGGCTTCTTACTTCCGGTATT 1831
Query 2813 CTCTGATGGACCTGCTCTCCAAAATGGTGGTTGGACAGCCCCACTTTGTGCGCTGCATTAAACCCAATGATGAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 CTCTGATGGACCTGCTCTCCAAAATGGTGGTTGGACAGCCCCACTTTGTGCGCTGCATTAAACCCAATGATGAC 1905
Query 2887 CGAGAGGCCCTGCAGTTCTCTCGAGAGAGGGTGCTGGCCCAGCTCCGCTCCACAGGGATTCTGGAGACAGTCAG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906 CGAGAGGCCCTGCAGTTCTCTCGAGAGAGGGTGCTGGCCCAGCTCCGCTCCACAGGGATTCTGGAGACAGTCAG 1979
Query 2961 CATCCGCCGCCAGGGCTATTCCCACCGCATCCTTTTTGAAGAATTTGTGAAAAGGTATTATTACTTGGCATTCA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CATCCGCCGCCAGGGCTATTCCCACCGCATCCTTTTTGAAGAATTTGTGAAAAGGTATTATTACTTGGCATTCA 2053
Query 3035 CAGCACATCAAACACCTCTTGCTAGCAAAGAGAGCTGTGTGGCTATCTTGGAAAAGTCCAGATTAGATCACTGG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 CAGCACATCAAACACCTCTTGCTAGCAAAGAGAGCTGTGTGGCTATCTTGGAAAAGTCCAGATTAGATCACTGG 2127
Query 3109 GTGCTGGGAAAAACAAAGGTTTTTCTCAAATATTACCATGTTGAGCAATTAAATTTGCTGCTTCGAGAAGTCAT 3182
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128 GTACTGGGAAAAACAAAGGTTTTTCTCAAATATTACCATGTTGAGCAATTAAATTTGCTGCTTCGAGAAGTCAT 2201
Query 3183 AGGCAGAGTGGTTGTGCTGCAGGCATATACCAAGGGGTGGCTTGGAGCCAGGAGATACAAAAAGGTCAGAGAGA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2202 AGGCAGAGTGGTTGTGCTGCAGGCATATACCAAGGGGTGGCTTGGAGCCAGGAGATACAAAAGGGTCAGAGAGA 2275
Query 3257 AGAGAGAGAAGGGAGCCATTGCCATCCCAGTCAGCCTTGGAGAGGATATGATGCTCGGAGGAAATTTAAGAAAA 3330
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 AGAGAGAGAAGGGAGCCATTGCCAT-CCAGTCAGCC-TGGAGAGGATATGATGCTCGGAGGAAATTTAAGAAAA 2347
Query 3331 TAAGCAACAGAAGGAATGAGTCTGCTGCTCATAATCAAGCAGGGGACACTTCAAACCAAAGCAGTGGGCCACAT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2348 TAAGCAACAGAAGGAATGAGTCTGCTGCTCATAATCAAGCAGGGGACACTTCAAACCAAAGCAGTGGGCCACAT 2421
Query 3405 TCCCCCGTCGCAGCAGGTACGAGGGGAAGTGCCGAGGTTCAAGACTGCAGCGAGCCTGGTGACCATAAAGTTCT 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2422 TCCCCCGTCGCAGCAGGTACGAGGGGAAGTGCCGAGGTTCAAGACTGCAGCGAGCCTGGTGACCATAAAGTTCT 2495
Query 3479 CAGGGGCTCTGTACATCGTAGGAGCCATTCACAAGCAGAATCCAACAATGGCCGTACACAGACTTCAAGCAACT 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2496 CAGGGGCTCTGTACATCGTAGGAGCCATTCACAAGCAGAATCCAACAATGGCCGTACACAGACTTCAAGCAACT 2569
Query 3553 CTCCTGCTGTCACAGAGAAAAATG-------------------------------------------------- 3576
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 CTCCTGCTGTCACAGAGAAAAATGGGTCTCATTCGTGTGACATACAGACAAGGGCAAGAGAAGAGCATCCCAGG 2643
Query 3577 ----------------------------------------------------------GGCATTCACAAGCCCA 3592
||||||||||||||||
Sbjct 2644 CAGGAGAAACAAGAGTGGGCCATAGCCAGAGGCAGGATATGCAGAGCCATTCTTGGAAGGCATTCACAAGCCCA 2717
Query 3593 GAGTTCTCCAAAAGGGTGCGATATCTTCGCAGGACATGCAAACAAGCACTCGGTTTCTGGGACTGATTTGCTGT 3666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2718 GAGTTCTCCAAAAGGGTGCGATATCTTCGCAGGACATGCAAACAAGCACTCGGTTTCTGGGACTGATTTGCTGT 2791
Query 3667 CTTCTCGGATATGCCATCCTGCTCCAGATCAGCAAGGATTGAGTCTCTGGGGAGCCCCTCAAAAGCCTGGTTCA 3740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2792 CTTCTCGGATATGCCATCCTGCTCCAGATCAGCAAGGATTGAGTCTCTGGGGAGCCCCTCAAAAGCCTGGTTCA 2865
Query 3741 GAAAATGGTCTTGCACAGAAGCATCGAACACCTCGCCGACGATGTCAGCAGCCCAAAATGCTGAGTAGCCCTGA 3814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2866 GAAAATGGTCTTGCACAGAAGCATCGAACACCTCGCCGACGATGTCAGCAGCCCAAAATGCTGAGTAGCCCTGA 2939
Query 3815 GGACACCATGTACTATAACCAGTTAAATGGAACTCTAGAATATCAAGGGAGCAAGAGGAAGCCAAGAAAACTTG 3888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 GGACACCATGTACTATAACCAGTTAAATGGAACTCTAGAATATCAAGGGAGCAAGAGGAAGCCAAGAAAACTTG 3013
Query 3889 GCCAAATCAAAGTACTTGATGGGGAAGATGAATATTACAAATCTCTGTCACCAGTGGACTGTATCCCTGAGGAG 3962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3014 GCCAAATCAAAGTACTTGATGGGGAAGATGAATATTACAAATCTCTGTCACCAGTGGACTGTATCCCTGAGGAG 3087
Query 3963 AACAACTCAGCCCACCCTTCCTTTTTTTCTTCATCCTCAAAAGGAGACTCTTTTGCTCAACAT 4025
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3088 AACAACTCAGCCCACCCTTCCTTTTTTTCTTCATCCTCAAAAGGAGACTCTTTTGCTCAACAT 3150
