Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15300
- Subject:
- XM_017006212.1
- Aligned Length:
- 3438
- Identities:
- 2983
- Gaps:
- 450
Alignment
Query 1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG 370
|| |||.||||| |||||| || ||..||.| ||||||
Sbjct 1 ---------------------AT---GTTACTTCT--CCTCTG--GA-----TGTACATG---CTGCAG----- 33
Query 371 TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA 444
||||| |||| |.|||
Sbjct 34 -CTCCA---------------------------------------------TAGG-----------AGCCA--- 47
Query 445 AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 -----GTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT 116
Query 519 GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA 190
Query 593 TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT 264
Query 667 TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC 338
Query 741 TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC 412
Query 815 CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT 486
Query 889 TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC 560
Query 963 CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG 634
Query 1037 CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC 708
Query 1111 CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT 782
Query 1185 AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA 856
Query 1259 TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 930
Query 1333 TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA 1004
Query 1407 CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG 1078
Query 1481 TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 1152
Query 1555 AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT 1226
Query 1629 AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227 AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC 1300
Query 1703 TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGA----------------------------------------------- 1729
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGTCTACCCACGGATAGCGCCGGCATTTTGGCACTACCTGCGGGTA 1374
Query 1730 -AAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC 1802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 GAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC 1448
Query 1803 AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT 1522
Query 1877 TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523 TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT 1596
Query 1951 GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC 1670
Query 2025 CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT 1744
Query 2099 ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA 2172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA 1818
Query 2173 ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA 2246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1819 ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA 1892
Query 2247 AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG 2320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG 1966
Query 2321 AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC 2040
Query 2395 CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA 2114
Query 2469 TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA 2542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA 2188
Query 2543 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG 2616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2189 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG 2262
Query 2617 CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA 2690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA 2336
Query 2691 TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG 2764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG 2410
Query 2765 AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA 2838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2411 AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA 2484
Query 2839 TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA 2912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485 TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA 2558
Query 2913 TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC 2986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2559 TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC 2632
Query 2987 CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT 2706
Query 3061 GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC 3134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2707 GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC 2780
Query 3135 AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG 3208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781 AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG 2854
Query 3209 GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2855 GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC 2928
Query 3283 ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA 3356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA 3002
Query 3357 CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3003 CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 3036