Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15307
- Subject:
- XM_006719808.4
- Aligned Length:
- 2270
- Identities:
- 1543
- Gaps:
- 701
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGTTTCGGCCTGGGGCGGCGGGGGCGGCCCAGAAAAGGCCTAGCGTCCTGGGCTGTGTGGGTGTAGCGTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGGGCGCGTCGGTCTCTATGGCAACGCTCCACACGCGGAGGTCGGGTACGGTTATCTGTGGCCACAAAGAAAG 148
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGGAT 6
||||||
Sbjct 149 TTATTTGTCTCTGTCTTGGCAAGGCTGGGAGGAAAGTTTTAGCTAAGAAACTCAGCCCATTGGAGACCATGGAT 222
Query 7 AAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAG 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAG 296
Query 81 CAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAG 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAG 370
Query 155 TGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTG 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTG 444
Query 229 TTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAG 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAG 518
Query 303 TGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGATATTAC 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGATATTAC 592
Query 377 ACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATA 666
Query 451 GCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGAT 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGAT 740
Query 525 CTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACAC 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACAC 814
Query 599 TTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATA 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATA 888
Query 673 TCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCT-CTCGAGACCGA-CAT- 743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 889 TCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCTCCTCGAGACCGACCATC 962
Query 744 CATAAATTCCATTTTGAAA--GCCC-TTTTAGAGAATCTTATTCCC-AATATTTGACTCCTGGAGGTCATTCAG 813
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 963 CATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAAATATTTGACTCCT-GAGGTCATTCAG 1035
Query 814 GAGGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAA 887
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GAAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAA 1109
Query 888 GTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGA 1183
Query 962 ATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAA 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAA 1257
Query 1036 AGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGC 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGC 1331
Query 1110 CCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATG 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATG 1405
Query 1184 GTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGGTCCACAATATAAGTTTGAAAGT 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||| ||||||||
Sbjct 1406 GTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGCTCAACAATATAAG-TTGAAAGT 1478
Query 1258 GGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTCTTGCCGAGCCAAATTACAACCAAGAGACAAGAGCTAGNAAGTAAT 1331
||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||| ||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1479 GGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACC-AGAGACAAGAGCTAAGAAGTAAT 1551
Query 1332 GGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTT 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTT 1625
Query 1406 AGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAGA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1626 AGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAAA 1699
Query 1480 ACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTGTCCATCAAGATGCATCTGAGGGA 1553
.|| ||| |.||||..||||
Sbjct 1700 GCT---------GTC---AGACCTCATTGG-------------------------------------------- 1717
Query 1554 GAAGCACCTGTGCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCAGA--ACACAAAGGAAAGTAAAAAT 1625
||| |.||| ||.|..|.|..|| ||||| ||| ||||
Sbjct 1718 --AGC-----TTCAG----TTTATTATGGTTT-------ATGAG-----AGACTACAC---------------- 1752
Query 1626 CCAGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAGACAAATGTATTTCTGATGAAAA 1699
|||.|||.|||| ||.|||| |
Sbjct 1753 ----------------AAGATAATAAGG--------------------------------ATATCTG------A 1772
Query 1700 CATCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTTGAGGATGGCATGAAGTTTAAGG 1773
.||.||| ||||| .|||.|| |||
Sbjct 1773 GATTCTC----AGGAA-TGGCTAT---TAT-------------------------------------------- 1794
Query 1774 AATATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAAACTTCACTGCCCAGAAGCAGGG 1847
Sbjct 1795 -------------------------------------------------------------------------- 1794
Query 1848 TTTTCCACGCAGACTGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCGCCTCAGACTCTGCTGCA 1921
Sbjct 1795 -------------------------------------------------------------------------- 1794
Query 1922 GATGATGGCAGTGGCCGACATCACCTCCACCTGCCCCACGGGGCCTGACAGTGAGTCTGTGCTTAGCGTCAGTC 1995
Sbjct 1795 -------------------------------------------------------------------------- 1794
Query 1996 GTCAGGAAGGGAAGACCAAGGACCCGTACAGCCCAGTGCTCATCCTGATG 2045
Sbjct 1795 -------------------------------------------------- 1794
