Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15307
- Subject:
- XM_011535066.2
- Aligned Length:
- 2271
- Identities:
- 1854
- Gaps:
- 406
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGTTTCGGCCTGGGGCGGCGGGGGCGGCCCAGAAAAGGCCTAGCGTCCTGGGCTGTGTGGGTGTAGCGTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGGGCGCGTCGGTCTCTATGGCAACGCTCCACACGCGGAGGTCGGGTACGGTTATCTGTGGCCACAAAGAAAG 148
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGGAT 6
||||||
Sbjct 149 TTATTTGTCTCTGTCTTGGCAAGGCTGGGAGGAAAGTTTTAGCTAAGAAACTCAGCCCATTGGAGACCATGGAT 222
Query 7 AAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAG 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCATACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAG 296
Query 81 CAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAG 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACAAGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAG 370
Query 155 TGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTG 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCAATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTG 444
Query 229 TTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAG 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATCAATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAG 518
Query 303 TGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGATATTAC 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAAACATATTCATGACAGGAAGATATTAC 592
Query 377 ACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGGTGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATA 666
Query 451 GCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGAT 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGAACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGAT 740
Query 525 CTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACAC 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGGCTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACAC 814
Query 599 TTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATA 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGATTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATA 888
Query 673 TCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCT-CTCGAGACCGA-CAT- 743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 889 TCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTTCAAGTATCTCCTCGAGACCGACCATC 962
Query 744 CATAAATTCCATTTTGAAA--GCCC-TTTTAGAGAATCTTATTCCC-AATATTTGACTCCTGGAGGTCATTCAG 813
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 963 CATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAAATATTTGACTCCT-GAGGTCATTCAG 1035
Query 814 GAGGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAA 887
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GAAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCTCGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAA 1109
Query 888 GTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATCAAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGA 1183
Query 962 ATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAA 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGAAGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAA 1257
Query 1036 AGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGC 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCTCAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGC 1331
Query 1110 CCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATG 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGAGGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATG 1405
Query 1184 GTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGGTCCACAATATAAGTTTGAAAGT 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||| ||||||||
Sbjct 1406 GTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTGAAGCTCAACAATATAAG-TTGAAAGT 1478
Query 1258 GGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTCTTGCCGAGCCAAATTACAACCAAGAGACAAGAGCTAGNAAGTAAT 1331
||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||| ||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1479 GGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAACC-AGAGACAAGAGCTAAGAAGTAAT 1551
Query 1332 GGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTT 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATGAAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTT 1625
Query 1406 AGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAGA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 AGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAAGAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAGA 1699
Query 1480 ACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTGTCCATCAAGATGCATCTGAGGGA 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 ACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGCCTGTCCATCAAGATGCATCTGAGGGA 1773
Query 1554 GAAGCACCTGTGCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCAGAACACAAAGGAAAGTAAAAATCC 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GAAGCACCTGTGCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTTCAGAACACAAAGGAAAGTAAAAATCC 1847
Query 1628 AGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAGACAAATGTATTTCTGATGAAAACA 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 AGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTTAGACAAATGTATTTCTGATGAAAACA 1921
Query 1702 TCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTTGAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAA 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCTTTGAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAA 1995
Query 1776 TATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAAACTTCACTGCCCAGAAGCAGGGTT 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 TATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAAAAACTTCACTGCCCAGAAGCAG---- 2065
Query 1850 TTCCACGCAGAC---TGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCGCCTCAGACTCTGCTGC 1920
.||||.| ||| |||.|| |||| ||.
Sbjct 2066 CTCCATG--GACAAGTGTTGC-------------------CAGT---ATC------------------------ 2091
Query 1921 AGATGATGGCAGTGGCCGACATCACCTCCACCTGCCCCACGGGGCCTGACAGTGAGTCTGTGCTTAGCGTCAGT 1994
Sbjct 2092 -------------------------------------------------------------------------- 2091
Query 1995 CGTCAGGAAGGGAAGACCAAGGACCCGTACAGCCCAGTGCTCATCCTGATG 2045
Sbjct 2092 --------------------------------------------------- 2091