Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15385
• Subject: NM_003992.4
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1401
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGCTCCCCTGAACCAGACCCGTACCTGAGCTACCGATGGAAGAGGAGGAGGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGCTCCCCTGAACCAGACCCGTACCTGAGCTACCGATGGAAGAGGAGGAGGTC  74

Query   75  CTACAGTCGGGAACATGAAGGGAGACTGCGATACCCGTCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGAAGATCTCGGTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTACAGTCGGGAACATGAAGGGAGACTGCGATACCCGTCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGAAGATCTCGGTCCA  148

Query  149  GAAGCCATGACCGCCTGCCCTACCAGAGGAGGTACCGGGAGCGCCGTGACAGCGATACATACCGGTGTGAAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAGCCATGACCGCCTGCCCTACCAGAGGAGGTACCGGGAGCGCCGTGACAGCGATACATACCGGTGTGAAGAG  222

Query  223  CGGAGCCCATCCTTTGGAGAGGACTACTATGGACCTTCACGTTCTCGTCATCGTCGGCGATCGCGGGAGAGGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGAGCCCATCCTTTGGAGAGGACTACTATGGACCTTCACGTTCTCGTCATCGTCGGCGATCGCGGGAGAGGGG  296

Query  297  GCCATACCGGACCCGCAAGCATGCCCACCACTGCCACAAACGCCGCACCAGGTCTTGTAGCAGCGCCTCCTCGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCATACCGGACCCGCAAGCATGCCCACCACTGCCACAAACGCCGCACCAGGTCTTGTAGCAGCGCCTCCTCGA  370

Query  371  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGTCACCTGGTGTGCCGGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGTCACCTGGTGTGCCGGATC  444

Query  445  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATG-------------------------------------------------  469
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  445  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATGAGATTGTGGGGAACCTGGGTGAAGGCACCTTTGGCAAGGTGGTGGAGTG  518

Query  470  --------------------AGTCTCAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGCAACGTGGGCAAGTACCGGGAGGCTG  523
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGGACCATGCCAGAGGGAAGTCTCAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGCAACGTGGGCAAGTACCGGGAGGCTG  592

Query  524  CCCGGCTAGAAATCAACGTGCTCAAAAAAATCAAGGAGAAGGACAAAGAAAACAAGTTCCTGTGTGTCTTGATG  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCGGCTAGAAATCAACGTGCTCAAAAAAATCAAGGAGAAGGACAAAGAAAACAAGTTCCTGTGTGTCTTGATG  666

Query  598  TCTGACTGGTTCAACTTCCACGGTCACATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGACTGGTTCAACTTCCACGGTCACATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  740

Query  672  GAAGGAGAATAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGCCACGCCCTTA  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGGAGAATAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGCCACGCCCTTA  814

Query  746  GATTTCTGCATGAGAATCAGCTGACCCATACAGACTTGAAACCAGAGAACATCCTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATTTCTGCATGAGAATCAGCTGACCCATACAGACTTGAAACCAGAGAACATCCTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  888

Query  820  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGTGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCTGACTT  893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGTGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCTGACTT  962

Query  894  TGGCAGTGCCACATTTGACCATGAGCACCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTATCGCCCGCCTGAGGTGA  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGCAGTGCCACATTTGACCATGAGCACCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTATCGCCCGCCTGAGGTGA  1036

Query  968  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGACGTCTGGAGCATTGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGGGGC  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGACGTCTGGAGCATTGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGGGGC  1110

Query 1042  TTCACACTCTTCCAGACCCACGAAAACCGAGAGCACCTGGTGATGATGGAGAAGATCCTAGGGCCCATCCCATC  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCACACTCTTCCAGACCCACGAAAACCGAGAGCACCTGGTGATGATGGAGAAGATCCTAGGGCCCATCCCATC  1184

Query 1116  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTAGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTAGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1258

Query 1190  ACGGCCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTCCAAGACTCCCTGGAGCACGTGCAG  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACGGCCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTCCAAGACTCCCTGGAGCACGTGCAG  1332

Query 1264  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAATTTGACCCTGCCCAGCGCATCACACTGGCCGAGGCCCTGCTGCA  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAATTTGACCCTGCCCAGCGCATCACACTGGCCGAGGCCCTGCTGCA  1406

Query 1338  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACACCAGCCGCAACCCAAGCAGA  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACACCAGCCGCAACCCAAGCAGA  1470