Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15385
• Subject: XM_006510739.3
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1295
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGCTCCCCTGAACCAGACCCGTACCTGAGCTACCGATGGAAGAGGAGGAGGTC  74
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGTTCCCCAGAGCCAGACCCATACCTGAGCTACCGCTGGAAGAGGAGGCGGTC  74

Query   75  CTACAGTCGGGAACATGAAGGGAGACTGCGATACCCGTCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGAAGATCTCGGTCCA  148
            .|||||||||||.||||||||..||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  TTACAGTCGGGAGCATGAAGGTCGACTACGATACCCATCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGGAGATCACGGTCCA  148

Query  149  GAAGCCATGACCGCCTGCCCTACCAGAGGAGGTACCGGGAGCGCCGTGACAGCGATACATACCGGTGTGAAGAG  222
            ||||||||||.||..|.|||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  GAAGCCATGATCGTATACCCTACCAGCGGAGGTACCGGGAACACCGTGACAGTGATACGTATCGGTGTGAAGAG  222

Query  223  CGGAGCCCATCCTTTGGAGAGGACTACTATGGACCTTCACGTTCTCGTCATCGTCGGCGATCGCGGGAGAGGGG  296
            |||||||||||.|||||||||||||.||||||..|||||||||||||.|||||..|.||.||.||.|||||||.
Sbjct  223  CGGAGCCCATCTTTTGGAGAGGACTGCTATGGGTCTTCACGTTCTCGACATCGGAGACGGTCACGAGAGAGGGC  296

Query  297  GCCATACCGGACCCGCAAGCATGCCCACCACTGCCACAAACGCCGCACCAGGTCTTGTAGCAGCGCCTCCTCGA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GCCGTACCGTACCCGCAAGCATGCCCACCACTGTCACAAACGCCGTACCAGGTCTTGTAGCAGTGCTTCCTCGA  370

Query  371  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGTCACCTGGTGTGCCGGATC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGCCACCTGGTGTGCCGGATC  444

Query  445  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATG-------------------------------------------------  469
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  445  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATGAGATCGTGGGGAACCTGGGTGAAGGCACCTTTGGCAAGGTGGTGGAGTG  518

Query  470  --------------------AGTCTCAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGCAACGTGGGCAAGTACCGGGAGGCTG  523
                                ||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  CTTGGACCATGCCAGAGGGAAGTCACAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGTAATGTGGGCAAGTATCGGGAAGCTG  592

Query  524  CCCGGCTAGAAATCAACGTGCTCAAAAAAATCAAGGAGAAGGACAAAGAAAACAAGTTCCTGTGTGTCTTGATG  597
            |.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct  593  CTCGTCTAGAAATTAATGTTCTCAAGAAAATCAAGGAGAAAGACAAGGAAAATAAGTTCCTTTGTGTCCTGATG  666

Query  598  TCTGACTGGTTCAACTTCCACGGTCACATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  671
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGACTGGTTCAACTTCCATGGTCATATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  740

Query  672  GAAGGAGAATAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGCCACGCCCTTA  745
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  GAAGGAGAACAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGTCATGCCCTTA  814

Query  746  GATTTCTGCATGAGAATCAGCTGACCCATACAGACTTGAAACCAGAGAACATCCTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  819
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATTTCTACACGAGAACCAGCTGACCCACACAGACTTGAAGCCAGAGAACATCTTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  888

Query  820  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGTGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCTGACTT  893
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGCGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCAGACTT  962

Query  894  TGGCAGTGCCACATTTGACCATGAGCACCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTATCGCCCGCCTGAGGTGA  967
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  TGGCAGTGCCACGTTTGACCATGAACATCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTACCGCCCACCTGAGGTGA  1036

Query  968  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGACGTCTGGAGCATTGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGGGGC  1041
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGATGTCTGGAGTATCGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGTGGC  1110

Query 1042  TTCACACTCTTCCAGACCCACGAAAACCGAGAGCACCTGGTGATGATGGAGAAGATCCTAGGGCCCATCCCATC  1115
            ||.|||||||||||||||||.|||||..||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1111  TTTACACTCTTCCAGACCCATGAAAATAGAGAACACTTGGTTATGATGGAGAAGATTCTAGGACCCATCCCATC  1184

Query 1116  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTAGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1189
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTGGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1258

Query 1190  ACGGCCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTCCAAGACTCCCTGGAGCACGTGCAG  1263
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  ATGGGCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTGCAGGACTCCCTGGAGCATGTGCAG  1332

Query 1264  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAATTTGACCCTGCCCAGCGCATCACACTGGCCGAGGCCCTGCTGCA  1337
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||||.||.|||.|||||||
Sbjct 1333  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAGTTCGACCCTGCTCAGCGCATCACATTGGCAGAAGCCTTGCTGCA  1406

Query 1338  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACACCAGCCGCAACCCAAGCAGA  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||
Sbjct 1407  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACAGCAGCCGTAACCCCAGCAGA  1470