Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15394
• Subject: XM_011240427.2
• Aligned Length: 1764
• Identities: 1281
• Gaps: 363

Alignment

Query    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA  74

Query   75  TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG  148

Query  149  ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC  222
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC  222

Query  223  GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296

Query  297  GAAGACAGG-----------------------------------------------------------------  305
            ||||||.||                                                                 
Sbjct  297  GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC  370

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  371  GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA  444

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  445  CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA  518

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  519  GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGACCATTTTGGAAGAGGATGTGGAAGATCCCGTGT  592

Query  306  ----------------------------------------------------------------------GGTT  309
                                                                                  ||||
Sbjct  593  ACCAGTACATTGTGTTTGAGGCTGGACATGAGCCAATCCGTGATCCTGAAACAGAAGAGAACATTTACCAGGTT  666

Query  310  CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATGATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATGGCTATTCGTTTGA  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||.||.|..||.|.||
Sbjct  667  CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATGATGTGCCAAAAAGTCAACC------TAATAGCCAGCCGCTGGA  734

Query  384  GGATTTTGAAGAACGGTTTGCTGCAGCCACCCCGAACAGAAACCTGCCCACAGACTTTGATGAGATTTTTGAGG  457
            ||||||.||....||.|||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|..||||||||||||.||.|.||||
Sbjct  735  GGATTTCGACTCGCGCTTTGCCGCAGCCACGCCGAACAGGAACCTGTCAATGGACTTTGATGAGCTTCTCGAGG  808

Query  458  CAACGAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACT  531
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||
Sbjct  809  CAACCAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACT  882

Query  532  CCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTC  605
            ||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.||
Sbjct  883  CCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGTCGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTC  956

Query  606  TGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTC  679
            |.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  957  TATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCC  1030

Query  680  AGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAG  753
            ||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1031  AGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCATGGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAG  1104

Query  754  CCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCC  827
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1105  CCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTCCTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCC  1178

Query  828  GCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCC  901
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  GCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCC  1252

Query  902  TTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGC  975
            ||||.||||||||||||||||.||||||..||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1253  TTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGCCAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGG  1326

Query  976  AAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCT  1049
            ||.||..||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1327  AAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCCAGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCT  1400

Query 1050  CACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATG  1123
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  GACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATG  1474

Query 1124  ACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCA  1197
            ||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  ACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCA  1548

Query 1198  GCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGA  1271
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct 1549  GCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCATCAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGA  1622

Query 1272  AGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTG  1345
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1623  AGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAAGAACAAGAAGCACCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTG  1696

Query 1346  ATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC  1407
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1697  ATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAAGACGGTAGC  1758