Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15394
- Subject:
- XM_011240435.2
- Aligned Length:
- 1573
- Identities:
- 1269
- Gaps:
- 185
Alignment
Query 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA 74
Query 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG 148
Query 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC 222
Query 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
Query 297 GAAGACAGGGG---TTC----CCACCA-GC----CA--AAA-------------GAAGGA------AGGT---- 333
||||||.|||| ||| .||||| || || ||| |||||| ||.|
Sbjct 297 GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC 370
Query 334 --------------GTTT---------------AT----GATGTG-------CCAAAAAG----------TCAA 357
|||| || |||.|| |.|||.|| |.||
Sbjct 371 GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA 444
Query 358 CCTGTAAGTAATGG-CT------AT-TCGTT-----------TGAG---------------GATTTTGAAGAA- 396
|||||.| |..||| || || ||.|| |||| ||.||.|||.||
Sbjct 445 CCTGTTA-TCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAA 517
Query 397 -----------------CGGTTT------GCTG-----CAG----CCACC--CCGAACAGA---AACCTGCCCA 433
|.||.| |||| ||| ||||| || ||.||| ||..||
Sbjct 518 AGGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGGTTCCCACCAGCC-AAAAGAAGGAAGGTG---- 586
Query 434 CAGACTTTGATGAGATTTTTGAGGCAACGAAG-------GCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACATGTC 500
||.|||| ||.|.||| .||| ||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 587 ------TTTATGA------TGTGCCAA-AAAGTCAACCTGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGAGACATGTC 647
Query 501 CACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTCAGA 574
|||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.||||
Sbjct 648 CACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGTCGTCGTCCCAGA 721
Query 575 CCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTTGCA 648
|.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 722 CGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTATGTCGCT 795
Query 649 ATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCAGCC 722
||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 796 ATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCATGGGTGCTCAGCC 869
Query 723 ACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGC 796
|||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 870 ACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTCCTGCCACCCAGC 943
Query 797 AGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTGCCA 870
|..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 944 AAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTAGCA 1017
Query 871 GCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAGTCC 944
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||
Sbjct 1018 GCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGCCAGGTCAAGTCC 1091
Query 945 ACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCG 1018
|||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1092 ACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCCAGCCTCCACCCG 1165
Query 1019 TGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTC 1092
|.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTC 1239
Query 1093 GGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTCTAC 1166
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 GGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCCTGTGACTTCTAC 1313
Query 1167 CACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCCATG 1240
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1314 CACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCATCAGCATCCCACG 1387
Query 1241 CCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCT 1314
.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1388 TCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAAGAACAAGAAGCA 1461
Query 1315 CCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAATAT 1388
||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1462 CCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTGATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAGTGGTGATAATAT 1535
Query 1389 AAGTCCACAGGCCGGTAGC 1407
|||||||||.|.|||||||
Sbjct 1536 AAGTCCACAAGACGGTAGC 1554