Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15412
• Subject: XM_011530001.2
• Aligned Length: 2010
• Identities: 1797
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74

Query   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACC---CAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTG  145
            |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTG  148

Query  146  ATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCT  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCT  222

Query  220  CCCACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTA  296

Query  294  TGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTG  370

Query  368  CTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAG  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  371  CTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACA------------------------------  414

Query  442  ACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTA  515
                                                                                      
Sbjct  415  --------------------------------------------------------------------------  414

Query  516  TCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCT  589
                                                                            ||||||||||
Sbjct  415  ----------------------------------------------------------------AGCTATTCCT  424

Query  590  CTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGA  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  CTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGA  498

Query  664  CAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  CAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATC  572

Query  738  CTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  CTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACC  646

Query  812  ACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  ACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGT  720

Query  886  GGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGG  794

Query  960  ACGCGGTGGAATGG---GCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAG  1030
            ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  ACGCGGTGGAATGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAG  868

Query 1031  ATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAAT  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  ATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAAT  942

Query 1105  GACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGG  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  GACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGG  1016

Query 1179  GCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAG  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  GCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAG  1090

Query 1253  ACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCC  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091  ACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCC  1164

Query 1327  CTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACC  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165  CTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACC  1238

Query 1401  ACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239  ACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAG  1312

Query 1475  ATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCAC  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313  ATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCAC  1386

Query 1549  CGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCC---------------------------------------GGGTTG  1583
            |||||||||||||||||||||||||||||                                       ||||||
Sbjct 1387  CGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCTTCAATTGGTGATTTCTGCTGTGATGTAATTGTATGCAGGGGTTG  1460

Query 1584  TGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGC  1657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461  TGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGC  1534

Query 1658  CACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTC  1731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535  CACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTC  1608

Query 1732  ATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCG  1805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609  ATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCG  1682

Query 1806  GGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAAC  1879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683  GGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAAC  1756

Query 1880  AGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGA  1953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757  AGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGA  1830

Query 1954  GATCGGCCCTAC  1965
            ||||||||||||
Sbjct 1831  GATCGGCCCTAC  1842