Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15514
• Subject: NM_001322967.2
• Aligned Length: 1317
• Identities: 1316
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTTTCCAAACTAGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTTCCAAACTAGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC  74

Query   75  TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT  148

Query  149  ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAAAGGTATTTACTTATGGGATGTAGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAAAGGTATTTACTTATGGGATGTAGAA  222

Query  223  GGCAGAAAATATTTTGACTTCCTGAGTTCTTACAGTGCTGTCAACCAAGGGCATTGTCACCCCAAGATTGTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCAGAAAATATTTTGACTTCCTGAGTTCTTACAGTGCTGTCAACCAAGGGCATTGTCACCCCAAGATTGTGAA  296

Query  297  TGCTCTGAAGAGTCAAGTGGACAAATTGACCTTAACATCTAGAGCTTTCTATAATAACGTACTTGGTGAATATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTCTGAAGAGTCAAGTGGACAAATTGACCTTAACATCTAGAGCTTTCTATAATAACGTACTTGGTGAATATG  370

Query  371  AGGAGTATATTACTAAACTTTTCAACTACCACAAAGTTCTTCCTATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGTATATTACTAAACTTTTCAACTACCACAAAGTTCTTCCTATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT  444

Query  445  GCCTGTAAACTAGCTCGTAAGTGGGGCTATACCGTGAAGGGCATTCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCTGTAAACTAGCTCGTAAGTGGGGCTATACCGTGAAGGGCATTCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC  518

Query  519  AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG  592

Query  593  GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA  666

Query  667  AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT  740

Query  741  GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA  814

Query  815  CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG  888

Query  889  GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC  962

Query  963  CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG  1036

Query 1037  CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC  1110

Query 1111  GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAATGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT  1184
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAACGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT  1184

Query 1185  ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA  1258

Query 1259  TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTGTCTTTC  1317
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTGTCTTTC  1317