Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15514
- Subject:
- NM_001322971.2
- Aligned Length:
- 1317
- Identities:
- 995
- Gaps:
- 321
Alignment
Query 1 ATGTTTTCCAAACTAGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTTCCAAACTAGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC 74
Query 75 TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT 148
Query 149 ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAAAGGTATTTACTTATGGGATGTAGAA 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAA------------------------- 197
Query 223 GGCAGAAAATATTTTGACTTCCTGAGTTCTTACAGTGCTGTCAACCAAGGGCATTGTCACCCCAAGATTGTGAA 296
Sbjct 198 -------------------------------------------------------------------------- 197
Query 297 TGCTCTGAAGAGTCAAGTGGACAAATTGACCTTAACATCTAGAGCTTTCTATAATAACGTACTTGGTGAATATG 370
Sbjct 198 -------------------------------------------------------------------------- 197
Query 371 AGGAGTATATTACTAAACTTTTCAACTACCACAAAGTTCTTCCTATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT 444
Sbjct 198 -------------------------------------------------------------------------- 197
Query 445 GCCTGTAAACTAGCTCGTAAGTGGGGCTATACCGTGAAGGGCATTCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC 518
Sbjct 198 -------------------------------------------------------------------------- 197
Query 519 AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 198 AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG 271
Query 593 GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA 345
Query 667 AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT 419
Query 741 GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA 493
Query 815 CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG 567
Query 889 GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568 GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC 641
Query 963 CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG 715
Query 1037 CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC 789
Query 1111 GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAATGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT 1184
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAACGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT 863
Query 1185 ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA 937
Query 1259 TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTGTCTTTC 1317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTGTCTTTC 996