Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_15607
Subject:
NM_001243231.2
Aligned Length:
667
Identities:
618
Gaps:
42

Alignment

Query   1  MHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDG  74
                                                     .......|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------MEEDSRDVEDRSSSGSWGNGGHPSPSRNYGDG  32

Query  75  TPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERGSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQY  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  33  TPYDHMTSRDLGSHDNLSPPFVNSRIQSKTERGSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPTKPGSQY  106

Query 149  YQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDGHH  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107  YQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDGHH  180

Query 223  SSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181  SSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGNSSHIPQSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRSGTNHYSTSSC  254

Query 297  TPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQAS  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255  TPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQAS  328

Query 371  SSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329  SSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLSA  402

Query 445  NRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403  NRHSLMVGTHREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDDE  476

Query 519  GDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQ  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477  GDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDEDLTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQ  550

Query 593  LHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQ  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551  LHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSEPPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQ  624

Query 667  M  667
           |
Sbjct 625  M  625