Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15672
• Subject: XM_017028138.2
• Aligned Length: 1524
• Identities: 1428
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGACGATATTGATATTGAAGCAATGCTTGAGGCTCCTTACAAGAAGGATGAGAACAAGTTGAGCAGTGC  74

Query   75  CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACGGCCATGAAGAACGTAGCAAAAAGAGGAAAAAAAGCAAGAGCAGAAGTCGTAGTCATGAACGAAAGAGAA  148

Query  149  GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAAAGTAAGGAACGGAAGCGAAGTAGAGACAGAGAAAGGAAAAAGAGCAAAAGCCGTGAAAGAAAGCGAAGT  222

Query  223  AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAGCAAAGAGAGGCGACGGAGCCGCTCAAGAAGTCGAGATCGAAGATTTAGAGGCCGCTACAGAAGTCCTTA  296

Query  297  CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGACGACGTTCCCGAAGCAAAAGTCCATTCAGAAAAGACAAGAGCCCTGTGAGAGAACCTATTGATAATTTAA  370

Query  371  CTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCTGAGGAAAGAGATGCAAGGACAGTCTTCTGTATGCAGCTGGCGGCAAGAATTCGACCAAGGGATTTGGAA  444

Query  445  GAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGTTTTTCTCTACAGTAGGAAAGGTTCGAGATGTGAGGATGATTTCTGACAGAAATTCAAGACGTTCCAAAGG  518

Query  519  AATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATTGCTTATGTGGAGTTCGTCGATGTTAGCTCAGTGCCTCTAGCAATAGGATTAACTGGCCAACGAGTTTTAG  592

Query  593  GCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGTGCCAATCATAGTACAGGCATCACAGGCAGAAAAAAACAGAGCTGCAGCAATGGCAAACAATTTACAAAAG  666

Query  667  GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAAGTGCTGGACCTATGAGGCTTTATGTGGGCTCATTACACTTCAACATAACTGAAGATATGCTTCGTGGGAT  740

Query  741  CTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTGAGCCTTTTGGAAGAATTGAAAGTATCCAGCTGATGATGGACAGTGAAACTGGTCGATCCAAGGGATATG  814

Query  815  GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATTTATTACATTTTCTGACTCAGAATGTGCCAAAAAGGCTTTGGAACAACTTAATGGATTTGAACTAGCAGGA  888

Query  889  AGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGACCAATGAAAGTTGGTCATGTTACTGAACGTACTGATGCTTCGAGTGCTAGTTCATTTTTGGACAGTGATGA  962

Query  963  ACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAGGGTACAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  963  ACTGGAAAGGACTGGAATTGATTTGGGAACAACTGGTCGTCTTCAGTTAATGGCAAGACTTGCAGAG-------  1029

Query 1037  GTTTGCAGATTCCGCCAGCAGCACAGCAAGCTCTACAGATGAGTGGCTCTTTGGCATTTGGTGCTGTGGCAGAA  1110
                                                                                      
Sbjct 1030  --------------------------------------------------------------------------  1029

Query 1111  TTCTCTTTTGTTATAGATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTC  1184
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  ---------------GATTTGCAAACAAGACTTTCCCAGCAGACTGAAGCTTCAGCTTTAGCTGCAGCTGCCTC  1088

Query 1185  TGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  TGTTCAGCCACTTGCAACACAATGTTTCCAACTCTCTAACATGTTTAACCCTCAAACAGAAGAAGAAGTTGGAT  1162

Query 1259  GGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  GGGATACCGAGATTAAGGATGATGTGATTGAAGAATGTAATAAACATGGAGGAGTTATTCATATTTATGTTGAC  1236

Query 1333  AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  AAAAATTCAGCTCAGGGCAATGTGTATGTGAAGTGCCCATCAATTGCTGCAGCTATTGCTGCTGTCAATGCATT  1310

Query 1407  GCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  GCATGGCAGGTGGTTTGCTGGTAAAATGATAACAGCAGCATATGTACCTCTTCCAACTTACCACAACCTGTTTC  1384

Query 1481  CTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  CTGATTCTATGACAGCAACACAGCTACTGGTTCCAAGTAGACGA  1428