Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15716
• Subject: NM_001324029.2
• Aligned Length: 2097
• Identities: 1419
• Gaps: 672

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAGGACCCTGTACGTGGGTGCTCGAGAGGCCCTCTTTGCACTCAGTAGCAACCTCAGCTTCCTGCCAGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGGAGTACCAGGAGCTGCTTTGGGGTGCAGACGCAGAGAAGAAACAGCAGTGCAGCTTCAAGGGCAAGGACCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACAGCGCGACTGTCAAAACTACATCAAGATCCTCCTGCCGCTCAGCGGCAGTCACCTGTTCACCTGTGGCACAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CAGCCTTCAGCCCCATGTGTACCTACATCAACATGGAGAACTTCACCCTGGCAAGGGACGAGAAGGGGAATGTC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CTCCTGGAAGATGGCAAGGGCCGTTGTCCCTTCGACCCGAATTTCAAGTCCACTGCCCTGGTGGTTGATGGCGA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  GCTCTACACTGGAACAGTCAGCAGCTTCCAAGGGAATGACCCGGCCATCTCGCGGAGCCAAAGCCTTCGCCCCA  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  CCAAGACCGAGAGCTCCCTCAACTGGCTGCAAGACCCAGCTTTTGTGGCCTCAGCCTACATTCCTGAGAGCCTG  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  GGCAGCTTGCAAGGCGATGATGACAAGATCTACTTTTTCTTCAGCGAGACTGGCCAGGAATTTGAGTTCTTTGA  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  GAACACCATTGTGTCCCGCATTGCCCGCATCTGCAAGGCACAGGGGAACTACAGAAGGCTCTGCCGTCTGTGTC  666

Query    1  ------ATGAAGGATGTGCAGAGAGTCTTCAGCGGCCTCTACAAGGAGGTGAACCGTGAGACACAGCAGTGGTA  68
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCACAATGAAGGATGTGCAGAGAGTCTTCAGCGGCCTCTACAAGGAGGTGAACCGTGAGACACAGCAGTGGTA  740

Query   69  CACCGTGACCCACCCGGTGCCCACACCCCGGCCTGGAGCGTGCATCACCAACAGTGCCCGGGAAAGGAAGATCA  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACCGTGACCCACCCGGTGCCCACACCCCGGCCTGGAGCGTGCATCACCAACAGTGCCCGGGAAAGGAAGATCA  814

Query  143  ACTCATCCCTGCAGCTCCCAGACCGCGTGCTGAACTTTCTCAAGGACCACTTCCTGATGGACGGGCAGGTCCGA  216
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTCATCCCTGCAGCTCCCAGACCGCGTGCTGAACTTCCTCAAGGACCACTTCCTGATGGACGGGCAGGTCCGA  888

Query  217  AGCCGCATGCTGCTGCTGCAGCCCCAGGCTCGCTACCAGCGCGTGGCTGTACACCGCGTCCCTGGCCTGCACCA  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCCGCATGCTGCTGCTGCAGCCCCAGGCTCGCTACCAGCGCGTGGCTGTACACCGCGTCCCTGGCCTGCACCA  962

Query  291  CACCTACGATGTCCTCTTCCTCGGCACTGGTGACGGCCGGCTCCACAAGGCAGTGAGCGTGGGCCCCCGGGTGC  364
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACCTACGATGTCCTCTTCCTGGGCACTGGTGACGGCCGGCTCCACAAGGCAGTGAGCGTGGGCCCCCGGGTGC  1036

Query  365  ACATCATTGAGGAGCTGCAGATCTTCTCATCGGGACAGCCCGTGCAGAATCTGCTCCTGGACACCCACAGGGGG  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATCATTGAGGAGCTGCAGATCTTCTCATCGGGACAGCCCGTGCAGAATCTGCTCCTGGACACCCACAGGGGG  1110

Query  439  CTGCTGTATGCGGCCTCACACTCGGGCGTAGTCCAGGTGCCCATGGCCAACTGCAGCCTGTACCGGAGCTGTGG  512
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1111  CTGCTGTATGCGGCCTCACACTCGGGCGTAGTCCAGGTGCCCATGGCCAACTGCAGCCTGTACAGGAGCTGTGG  1184

Query  513  GGACTGCCTCCTCGCCCGGGACCCCTACTGTGCTTGGAGCGGCTCCAGCTGCAAGCACGTCAGCCTCTACCAGC  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGACTGCCTCCTCGCCCGGGACCCCTACTGTGCTTGGAGCGGCTCCAGCTGCAAGCACGTCAGCCTCTACCAGC  1258

Query  587  CTCAGCTGGCCACCAGGCCGTGGATCCAGGACATCAAGGGAGCCAGCGCCAAGGACCTTTGCAGCGCGTCTTCG  660
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCAGCTGGCCACCAGGCCGTGGATCCAGGACATCGAGGGAGCCAGCGCCAAGGACCTTTGCAGCGCGTCTTCG  1332

Query  661  GTTGTGTCCCCGTCTTTTGTACCAACAGGGGAGAAGCCATGTGAGCAAGTCCAGTTCCAGCCCAACACAGTGAA  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTGTGTCCCCGTCTTTTGTACCAACAGGGGAGAAGCCATGTGAGCAAGTCCAGTTCCAGCCCAACACAGTGAA  1406

Query  735  CACTTTGGCCTGCCCGCTCCTCTCCAACCTGGCGACCCGACTCTGGCTACGCAACGGGGCCCCCGTCAATGCCT  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACTTTGGCCTGCCCGCTCCTCTCCAACCTGGCGACCCGACTCTGGCTACGCAACGGGGCCCCCGTCAATGCCT  1480

Query  809  CGGCCTCCTGCCACGTGCTACCCACTGGGGACCTGCTGCTGGTGGGCACCCAACAGCTGGGGGAGTTCCAGTGC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGGCCTCCTGCCACGTGCTACCCACTGGGGACCTGCTGCTGGTGGGCACCCAACAGCTGGGGGAGTTCCAGTGC  1554

Query  883  TGGTCACTAGAGGAGGGCTTCCAGCAGCTGGTAGCCAGCTACTGCCCAGAGGTGGTGGAGGACGGGGTGGCAGA  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGTCACTAGAGGAGGGCTTCCAGCAGCTGGTAGCCAGCTACTGCCCAGAGGTGGTGGAGGACGGGGTGGCAGA  1628

Query  957  CCAAACAGATGAGGGTGGCAGTGTACCCGTCATTATCAGCACATCGCGTGTGAGTGCACCAGCTGGTGGCAAGG  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAAACAGATGAGGGTGGCAGTGTACCCGTCATTATCAGCACATCGCGTGTGAGTGCACCAGCTGGTGGCAAGG  1702

Query 1031  CCAGCTGGGGTGCAGACAGGTCCTACTGGAAGGAGTTCCTGGTGATGTGCACGCTCTTTGTGCTGGCCGTGCTG  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCAGCTGGGGTGCAGACAGGTCCTACTGGAAGGAGTTCCTGGTGATGTGCACGCTCTTTGTGCTGGCCGTGCTG  1776

Query 1105  CTCCCAGTTTTATTCTTGCTCTACCGGCACCGGAACAGCATGAAAGTCTTCCTGAAGCAGGGGGAATGTGCCAG  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCCCAGTTTTATTCTTGCTCTACCGGCACCGGAACAGCATGAAAGTCTTCCTGAAGCAGGGGGAATGTGCCAG  1850

Query 1179  CGTGCACCCCAAGACCTGCCCTGTGGTGCTGCCCCCTGAGACCCGCCCACTCAACGGCCTAGGGCCCCCTAGCA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGTGCACCCCAAGACCTGCCCTGTGGTGCTGCCCCCTGAGACCCGCCCACTCAACGGCCTAGGGCCCCCTAGCA  1924

Query 1253  CCCCACTCGATCACCGAGGGTACCAGTCCCTGTCAGACAGCCCCCCGGGGGCCCGAGTCTTCACTGAGTCAGAG  1326
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCCGCTCGATCACCGAGGGTACCAGTCCCTGTCAGACAGCCCCCCGGGGTCCCGAGTCTTCACTGAGTCAGAG  1998

Query 1327  AAGAGGCCACTCAGCATCCAAGACAGCTTCGTGGAGGTATCCCCAGTGTGCCCCCGGCCCCGGGTCCGCCTTGG  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGAGGCCACTCAGCATCCAAGACAGCTTCGTGGAGGTATCCCCAGTGTGCCCCCGGCCCCGGGTCCGCCTTGG  2072

Query 1401  CTCGGAGATCCGTGACTCTGTGGTG  1425
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTCGGAGATCCGTGACTCTGTGGTG  2097