Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15730
• Subject: NM_001166111.2
• Aligned Length: 1375
• Identities: 1325
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  MEAPLQTGM------------------------------------------------VLGVMIGAGVAVVVTAV  26
            |||||||||                                                |||||||||||||||||
Sbjct    1  MEAPLQTGMMGTSSHGLATNSSGAKVAERDGFQDVLAPGEGSAGRICGAQPVPFVPQVLGVMIGAGVAVVVTAV  74

Query   27  LILLVVRRLRVPKTPAPDGPRYRFRKRDKVLFYGRKIMRKVSQSTSSLVDTSVSATSRPRMRKKLKMLNIAKKI  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LILLVVRRLRVPKTPAPDGPRYRFRKRDKVLFYGRKIMRKVSQSTSSLVDTSVSATSRPRMRKKLKMLNIAKKI  148

Query  101  LRIQKETPTLQRKEPPPAVLEADLTEGDLANSHLPSEVLYMLKNVRVLGHFEKPLFLELCRHMVFQRLGQGDYV  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LRIQKETPTLQRKEPPPAVLEADLTEGDLANSHLPSEVLYMLKNVRVLGHFEKPLFLELCRHMVFQRLGQGDYV  222

Query  175  FRPGQPDASIYVVQDGLLELCLPGPDGKECVVKEVVPGDSVNSLLSILDVITGHQHPQRTVSARAARDSTVLRL  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  FRPGQPDASIYVVQDGLLELCLPGPDGKECVVKEVVPGDSVNSLLSILDVITGHQHPQRTVSARAARDSTVLRL  296

Query  249  PVEAFSAVFTKYPESLVRVVQIIMVRLQRVTFLALHNYLGLTNELFSHEIQPLRLFPSPGLPTRTSPVRGSKRM  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  PVEAFSAVFTKYPESLVRVVQIIMVRLQRVTFLALHNYLGLTNELFSHEIQPLRLFPSPGLPTRTSPVRGSKRM  370

Query  323  VSTSATDEPRETPGRPPDPTGAPLPGPTGDPVKPTSLETPSPPLLSRCVSMPGDISGLQGGPRSDFDMAYERGR  396
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  VSTSATDEPRETPGRPPDPTGAPLPGPTGDPVKPTSLETPSAPLLSRCVSMPGDISGLQGGPRSDFDMAYERGR  444

Query  397  ISVSLQEEASGGSLAAPARTPTQEPREQPAGACEYSYCEDESATGGCPFGPYQGRQTSSIFEAAKQELAKLMRI  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ISVSLQEEASGGSLAAPARTPTQEPREQPAGACEYSYCEDESATGGCPFGPYQGRQTSSIFEAAKQELAKLMRI  518

Query  471  EDPSLLNSRVLLHHAKAGTIIARQGDQDVSLHFVLWGCLHVYQRMIDKAEDVCLFVAQPGELVGQLAVLTGEPL  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  EDPSLLNSRVLLHHAKAGTIIARQGDQDVSLHFVLWGCLHVYQRMIDKAEDVCLFVAQPGELVGQLAVLTGEPL  592

Query  545  IFTLRAQRDCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQMDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCT  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  IFTLRAQRDCTFLRISKSDFYEIMRAQPSVVLSAAHTVAARMSPFVRQMDFAIDWTAVEAGRALYRQGDRSDCT  666

Query  619  YIVLNGRLRSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHAVRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVT  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  YIVLNGRLRSVIQRGSGKKELVGEYGRGDLIGVVEALTRQPRATTVHAVRDTELAKLPEGTLGHIKRRYPQVVT  740

Query  693  RLIHLLSQKILGNLQQLQGPFPAGSGLGVPPHSELTNPASNLATVAILPVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTL  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  RLIHLLSQKILGNLQQLQGPFPAGSGLGVPPHSELTNPASNLATVAILPVCAEVPMVAFTLELQHALQAIGPTL  814

Query  767  LLNSDIIRARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTPWTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQ  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  LLNSDIIRARLGASALDSIQEFRLSGWLAQQEDAHRIVLYQTDASLTPWTVRCLRQADCILIVGLGDQEPTLGQ  888

Query  841  LEQMLENTAVRALKQLVLLHREEGAGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRCPRRLFSRRSPAKLHELYEKVFSRRAD  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LEQMLENTAVRALKQLVLLHREEGAGPTRTVEWLNMRSWCSGHLHLRCPRRLFSRRSPAKLHELYEKVFSRRAD  962

Query  915  RHSDFSRLARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLVGGTSIGSFIGALYAEERSASRTRQRA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  963  RHSDFSRLARVLTGNTIALVLGGGGARGCSHIGVLKALEEAGVPVDLVGGTSIGSFIGALYAEERSASRTKQRA  1036

Query  989  REWAKSMTSVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWLPYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYV  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  REWAKSMTSVLEPVLDLTYPVTSMFTGSAFNRSIHRVFQDKQIEDLWLPYFNVTTDITASAMRVHKDGSLWRYV  1110

Query 1063  RASMTLSGYLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADIARSMGAKTVIAIDVGSQDETDLSTYGDSLSGWWLLWKRL  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  RASMTLSGYLPPLCDPKDGHLLMDGGYINNLPADIARSMGAKTVIAIDVGSQDETDLSTYGDSLSGWWLLWKRL  1184

Query 1137  NPWADKVKVPDMAEIQSRLAYVSCVRQLEVVKSSSYCEYLRPPIDCFKTMDFGKFDQIYDVGYQYGKAVFGGWS  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  NPWADKVKVPDMAEIQSRLAYVSCVRQLEVVKSSSYCEYLRPPIDCFKTMDFGKFDQIYDVGYQYGKAVFGGWS  1258

Query 1211  RGNVIEKMLTDRRSTDLNESRRADVLAFPSSGFTDLAEIVSRIEPPTSYVSDGCADGEESDCLTEYEEDAGPDC  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  RGNVIEKMLTDRRSTDLNESRRADVLAFPSSGFTDLAEIVSRIEPPTSYVSDGCADGEESDCLTEYEEDAGPDC  1332

Query 1285  SRDEGGSPEGASPSTASEMEEEKSILRQRRCLPQEPPGSATDA  1327
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  SRDEGGSPEGASPSTASEMEEEKSILRQRRCLPQEPPGSATDA  1375