Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15752
- Subject:
- XM_006498930.2
- Aligned Length:
- 3663
- Identities:
- 2967
- Gaps:
- 318
Alignment
Query 1 ATGGCCGGGGCTCAACCCGGAGTGCACGCCTTGCAACTCAAGCCCGTGTGCGTGTCCGACAGCCTCAAGAAGGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACCAAATTCGTCAAGTGGGATGATGACTCAACTATTGTTACTCCAATTATTTTGAGGACTGACCCTCAGGGAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTTTCTTTTACTGGACAGATCAAA-ACA------AGGAGACAGAGCTACTGGATCTCAGCCTTGTCAAAGATGC 215
||.||| ||| |||||||.|||||..|.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ------------------ATGAAACACATTAATGAGGAGACGGAGCTGTTAGATCTCAGCCTTGTCAAGGATGC 56
Query 216 CAGATGTGGGAGACACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAATTACGTGAACTTTTGGATGTGGGGAACATCGGGC 289
|||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|
Sbjct 57 CAGGTGTGGGAAGCACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAGTTGCGTGAACTTCTGGATGTTGGGAACATCGGAC 130
Query 290 GCCTGGAGCAGCGCATGATCACAGTGGTGTATGGGCCTGACCTCGTGAACATCTCCCATTTGAATCTCGTGGCT 363
.|.||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 131 ACTTGGAACAGCGCATGATAACTGTGGTGTATGGACCAGACCTGGTGAACATTTCCCACTTGAATCTTGTGGCT 204
Query 364 TTCCAAGAAGAAGTGGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGTTTGGCAACAAACCTGCTGGCCCAAAACAT 437
||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 205 TTTCAAGAGGAAGTAGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGCTTGGCAACAAACCTGCTGGCTCAGAACAT 278
Query 438 GTCCAGGGATGCATTTCTGGAAAAAGCCTATACTAAACTTAAGCTGCAAGTCACTCCAGAAGGGCGTATTCCTC 511
|||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 279 GTCCAGGGACGCATTTCTGGAGAAAGCATATACTAAGCTCAAGCTCCAGGTCACCCCAGAAGGCCGCATTCCTC 352
Query 512 TCAAAAACATATATCGCTTGTTTTCAGCAGATCGGAAGCGAGTTGAAACTGCTTTAGAGGCTTGTAGTCTTCCA 585
|.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 353 TTAAAAACATCTATCGATTGTTCTCAGCAGACCGGAAGCGCGTTGAAACTGCACTAGAGGCTTGTAGTCTTCCA 426
Query 586 TCTTCAAGGAATGATTCAATACCTCAAGAAGATTTCACTCCAGAAGTGTACAGAGTTTTCCTCAACAACCTTTG 659
|||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 427 TCTTCGAGGAATGACTCCATTCCCCAAGAGGACTTCACTCCAGATGTATACAGAGTTTTCCTGAACAATCTCTG 500
Query 660 CCCTCGACCTGAAATTGATAACATCTTTTCAGAATTTGGTGCAAAAAGCAAACCATATCTTACCGTTGATCAGA 733
.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 501 TCCCCGACCTGAAATTGATAACATCTTTTCTGAATTTGGTGCCAAAAGCAAACCGTACCTGACGGTTGATCAGA 574
Query 734 TGATGGATTTTATCAACCTTAAGCAGCGAGATCCTCGGCTTAATGAAATACTTTATCCACCTCTAAAACAAGAG 807
||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 575 TGATGGATTTTATCAACCTTAAGCAGAGAGATCCCCGGCTCAATGAAATCCTTTACCCACCTCTGAAGCAGGAG 648
Query 808 CAAGTCCAAGTATTGATTGAGAAGTATGAACCCAACAACAGCCTCGCCAGAAAAGGACAAATATCAGTGGATGG 881
||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||..|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 649 CAGGTCCAAGTGTTGATTGAGAAATATGAGCCCAACAGCAGCCTCGCCAAGAAAGGGCAGATGTCAGTGGATGG 722
Query 882 GTTCATGCGCTATCTGAGTGGAGAAGAAAACGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAATGAAGACATGT 955
.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 723 ATTCATGCGCTACCTGAGCGGAGAAGAAAATGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAACGAAGACATGT 796
Query 956 CTCAGCCCCTTTCTCACTATTTCATTAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAACTGGCTGGAAAC 1029
||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||
Sbjct 797 CTCAGCCCCTGTCTCACTATTTCATCAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAGTTGGCTGGGAAC 870
Query 1030 TCCTCTGTTGAGATGTATCGCCAAGTGCTCCTGTCTGGTTGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGACG 1103
||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 871 TCGTCTGTAGAGATGTATCGCCAGGTGCTTCTGTCTGGATGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGAAG 944
Query 1104 GACTGCAGAAGAGGAACCTGTCATCACCCATGGCTTCACCATGACAACTGAAATATCTTTCAAGGAAGTGATAG 1177
|||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 945 GACCGCTGAGGAAGAGCCTGTCATTACCCATGGATTCACCATGACAACAGAAATATCCTTCAAGGAAGTCATAG 1018
Query 1178 AAGCAATTGCGGAGTGTGCATTTAAGACTTCACCTTTTCCAATTCTCCTTTCGTTTGAGAACCATGTGGATTCC 1251
||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1019 AAGCCATCGCAGAGTGTGCGTTCAAGACGTCTCCTTTCCCCATCCTCCTTTCCTTTGAGAACCACGTGGATTCC 1092
Query 1252 CCAAAGCAGCAAGCCAAGATGGCGGAGTACTGCCGACTGATCTTTGGGGATGCCCTTCTCATGGAGCCCCTGGA 1325
||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1093 CCGAAGCAACAAGCCAAGATGGCCGAGTATTGCCGATTAATCTTTGGTGATGCCCTCCTGATGGAACCACTGGA 1166
Query 1326 AAAATATCCACTGGAATCTGGAGTTCCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATTTTGGTGAAAAATA 1399
||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1167 AAAATACCCACTGGAATCTGGGGTACCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATCTTGGTGAAAAACA 1240
Query 1400 AGAAGAAATCACACAAGTCATCAGAAGGAAGCGGCAAAAAGAAGCTCTCAGAACAAGCCTCCAACACCTACAGT 1473
|||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1241 AGAAGAAGTCGCACAAGTCGTCAGAGGGAAGTGGTAAGAAGAAGCTTTCAGAGCAAGCTTCCAACACCTACAGC 1314
Query 1474 GACTCCTCCAGCATGTTCGAGCCCTCATCCCCAGGAGCCGGAGAAGCTGATACGGAAAGTGACGACGACGATGA 1547
|||||||||||..||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1315 GACTCCTCCAGTGTGTTCGAGCCTTCGTCTCCAGGAGCTGGGGAAGCAGATACGGAGAGTGATGACGATGACGA 1388
Query 1548 TGATGATGACTGTAAAAAATCTTCAATGGATGAGGGGACTGCTGGAAGTGAGGCTATGGCCACAGAAGAAATGT 1621
.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1389 CGACGATGACTGTAAAAAGTCTTCCATGGATGAGGGGACAGCTGGCAGCGAAGCCATGGCCACAGAAGAGATGT 1462
Query 1622 CTAATCTGGTGAACTATATTCAGCCAGTCAAGTTTGAGTCATTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGTTTT 1695
||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1463 CTAACCTGGTGAACTATATTCAGCCTGTCAAGTTTGAGTCCTTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGCTTT 1536
Query 1696 GAAATGTCTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTCACCAAGTCTCCAGTGGAATTTGTAGAATATAA 1769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1537 GAAATGTCTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTTACAAAGTCTCCGGTGGAATTTGTAGAATACAA 1610
Query 1770 CAAAATGCAGCTTAGCAGGATATATCCAAAAGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTATATGCCTCAGCTCTTCT 1843
|||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1611 CAAGATGCAACTTAGCAGGATATATCCCAAGGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTACATGCCTCAACTCTTCT 1684
Query 1844 GGAATGCAGGTTGTCAGATGGTGGCACTTAATTTCCAGACAATGGACCTGGCTATGCAAATAAATATGGGGATG 1917
|||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1685 GGAATGCTGGCTGTCAGATGGTGGCGCTCAACTTCCAGACAGTGGATCTAGCTATGCAGATAAACATGGGCATG 1758
Query 1918 TATGAATACAACGGGAAGAGTGGCTACAGATTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCTGACAAGCATTTTGATCC 1991
|||||.|||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1759 TATGAGTACAATGGGAAGAGCGGCTATAGGCTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCGGACAAGCATTTTGATCC 1832
Query 1992 ATTTACTGAAGGCATCGTAGATGGGATAGTGGCAAACACTTTGTCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTTCTTT 2065
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1833 ATTTACTGAAGGAATCGTAGATGGGATAGTGGCCAACACTCTATCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTCCTCT 1906
Query 2066 CTGATAAGAAAGTTGGGACTTACGTGGAAGTAGATATGTTTGGTTTGCCTGTGGATACAAGGAGGAAGGCATTT 2139
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1907 CTGATAAGAAAGTTGGGACTTATGTGGAAGTGGATATGTTTGGCTTGCCTGTGGACACAAGGAGGAAGGCATTT 1980
Query 2140 AAGACCAAAACATCCCAAGGAAATGCTGTGAATCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTGTTCAAAAAGGTGGT 2213
||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1981 AAAACCAAGACATCCCAAGGAAATGCTGTAAACCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTATTCAAAAAGGTAGT 2054
Query 2214 TCTTCCTACTCTGGCCTGTTTGAGAATAGCAGTTTATGAAGAAGGAGGTAAATTCATTGGCCACCGTATCTTGC 2287
|||.|||.||||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 2055 TCTACCTTCTCTGGCCTGTTTGAGGATAGCAGCATATGAAGAGGGAGGCAAATTTATTGGCCACCGGATATTGC 2128
Query 2288 CAGTGCAAGCCATTCGGCCAGGCTATCACTATATCTGTCTAAGGAATGAAAGGAACCAGCCTCTGACGCTGCCT 2361
|.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2129 CTGTGCAGGCTATTCGGCCAGGCTATCACTACATCTGCCTGCGGAATGAGAGGAACCAGCCCCTGACGCTGCCA 2202
Query 2362 GCTGTCTTTGTCTACATAGAAGTGAAAGACTATGTGCCAGACACATATGCAGATGTCATCGAAGCTTTATCAAA 2435
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 2203 GCTGTCTTTGTCTACATAGAAGTCAAAGATTATGTGCCAGACACGTATGCAGATGTAATCGAAGCTCTATCAAA 2276
Query 2436 CCCAATCCGATATGTGAACCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAATTGGCTGCTTTGACACTGGAAGATGAAGAAG 2509
|||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 2277 CCCAATCCGATATGTCAATCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAGCTGGCTGCGTTGACCCTGGAGGATGAAGAGG 2350
Query 2510 AAGTAAAGAAAGAGGCTGATCCTGGAGAAACACCATCAGAGGCTCCAAGTGAAGCAAGAACGACTCCAGCAGAA 2583
||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||.|.||.||.||.||||||||.
Sbjct 2351 AAGTAAAGAAGGAGGCTGACCCTGGAGAAACATCTTCCGAGGCTCCAAGCGAAACCAGGACAACGCCAGCAGAG 2424
Query 2584 AATGGGGTGAATCACACTACAACCCTGACACCCAAGCCACCCTCCCAGGCTCTCCACAGCCAGCCAGCTCCAGG 2657
|||||||||||||||||..||.||||..||||||||||.||.||||||||||..|||||||||||.||||||||
Sbjct 2425 AATGGGGTGAATCACACCGCATCCCTTGCACCCAAGCCGCCTTCCCAGGCTCCACACAGCCAGCCTGCTCCAGG 2498
Query 2658 TTCTGTAAAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTTATTCAGAGTGTCTTAACAGAAGTGGAAGCACAGACCATCG 2731
.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 2499 GTCTGTGAAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTGATCCAGAGCGTGTTAACAGAAGTAGAGGCGCAAACCATCG 2572
Query 2732 AAGAACTAAAGCAACAGAAATCGTTTGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTTAAG 2805
||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2573 AAGAGCTCAAGCAACAGAAATCGTTCGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTGAAG 2646
Query 2806 AGACACCACAAGAAAACCACTGACCTTATCAAAGAACACACTACCAAGTATAATGAAATTCAGAATGACTACTT 2879
||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 2647 AGACACCACAAGAAAACCACGGAGCTCATTAAGGAGCACACGACCAAGTACAACGAGATTCAGAATGACTACCT 2720
Query 2880 GAGAAGGAGAGCCGCTTTGGAAAAGTCCGCCAAAAAGGACAGTAAGAAAAAATCGGAACCCAGCAGCCCTGATC 2953
|||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2721 GAGAAGGAGGGCAGCCTTGGAGAAGTCCGCCAAAAAGGACAGCAAGAAGAAATCTGAACCCAGCAGCCCTGACC 2794
Query 2954 ATGGTTCATCAACGATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCTGAAATGACCCAAAAGTTAATAGACTTGAAG 3027
|.||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 2795 ACGGCTCATCAGCCATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCAGAAATGACTCAGAAGTTGATAGACTTGAAA 2868
Query 3028 GACAAACAACAGCAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAACAGTATTATAGTGAAAAATACCAGAAGCGAGAACA 3101
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2869 GACAAGCAACAACAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAGCAGTATTACAGCGAGAAGTACCAAAAGCGAGAACA 2942
Query 3102 TATTAAACTGCTTATTCAAAAGTTGACGGATGTCGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTCAAAG 3175
.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2943 CATTAAACTGCTTATTCAGAAGTTGACAGATGTTGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTGAAGG 3016
Query 3176 AAATCTGTGAGAAAGAAAAGAAAGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAAAAGAGGCAGGAGAAGATAACAGAAGCT 3249
|||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 3017 AAATCTGCGAGAAAGAGAAGAAGGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAGAAGAGGCAAGAGAAGATAACAGAAGCC 3090
Query 3250 AAATCCAAAGACAAAAGTCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGGTCATATATCCAGGAAGTGGTGCA 3323
||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 3091 AAGTCCAAAGACAAAAGCCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGATCGTACATCCAGGAGGTGGTTCA 3164
Query 3324 GTATATCAAGAGGTTAGAAGAAGCGCAAAGTAAACGGCAAGAAAAACTCGTAGAGAAACACAAGGAAATACGTC 3397
|||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 3165 GTACATCAAGAGGTTAGAGGAAGCACAAAGTAAAAGACAAGAAAAACTCGTGGAGAAACACAATGAGATCCGCC 3238
Query 3398 AGCAGATCCTGGATGAAAAGCCCAAG--------GGGG-----------------------------AAGGTTC 3434
||||||||||.|||||.||||||||| ||.| ||||.|.
Sbjct 3239 AGCAGATCCTCGATGAGAAGCCCAAGCTGCAGACGGAGCTGGAGCAAGAATACCAAGACAAGTTCAAAAGGCTG 3312
Query 3435 CTCCT---CATTC------TTGT--CGGAAACTTGCCAT------GAGGATC-------------------CCT 3472
|.||| .|||| |||| .|||| ||||| ||.|||| .||
Sbjct 3313 CCCCTGGAGATTCTGGAGTTTGTACAGGAA----GCCATGAAAGGGAAGATCAGCGAGGACAGCAATCACGGCT 3382
Query 3473 CTGTTTCCCCCAACTTTACTCCCCCCA---------------ACCCTCAAG---CTCTCAAGTGG--------- 3519
||| ||||..|.|..||..||.|| |.||||||| |.|||.||||.
Sbjct 3383 CTG----CCCCTCCCTCTCTGGCCTCAGATGCTGCAAAGGTGAACCTCAAGTCTCCCTCCAGTGAGGAGATAGA 3452
Query 3520 ------------------------------------- 3519
Sbjct 3453 AAGAGAGAACCCAGGAAGAGAGTTTGATACTCCTCTG 3489