Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15831
- Subject:
- XM_006720561.3
- Aligned Length:
- 1341
- Identities:
- 1275
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG 74
Query 75 TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG 148
Query 149 GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG 222
Query 223 GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC 296
Query 297 TGACTCACAGCAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAA 370
||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGACTCA---------------------------------------------CAGAATCATGAAAAGCAGGAAA 325
Query 371 GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC 399
Query 445 TCA------------------GGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGA 500
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 TCAGGTAAACGTGGAATAAATGGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGA 473
Query 501 TGAGTCATCCAAACCTGGAAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTC 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 TGAGTCATCCAAACCTGGAAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTC 547
Query 575 ATTTTAAGGAAATGGAGTCCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATG 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 ATTTTAAGGAAATGGAGTCCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATG 621
Query 649 AATGAACTGA---AGCAGCCCATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGT 719
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 AATGAACTGAAGCAGCAGCCCATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGT 695
Query 720 GGCTTCTACTCCCATCAGCCAACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTC 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 GGCTTCTACTCCCATCAGCCAACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTC 769
Query 794 TGAAGGGGTCACTCAAGCGCTCTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGAT 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 TGAAGGGGTCACTCAAGCGCTCTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGAT 843
Query 868 AATGAGCATAAGCGTTCACTGACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCC 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 AATGAGCATAAGCGTTCACTGACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCC 917
Query 942 AAAAGGCGAGGCTGTGCTTGGGACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCAT 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 AAAAGGCGAGGCTGTGCTTGGGACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCAT 991
Query 1016 TCAAGTTGACAACTGAGGCAACGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTG 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 TCAAGTTGACAACTGAGGCAACGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTG 1065
Query 1090 TCTCGTCCCCTCAACTATGAACCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCT 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 TCTCGTCCCCTCAACTATGAACCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCT 1139
Query 1164 AAATCAACATGTCAACAGAATTAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGC 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AAATCAACATGTCAACAGAATTAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGC 1213
Query 1238 AACGGAAGAAACGCGAGCAAGAACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTG 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 AACGGAAGAAACGCGAGCAAGAACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTG 1287
Query 1312 GCTGAAGAT 1320
|||||||||
Sbjct 1288 GCTGAAGAT 1296