Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15872
- Subject:
- NM_017697.4
- Aligned Length:
- 2043
- Identities:
- 2028
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC 74
Query 75 GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG 148
Query 149 AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC 222
Query 223 CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG 296
Query 297 AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA 370
Query 371 AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT 444
Query 445 GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT 518
Query 519 CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC 592
Query 593 ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT 666
Query 667 GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG 740
Query 741 ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA 814
Query 815 GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG 888
Query 889 GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC 962
Query 963 CAAGGAAAATCAAGTCATTGTCCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGGAAAATCAAGTCATTGTCCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT 1036
Query 1037 TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA 1110
Query 1111 GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG 1184
Query 1185 TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC 1258
Query 1259 CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA 1332
Query 1333 GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC 1406
Query 1407 CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAAGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAGGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC 1480
Query 1481 AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT 1554
Query 1555 GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC 1628
Query 1629 CCCACCG------------CCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTA 1690
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCCACCGCCATGTAAGTTACCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTA 1702
Query 1691 CAGAAGCTGCCATTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCA 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGAAGCTGCCATTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCA 1776
Query 1765 GCAGGCACTCAGCTCTTCATGAACTACACAGCGTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTA 1838
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCAGGCACTCAGCTCTTCATGAATTACACAGCGTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTA 1850
Query 1839 CTTCCCTACAGCTGCTAATCTTAGCGGTGTCCCTCCACAGCCTGGCACGGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCT 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTTCCCTACAGCTGCTAATCTTAGCGGTGTCCCTCCACAGCCTGGCACGGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCT 1924
Query 1913 ACAATACTGGAGTTAAGGAAATTCTTAACTTCTCCCAAGGTTACCAGTATGCAACCGAGGATGGACTTATACAC 1986
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACAATACTGGAGTTAAGGAAATTCTTAACTTCTTCCAAGGTTACCAGTATGCAACCGAGGATGGACTTATACAC 1998
Query 1987 ACAAATGACCAGGCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATT 2031
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACAAATGACCAGGCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATT 2043