Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15900
• Subject: XM_017009621.2
• Aligned Length: 2235
• Identities: 2182
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGTCGGAGTCTGGGGAGATGAGTGAATTTGGCTACATCATGGAATTGATAGCTAAAGGCAAGGTTACCATTAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGAGTCTGGGGAGATGAGTGAATTTGGCTACATCATGGAATTGATAGCTAAAGGCAAGGTTACCATTAA  74

Query   75  GAATATCGAAAGGGAGCTCATTTGCCCAGCATGCAAGGAGCTGTTTACCCACCCATTGATTCTCCCTTGCCAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAATATCGAAAGGGAGCTCATTTGCCCAGCATGCAAGGAGCTGTTTACCCACCCATTGATTCTCCCTTGCCAAC  148

Query  149  ATAGTATCTGTCATAAATGTGTAAAAGAACTCCTGCTGACTCTCGATGATTCATTCAACGATGTGGGATCAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAGTATCTGTCATAAATGTGTAAAAGAACTCCTGCTGACTCTCGATGATTCATTCAACGATGTGGGATCAGAC  222

Query  223  AACTCCAATCAAAGCAGTCCTCGACTTCGGCTCCCCTCCCCTAGTATGGATAAAATTGACCGAATTAACAGACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTCCAATCAAAGCAGTCCTCGACTTCGGCTCCCCTCCCCTAGTATGGATAAAATTGACCGAATTAACAGACC  296

Query  297  A---------------------------------------------------GGCTGGAAGCGCAATTCATTGA  319
            |                                                   ||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCATCACAACGGAGATCTGTGGGGTGGAGAGGTCATAAGAAGTTATTAAATGGCTGGAAGCGCAATTCATTGA  370

Query  320  CCCCGAGGACAACTGTTTTCCCTTGCCCTGGCTGTGAGCATGATGTGGATCTTGGAGAACGAGGAATCAATGGT  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCGAGGACAACTGTTTTCCCTTGCCCTGGCTGTGAGCATGATGTGGATCTTGGAGAACGAGGAATCAATGGT  444

Query  394  CTGTTTCGAAACTTCACTTTGGAAACTATTGTGGAAAGATATCGTCAAGCAGCTAGGGCAGCCACAGCCATTAT  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGTTTCGAAACTTCACTTTGGAAACTATTGTGGAAAGATATCGTCAAGCAGCTAGGGCAGCCACAGCCATTAT  518

Query  468  GTGTGACCTTTGTAAACCACCACCTCAAGAATCCACAAAAAGCTGCATGGACTGTAGTGCAAGTTACTGCAATG  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGTGACCTTTGTAAACCACCACCTCAAGAATCCACAAAAAGCTGCATGGACTGTAGTGCAAGTTACTGCAATG  592

Query  542  AATGCTTCAAAATTCATCACCCTTGGGGTACTATAAAAGCTCAACATGAGTATGTTGGTCCAACTACTAACTTC  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATGCTTCAAAATTCATCACCCTTGGGGTACTATAAAAGCTCAACATGAGTATGTTGGTCCAACTACTAACTTC  666

Query  616  AGACCCAAGATTTTAATGTGCCCAGAACATGAAACAGAGAGAATAAACATGTACTGTGAATTATGTAGGAGGCC  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGACCCAAGATTTTAATGTGCCCAGAACATGAAACAGAGAGAATAAACATGTACTGTGAATTATGTAGGAGGCC  740

Query  690  AGTTTGCCATCTGTGTAAGTTGGGTGGTAATCATGCCAACCACCGTGTAACCACTATGAGCAGTGCCTACAAAA  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTTGCCATCTGTGTAAGTTGGGTGGTAATCATGCCAACCACCGTGTAACCACTATGAGCAGTGCCTACAAAA  814

Query  764  CCTTAAAGGAAAAGCTTTCAAAGGATATTGATTACCTTATTGGTAAGGAAAGCCAGGTGAAGAGTCAAATATCT  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTTAAAGGAAAAGCTTTCAAAGGATATTGATTACCTTATTGGTAAGGAAAGCCAGGTGAAGAGTCAAATATCT  888

Query  838  GAACTAAACTTGTTAATGAAAGAAACAGAGTGTAATGGAGAGAGGGCTAAAGAAGAAGCAATTACACATTTTGA  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAACTAAACTTGTTAATGAAAGAAACAGAGTGTAATGGAGAGAGGGCTAAAGAAGAAGCAATTACACATTTTGA  962

Query  912  AAAGCTCTTTGAAGTTCTGGAAGAGAGGAAATCATCTGTTTTGAAAGCAATTGACTCCTCTAAGAAACTAAGAT  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGCTCTTTGAAGTTCTGGAAGAGAGGAAATCATCTGTTTTGAAAGCAATTGACTCCTCTAAGAAACTAAGAT  1036

Query  986  TAGACAAATTTCAGACTCAAATGGAAGAGTACCAGGGACTTCTAGAGAACAATGGACTTGTGGGATATGCTCAA  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGACAAATTTCAGACTCAAATGGAAGAGTACCAGGGACTTCTAGAGAACAATGGACTTGTGGGATATGCTCAA  1110

Query 1060  GAAGTGCTAAAGGAGACAGATCAGTCTTGCTTTGTGCAGACAGCAAAGCAGCTCCACCTCAGAATACAGAAAGC  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGTGCTAAAGGAGACAGATCAGTCTTGCTTTGTGCAGACAGCAAAGCAGCTCCACCTCAGAATACAGAAAGC  1184

Query 1134  CACAGAATCTTTGAAGAGCTTTAGACCTGCAGCTCAGACTTCTTTTGAAGACTATGTTGTTAATACCTCTAAAC  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACAGAATCTTTGAAGAGCTTTAGACCTGCAGCTCAGACTTCTTTTGAAGACTATGTTGTTAATACCTCTAAAC  1258

Query 1208  AAACAGAACTTCTTGGAGAATTATCCTTTTTCTCTAGTGGCATAGACGTGCCAGAGATCAATGAGGAACAGAGC  1281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAACAGAACTTCTTGGAGAATTATCCTTTTTCTCTAGTGGCATAGACGTGCCAGAGATCAATGAGGAACAGAGC  1332

Query 1282  AGAGTTTATAACAATGCCTTGATAAATTGGCACCATCCAGAAAAGGATAAAGCTGATAGCTATGTTCTTGAATA  1355
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGTTTATAACAATGCCTTGATAAATTGGCACCATCCAGAAAAGGATAAAGCTGATAGCTATGTTCTTGAATA  1406

Query 1356  TCGGAAAATCAATAGAGATGATGAAATGTCATGGAATGAGATAGAAGTGTGTGGAACAAGTAAAATAATTCAAG  1429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCGGAAAATCAATAGAGATGATGAAATGTCATGGAATGAGATAGAAGTGTGTGGAACAAGTAAAATAATTCAAG  1480

Query 1430  ACTTGGAAAACAGTAGTACCTATGCTTTCAGAGTAAGAGCTTACAAGGGTTCAATCTGTAGTCCTTGCAGCAGA  1503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTTGGAAAACAGTAGTACCTATGCTTTCAGAGTAAGAGCTTACAAGGGTTCAATCTGTAGTCCTTGCAGCAGA  1554

Query 1504  GAATTGATTCTTCATACTCCTCCAGCTCCAGTTTTCAGCTTCCTCTTTGATGAAAAATGTGGCTATAATAATGA  1577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAATTGATTCTTCATACTCCTCCAGCTCCAGTTTTCAGCTTCCTCTTTGATGAAAAATGTGGCTATAATAATGA  1628

Query 1578  ACACCTCCTGCTGAACTTGAAGAGAGACCGTGTAGAGAGTAGAGCTGGATTTAATCTTCTGCTTGCTGCAGAAC  1651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACACCTCCTGCTGAACTTGAAGAGAGACCGTGTAGAGAGTAGAGCTGGATTTAATCTTCTGCTTGCTGCAGAAC  1702

Query 1652  GCATCCAAGTGGGTTATTACACAAGCTTAGACTACATCATTGGAGATACTGGCATTACAAAAGGAAAACACTTC  1725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCATCCAAGTGGGTTATTACACAAGCTTAGACTACATCATTGGAGATACTGGCATTACAAAAGGAAAACACTTC  1776

Query 1726  TGGGCCTTCCGTGTGGAACCATATTCATACCTGGTAAAAGTGGGAGTTGCTTCTAGCGATAAACTACAAGAATG  1799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGGGCCTTCCGTGTGGAACCATATTCATACCTGGTAAAAGTGGGAGTTGCTTCTAGCGATAAACTACAAGAATG  1850

Query 1800  GCTCCGTTCTCCCCGGGATGCAGTTAGTCCAAGATATGAGCAAGACAGTGGGCATGACAGTGGAAGTGAGGATG  1873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTCCGTTCTCCCCGGGATGCAGTTAGTCCAAGATATGAGCAAGACAGTGGGCATGACAGTGGAAGTGAGGATG  1924

Query 1874  CCTGTTTTGATTCTTCACAACCATTTACCTTAGTTACTATAGGCATGCAGAAATTTTTTATACCCAAGTCACCT  1947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTGTTTTGATTCTTCACAACCATTTACCTTAGTTACTATAGGCATGCAGAAATTTTTTATACCCAAGTCACCT  1998

Query 1948  ACTTCTTCTAATGAACCTGAAAATAGAGTTCTCCCTATGCCAACAAGTATTGGGATTTTCCTTGACTGTGATAA  2021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACTTCTTCTAATGAACCTGAAAATAGAGTTCTCCCTATGCCAACAAGTATTGGGATTTTCCTTGACTGTGATAA  2072

Query 2022  AGGCAAAGTAAATTTCTATGATATGGATCAGATGAAATGCCTTTATGAACGCCAAGTGGACTGTTCACATACAC  2095
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGGCAAAGTAGATTTCTATGATATGGATCAGATGAAATGCCTTTATGAACGCCAAGTGGACTGTTCACATACAC  2146

Query 2096  TGTATCCAGCATTTGCATTAATGGGCAGTGGAGGAATTCAGCTTGAAGAACCCATCACAGCAAAATATCTGGAA  2169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGTATCCAGCATTTGCATTAATGGGCAGTGGAGGAATTCAGCTTGAAGAACCCATCACAGCAAAATATCTGGAA  2220

Query 2170  TACCAAGAGGACATG  2184
            |||||||||||||||
Sbjct 2221  TACCAAGAGGACATG  2235