Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15910
• Subject: NM_001300751.1
• Aligned Length: 1467
• Identities: 1407
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT  74

Query   75  ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148

Query  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT  222

Query  223  GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA  296

Query  297  CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC  370

Query  371  TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444

Query  445  GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC  518

Query  519  AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  592

Query  593  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC  666

Query  667  GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  740

Query  741  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA  814

Query  815  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC  888

Query  889  CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT  962

Query  963  CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCT  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  963  CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATG-------------------------------  1005

Query 1037  CCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC  1110
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  -----------------------------CAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC  1050

Query 1111  TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA  1124

Query 1185  CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC  1198

Query 1259  TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199  TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA  1272

Query 1333  GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273  GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT  1346

Query 1407  GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG  1467
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347  GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG  1407