Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15910
• Subject: NM_001352168.1
• Aligned Length: 1467
• Identities: 843
• Gaps: 624

Alignment

Query    1  ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  592
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  33

Query  593  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct   34  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCT-------------------------------------  70

Query  667  GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  740
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  ----------------------------GGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  116

Query  741  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  117  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA  190

Query  815  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC  264

Query  889  CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT  338

Query  963  CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCT  412

Query 1037  CCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  CCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC  486

Query 1111  TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA  560

Query 1185  CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC  634

Query 1259  TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA  708

Query 1333  GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT  782

Query 1407  GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG  1467
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG  843