Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15910
- Subject:
- XM_017019626.2
- Aligned Length:
- 1500
- Identities:
- 1395
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGG---------AAGC---------ACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAG-AACAGCTATTCCACGAGA 55
|||| |||| |||| ||||| ||| |||.|||
Sbjct 1 ATGGTTAATGTGAAAGCCCTTTGTGAACCT------GAAGT-----------GAGCAACTGCT----------- 46
Query 56 GGATCCGCGAGTGT-ATTATATCAACA--CTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCC----- 121
|||| ||.||| ||||.....||| | |||||.| ||.| ||||||.|.|...|||||
Sbjct 47 GGAT----GAATGTCATTACGGGCACAGGC-TCTGTGT-CATC--------TCCTCTCCTAGTGCTTCCACAGC 106
Query 122 --TGACCCG----CTTCAAGAAGCCTGCTGAGTTCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATT 189
.||||.| ||.|..||.|.|||..|| || |.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 CAGGACCAGAGACCTCCCTGATGACTGGGGA----AC--CTGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATT 174
Query 190 GCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAG 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 GCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAG 248
Query 264 CAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCT 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 CAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCT 322
Query 338 GGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCT 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 GGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCT 396
Query 412 GAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCAC 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 GAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCAC 470
Query 486 TCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCT 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 TCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCT 544
Query 560 ATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTG 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 ATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTG 618
Query 634 TGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGA 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 TGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGA 692
Query 708 CCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCT 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 CCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCT 766
Query 782 GCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAG 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 GCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAG 840
Query 856 AAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGAC 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGAC 914
Query 930 GGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCA 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 GGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCA 988
Query 1004 TGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCTCCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTC 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 989 TGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCTCCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTC 1062
Query 1078 ATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATG 1151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 ATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATG 1136
Query 1152 GCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCT 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 GCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCT 1210
Query 1226 TCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTC 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 TCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTC 1284
Query 1300 TACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGC 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 TACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGC 1358
Query 1374 TGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCAT 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 TGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCAT 1432
Query 1448 CTAGGAAGACCCAGCACCAG 1467
||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CTAGGAAGACCCAGCACCAG 1452