Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15910
- Subject:
- XM_024449050.1
- Aligned Length:
- 1596
- Identities:
- 1395
- Gaps:
- 177
Alignment
Query 1 ATGG---------AAGC---------ACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAG-AACAGCTATTCCACGAGA 55
|||| |||| |||| ||||| ||| |||.|||
Sbjct 1 ATGGTTAATGTGAAAGCCCTTTGTGAACCT------GAAGT-----------GAGCAACTGCT----------- 46
Query 56 GGATCCGCGAGTGT-ATTATATCAACA--CTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCC----- 121
|||| ||.||| ||||.....||| | |||||.| ||.| ||||||.|.|...|||||
Sbjct 47 GGAT----GAATGTCATTACGGGCACAGGC-TCTGTGT-CATC--------TCCTCTCCTAGTGCTTCCACAGC 106
Query 122 --TGACCCG----CTTCAAGAAGCCTGCTGAGTTCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATT 189
.||||.| ||.|..||.|.|||..|| || |.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 CAGGACCAGAGACCTCCCTGATGACTGGGGA----AC--CTGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATT 174
Query 190 GCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAG 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 GCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATTGCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAG 248
Query 264 CAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCT 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 CAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTACTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCT 322
Query 338 GGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCT 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 GGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCCTCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCT 396
Query 412 GAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCAC 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 GAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTGGGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCAC 470
Query 486 TCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCT 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 TCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATCAGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCT 544
Query 560 ATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTG 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 ATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCTACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTG 618
Query 634 TGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGA 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 TGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCCGTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGA 692
Query 708 CCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCT 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 CCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGAGGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCT 766
Query 782 GCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTG--- 852
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 GCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGGT 840
Query 853 -------------------------------------------------------------------------- 852
Sbjct 841 ATGTGGCTTCGTAGGGCTTGGGATACCTGGGTTTCCCCAAGGAGAGTAGCCCCTGGTTCCAGGTGCTTGCTGAC 914
Query 853 -------------------GAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTA 907
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 AGCCTCCCATCCCTGCACAGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTA 988
Query 908 TGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGAT 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 989 TGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGAT 1062
Query 982 GAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCTCCAAGCTGGGCTCCTTTGG 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 GAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCTCCAAGCTGGGCTCCTTTGG 1136
Query 1056 TGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCT 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 TGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCT 1210
Query 1130 TCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTC 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 TCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTC 1284
Query 1204 CTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACG 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 CTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACG 1358
Query 1278 CTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTC 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 CTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTC 1432
Query 1352 TGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCC 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 TGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCC 1506
Query 1426 GTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 GTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG 1548