Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15923
• Subject: XM_005271615.3
• Aligned Length: 1476
• Identities: 890
• Gaps: 585

Alignment

Query    1  ATGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCCCATGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct    1  ATGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCG-------------------------------------  37

Query   75  GACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGGTTGTCC  148
                                                                                      
Sbjct   38  --------------------------------------------------------------------------  37

Query  149  TCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAGCAGCTG  222
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   38  ---TCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAGCAGCTG  108

Query  223  TGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGGGCCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  TGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGGGCCTGC  182

Query  297  AGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGTTCTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  AGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGTTCTCTG  256

Query  371  CCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAACCCACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  CCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAACCCACT  330

Query  445  TTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGAGCTTCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  TTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGAGCTTCG  404

Query  519  CATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGAAGAGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  CATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGAAGAGCC  478

Query  593  TGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATCCAGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  TGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGTGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATCCAGTAC  552

Query  667  GACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTTCAGGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  GACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTTCAGGAA  626

Query  741  ACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGGCTGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  ACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGGCTGTGG  700

Query  815  CCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTGCAGTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTGCAGTTC  774

Query  889  CCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGCCACCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  CCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGCCACCCC  848

Query  963  ACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGG-------------------------------  1005
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  849  ACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGGCGTCAG  922

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct  923  TCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATGATGTGT  996

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct  997  GCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATCTGACCA  1070

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1071  GTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGTTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACACCAAGG  1144

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1145  TCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGATAGAACTATTCAGAGAAGCTGTAACTCCCCAGGG  1218

Query 1006  --------------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                      
Sbjct 1219  ACAGGTCTTGTGATTCAGCAACCAGCTGTACCGCTGATGGAGCTACGGTCAGCTCGGCACACACATCGCCTGAC  1292

Query 1006  ----------------------------------------------------------------------  1005
                                                                                  
Sbjct 1293  CACCTGTGTTTGCTTTCTCTCATTCCCTGCCTTACAGCCCCTGTCCCCCTTATGCCCATTTCCCTGGGAT  1362