Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15959
• Subject: XM_017011180.1
• Aligned Length: 1536
• Identities: 1214
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCTGTAGGACCCCAGCATCCATCGTTTAAAAGAAGTTCTCTGGACACTTTCCACGGGTGTTGTCAGCAGCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAAACTGGAGCTCTCCCGTGGGACACAGACACCAAGCGCTGGAGGCCGGAGCTGAACTGGGATCTTGTGTGTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATAATGCCTGGAAGGTCCATATCGCTAAGTTCTCCTTACTGGTTGGATTAATCTTTGGCTACCTAATAACTGGA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGCATTGCTGACTGGGTCGGCCGGCGGCCTGTGCTGCTGTTTTCCATCATCTTCATTCTGATCTTTGGACTGAC  296

Query    1  -------------------------ATGTTCAGCACACTCAGGTTCTTTGAAGGATTTTGCCTGGCTGGAATCA  49
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGGCACTGTCAGTGAATGTGACAATGTTCAGCACACTCAGGTTCTTTGAAGGATTTTGCCTGGCTGGAATCA  370

Query   50  TTCTCACCTTGTATGCTTTACGAATAGAGCTGTGCCCCCCTGGAAAACGGTTCATGATTACGATGGTGGCGAGC  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTCACCTTGTATGCTTTACGAATAGAGCTGTGCCCCCCTGGAAAACGGTTCATGATTACGATGGTGGCGAGC  444

Query  124  TTCGTGGCCATGGCGGGCCAGTTCCTCATGCCTGGGCTAGCCGCCCTGTGCCGGGATTGGCAGGTGCTGCAGGC  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCGTGGCCATGGCGGGCCAGTTCCTCATGCCTGGGCTAGCCGCCCTGTGCCGGGATTGGCAGGTGCTGCAGGC  518

Query  198  CCTCATCATCTGCCCCTTCCTGCTCATGCTGCTCTACTGGTCGATATTCCCCGAGTCCCTCCGGTGGCTAATGG  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCATCATCTGCCCCTTCCTGCTCATGCTGCTCTACTGGTCGATATTCCCCGAGTCCCTCCGGTGGCTAATGG  592

Query  272  CCACCCAGCAGTTTGAGTCTGCAAAGAGGCTGATCCTCCACTTCACACAGAAGAATCGCATGAACCCTGAGGGC  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCCAGCAGTTTGAGTCTGCAAAGAGGCTGATCCTCCACTTCACACAGAAGAATCGCATGAACCCTGAGGGC  666

Query  346  GACATCAAGGGTGTGATACCAGAGCTGGAGAAAGAGCTTTCCCGGAGGCCCAAGAAGGTCTGCATCGTGAAGGT  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACATCAAGGGTGTGATACCAGAGCTGGAGAAAGAGCTTTCCCGGAGGCCCAAGAAGGTCTGCATCGTGAAGGT  740

Query  420  GGTGGGGACACGGAACCTGTGGAAGAACATTGTGGTCCTGTGTGTGAACTCGCTGACGGGGTACGGGATCCACC  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGGGGACACGGAACCTGTGGAAGAACATTGTGGTCCTGTGTGTGAACTCGCTGACGGGGTACGGGATCCACC  814

Query  494  ACTGCTTTGCCAGGAGCATGATGGGCCACGAGGTGAAGGTGCCGCTCCTGGAGAACTTCTATGCTGACTACTAT  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTGCTTTGCCAGGAGCATGATGGGCCACGAGGTGAAGGTGCCGCTCCTGGAGAACTTCTATGCTGACTACTAT  888

Query  568  ACCACGGCCAGCATCGCGCTGGTGTCCTGCCTGGCCATGTGCGTGGTGGTCCGATTCCTCGGGCGCAGGGGAGG  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCACGGCCAGCATCGCGCTGGTGTCCTGCCTGGCCATGTGCGTGGTGGTCCGATTCCTCGGGCGCAGGGGAGG  962

Query  642  GCTGCTGCTCTTCATGATCCTCACCGCCCTGGCCTCGCTCCTGCAGCTCGGCCTCCTCAACCTGATTGGAAAGT  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCTGCTCTTCATGATCCTCACCGCCCTGGCCTCACTCCTGCAGCTCGGCCTCCTCAACCTGATTGGAAAGT  1036

Query  716  ACAGCCAGCACCCAGACTCAGGGATGAGTGACAGCGTCAAGGACAAATTTTCCATCGCGTTTTCCATCGTGGGC  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAGCCAGCACCCAGACTCAGGGATGAGTGACAGCGTCAAGGACAAATTTTCCATCGCGTTTTCCATCGTGGGC  1110

Query  790  ATGTTTGCCTCCCATGCGGTGGGGAGCCTCAGCGTGTTCTTCTGTGCGGAGATCACCCCGACGGTGATAAGGTG  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGTTTGCCTCCCATGCGGTGGGGAGCCTCAGCGTGTTCTTCTGTGCGGAGATCACCCCGACGGTGATAAGGTG  1184

Query  864  TGGCGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCCAGCGCGGGCTTCGGCATGCTGACGGCACCCATCATCGAGCTGCACAACC  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGCGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCCAGCGCGGGCTTCGGCATGCTGACGGCACCCATCATCGAGCTGCACAACC  1258

Query  938  AGAAAGGCTACTTCCTGCACCACATCATCTTTGCCTGCTGCACGCTCATCTGCATCATCTGCATCCTCCTGCTG  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAAAGGCTACTTCCTGCACCACATCATCTTTGCCTGCTGCACGCTCATCTGCATCATCTGCATCCTCCTGCTG  1332

Query 1012  CCCGAGAGCAGGGACCAGAACCTGCCTGAGAACATTTCTAACGGGGAGCACTACACGCGCCAGCCGCTGCTGCC  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCGAGAGCAGGGACCAGAACCTGCCTGAGAACATTTCTAACGGGGAGCACTACACGCGCCAGCCGCTGCTGCC  1406

Query 1086  GCACAAGAAGGGGGAGCAGCCACTGCTGCTCACCAACGCCGAGCTCAAGGACTACTCGGGCCTCCACGATGCCG  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCACAAGAAGGGGGAGCAGCCACTGCTGCTCACCAACGCCGAGCTCAAGGACTACTCGGGCCTCCACGATGCCG  1480

Query 1160  CAGCCGCGGGTGACACACTGCCCGAGGGTGCCACGGCCAACGGCATGAAGGCCATG  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGCCGCGGGTGACACACTGCCCGAGGGTGCCACGGCCAACGGCATGAAGGCCATG  1536