Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15988
• Subject: NM_001282684.1
• Aligned Length: 968
• Identities: 733
• Gaps: 232

Alignment

Query   1  ---------------------ATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  53
                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCAGACGCCGCGGCCGGCGATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  74

Query  54  CACAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  127
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CGCAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  148

Query 128  GCCGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  201
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GCCGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  222

Query 202  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  275
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  296

Query 276  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  349
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  370

Query 350  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCACGTGTACCGCGTGCTGCAG  423
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCACGTGTACCGCGTGCTGCAG  444

Query 424  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCCACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  497
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCCACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  518

Query 498  CGGCTCCTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  571
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CGGCTCCTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  592

Query 572  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  645
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  666

Query 646  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAG----GTG  715
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || 
Sbjct 667  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAGCCCAGT-  739

Query 716  CA------------GCCAACC----------CCCA---------------------------GGAGGATGATTG  740
           ||            ||.||||          ||||                           |||||    ||.
Sbjct 740  CATCTCAGGATCCCGCTAACCTTTTCTCCCTCCCACCACTGCCTCCTCCTCCGCTTCCCGCTGGAGG----TTC  809

Query 741  C-------------------------------------------------------------------------  741
           |                                                                         
Sbjct 810  CCGTCCGCACCCTCTCAGACCTGAGGCTGAGCTTGCAGTGAGGGCTTCTCCTCGGCCCCTCGCCCGCCCCCAGA  883

Query 742  --------------------------------------------------------------------------  741
                                                                                     
Sbjct 884  GCTGCCATCCCTGCTGTTACAAGCCAGAGGCACCCGGATGTGAGGCCCCAGATCACCTCCAGGGACTTGGGGTT  957

Query 742  ------  741
                 
Sbjct 958  CCCATC  963