Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15988
• Subject: NM_001289672.1
• Aligned Length: 780
• Identities: 572
• Gaps: 144

Alignment

Query   1  ---------------------ATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  53
                                |||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.|
Sbjct   1  ATGCAGACAACGCGGCCGGCGATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCACCGGTGGGGGCGGGCGGCCGCCC  74

Query  54  CACAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  127
           |...||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  75  CGGGGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTGAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGCCAGACGCTGT  148

Query 128  GCCGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  201
           |.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 149  GTCGGGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGTCAGGGCGAAGAGCTTCAATCGGACAGGGATGAGACCGGG  222

Query 202  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  275
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||..|||||||
Sbjct 223  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAATTTCCTCAGGCATGGAAAATTGGTGCT  296

Query 276  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  349
           |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 297  GGACAAGGACATGGCCGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCAGAGTTCTACAACATTGGTCCTCTGATTCGAATCA  370

Query 350  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCACGTGTACCGCGTGCTGCAG  423
           ||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||..|||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 371  TCAAAGACAGGATGGAGGAGAAAGACTACACAGTGGCCCAGGTGCCACCTAAGCATGTATACCGAGTGCTGCAG  444

Query 424  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCCACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  497
           |||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGCCAAGAGGAGGAGCTCACACAGATGGTATCCACTATGTCCGACGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  518

Query 498  CGGCTCCTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  571
           ||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.
Sbjct 519  CGGCTCCTCCTACAACTATGGGAGTGAGGACCAGGCCGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCTAAGGAGCTCCACAGCT  592

Query 572  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGG-------------AG----GAGCAGC  628
           |||||.||||.||||||||.|||||||..|||||..|||||..|.|.|             ||    .|||  |
Sbjct 593  CCCCACACGGCCTGAGCTCCGAGTCCACTCGCAAGGCCAAGGTCCCTGTCCGCACCCTCCCAGACCCAAGC--C  664

Query 629  TGGAGGAGC-AGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGC  701
           |    |||| .||||                                                           
Sbjct 665  T----GAGCTTGCAG-----------------------------------------------------------  675

Query 702  ACAGGAGAAAGGTGCAGCCAACCCCCAGGAGGATGATTGC  741
                                                   
Sbjct 676  ----------------------------------------  675