Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15988
• Subject: XM_005261744.2
• Aligned Length: 953
• Identities: 729
• Gaps: 220

Alignment

Query   1  ---------------------ATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  53
                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCAGACGCCGCGGCCGGCGATGAGGATGGAGGCCGGGGAGGCAGCGCCGCCGGCGGGGGCGGGCGGCCGCGC  74

Query  54  CACAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  127
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CGCAGGCGGCTGGGGCAAGTGGGTGCGGCTCAACGTGGGGGGCACGGTGTTCCTGACCACCCGGCAGACGCTGT  148

Query 128  GCCGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  201
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GCCGCGAGCAGAAGTCCTTCCTCAGCCGCCTGTGCCAGGGGGAAGAGCTGCAGTCGGACCGGGATGAGACCGGG  222

Query 202  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  275
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCCTACCTCATTGACCGTGACCCCACCTACTTCGGGCCCATCCTGAACTTCCTCCGGCATGGCAAGCTGGTGCT  296

Query 276  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  349
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GGACAAGGACATGGCTGAGGAGGGGGTCCTGGAGGAAGCCGAGTTCTACAACATCGGCCCGCTGATCCGCATCA  370

Query 350  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCACGTGTACCGCGTGCTGCAG  423
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TCAAAGACCGGATGGAAGAGAAGGACTACACGGTCACCCAGGTCCCACCCAAGCACGTGTACCGCGTGCTGCAG  444

Query 424  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCCACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  497
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGCCAGGAGGAGGAGCTCACGCAAATGGTCTCCACCATGTCTGATGGCTGGCGCTTCGAGCAGCTGGTGAACAT  518

Query 498  CGGCTCCTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  571
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CGGCTCCTCCTACAACTACGGCAGCGAGGACCAGGCAGAGTTCCTGTGTGTGGTGTCCAAGGAGCTCCACAGCA  592

Query 572  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  645
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CCCCAAACGGGCTGAGCTCAGAGTCCAGCCGCAAAACCAAGAGCACGGAGGAGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCAG  666

Query 646  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAGGTG----  715
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||    
Sbjct 667  CAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAACAGGTGCAGGTGGAGGCAGATGCACAGGAGAAAGCTGTTAC  740

Query 716  CAGCCA-----ACCCCCAGGAGGATGATTGC-------------------------------------------  741
           .|||||     ||||      |||||  ||.                                           
Sbjct 741  AAGCCAGAGGCACCC------GGATG--TGAGGCCCCAGATCACCTCCAGGGACTTGGGGTTCCCATCTGAAAT  806

Query 742  --------------------------------------------------------------------------  741
                                                                                     
Sbjct 807  CCTTTATTTTTGTACCATGGGGTGGGCCCCGGGCCTGAGAAGGAAGAAGCACCCTCTCCCCGGCCTCCTCTGTC  880

Query 742  -----------------------------------------------------------------  741
                                                                            
Sbjct 881  TGCACCCGTGGGGCTGTGACTTACTCCTGCCTCCAGGGGCGGGGCGGGGCCCCCCTGGGACCTCT  945